神经发育障碍伴癫痫发作,言语和步行障碍;脱氧核糖核酸聚合酶

乔等(1995)指出异常的氨基酸hysupsine在翻译后形成,并且仅在单个细胞蛋白,真核翻译起始因子-5A(EIF5A;600187)中发现。酪氨酸的生物合成涉及2个酶促步骤。第一步,脱氧苏氨酸合酶(EC 2.5.1.46)催化NAD依赖的亚精胺丁胺部分转移至EIF5A前体蛋白的特定赖氨酸残基的ε-氨基,形成中间的脱氧苏氨酸残基。在第二步中,由脱氧羟丝氨酸羟化酶(611262),将脱氧苏氨酸残基转化为苏氨酸残基完成EIF5A的成熟。在所有真核生物和某些古细菌中都发现有酪氨酸,但在真细菌中却没有。EIF5A的氨基酸序列是高度保守的,尤其是在苏氨酸残基周围的区域,这表明该蛋白在整个真核生物进化过程中都具有重要的基本功能。Hypusine和EIF5A对于真核生物的细胞增殖似乎至关重要。

细胞遗传学位置:19p13.13
基因座标(GRCh38):19:12,672,469-12,681,879

Gene-Phenotype Relationships
Location Phenotype Phenotype
MIM number
Inheritance Phenotype
mapping key
19p13.13 Neurodevelopmental disorder with seizures and speech and walking impairment 618480 AR 3

▼ 克隆和表达
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乔等(1995)从人HeLa细胞文库中分离出编码脱氧苏氨酸合酶的cDNA克隆。分离出编码369个氨基酸的蛋白质的全长cDNA克隆(计算分子量为40,970 Da)和一个较短的cDNA克隆(可能编码一个内部缺失56个氨基酸的蛋白质)。推导的人酶氨基酸序列与酵母酶具有高度同一性。

来自人外周血单核细胞cDNA文库的Bevec等(1996)分离了2个孤立序列,它们编码生物活性的脱氧苏氨酸合酶。DNA序列分析预测分子量为41,055 Da的369个氨基酸。

通过数据库分析,Su等(2012年)确定了DHPS的3个剪接变体。

▼ 基因功能
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Bevec等(1996)证明重组DHPS在体外转录和翻译以及在大肠杆菌中表达后,在合成脱氧hysupsine中显示出显着的催化活性。

豪伯等(2005)证明实验药物CNI-1493抑制DHPS或RNA干扰有效地抑制了逆转录病毒在细胞培养和原代细胞中的复制,而没有可测量的药物诱导的对细胞周期转变,凋亡或一般细胞毒性的不利影响。他们表明,CNI-1493的抗病毒作用是由于对HIV-1 Rev调节蛋白的抑制作用,为此,需要酪氨酸的EIF5A是辅因子。

Su等(2012)发现DHPS和WDR83(616850)mRNA在其3个主要的UTR中以尾到尾的方式重叠,包括113个显示出完全互补性的核苷酸。全长DHPS mRNA或其分离的3-prime UTR区可稳定WDR83 mRNA和蛋白质表达。同样,全长WDR83 mRNA或其分离的3-prime末端稳定了DHPS mRNA和蛋白质表达。通过小的干扰RNA耗尽WDR83或DHPS会降低M803胃癌细胞中其他转录物的表达。抑制和过度表达研究表明WDR83和DHPS均参与调节转录调节因子E2F1(189971)和激动剂刺激的ERK信号传导。减少WDR83或DHPS抑制MGC803细胞增殖。相反,WDR83或DHPS的过表达增强细胞增殖,而两者的过表达则进一步提高细胞增殖。实时定量PCR和数据库分析检测到WDR83和DHPS在胃癌和其他几种肿瘤类型中的过表达。

▼ 演变
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Su等(2012)发现WDR83和DHPS的直系同源物在真核生物中广泛表达,但这些基因仅在四足动物的相同基因座中发现。在四足动物中,基因的3个主要末端重叠并形成有义/反义对。

▼ 基因结构
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Su等(2012)报道了DHPS基因有9个外显子,跨度约5 kb。WDR83和DHPS基因在其3个主要末端重叠,并从相反的链转录。

▼ 测绘
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Bevec等人使用一组啮齿动物/人类细胞杂种(1996)将DHPS基因定位于人19号染色体(1996年),利用荧光原位杂交分析,结合体/人/啮齿动物易位杂交分析,将DHPS基因定位到19p13.12-p13.11。

Su等(2012)报道了DHPS基因对应到染色体19p13.13。

▼ 分子遗传学
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Ganapathi等在欧洲血统的4个无关家庭中有神经发育障碍,癫痫发作和言语和步行障碍的5名患者中(NEDSSWI; 618480)(2019)在DHPS基因(鉴定化合物杂合突变600944.0001 - 600944.0004)。所有患者均携带杂合N173S错义变体(600944.0001)在一个等位基因上,并且剪接位点突变,框内缺失或点突变破坏了另一个等位基因上的起始密码子。通过外显子组测序发现的突变与家族中的疾病分离。在确定第一个家族后,通过GeneMatcher确定了随后的家族。单倍型分析表明在三个家族中,N173S变异可能是遥远的共同祖先。纯化的酶在大肠杆菌中的体外功能表达研究表明,N173S和Y305_I306del(600944.0003)变体(均影响高度保守的残基)均具有降低的酶活性,这是由于与野生型相比,脱氧hysupsine的生物合成受损,而Y305_I306del变体几乎完全没有酶活性。N173S变体保留了一些部分活性(约占野生型的18%至25%)。这些发现通过对HEK293细胞中eIF5A(600187)的融合作用的进一步研究得到了证实,这两种变体均显着降低了EIF5A(600187),而Y305_I306del的作用更为严重。

▼ 等位基因变异体(4个示例):
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.0001神经发育障碍伴有感觉,言语和步行障碍
DHPS,ASN173SER
在来自4个无关家庭的5例神经发育障碍伴癫痫发作和言语和步行障碍的患者中(NEDSSWI; 618480),Ganapathi等人(2019)确定了DHPS基因中的复合杂合突变。所有患者均在第3外显子上进行了杂合的c.518A-G过渡(c.518A-G,NM_001930.3),导致在一个高度保守的残基上,在一个等位基因反式上的一个asn173-to-ser(N173S)取代。其他等位基因上可能具有破坏性的变异。在其他等位基因上,3例患者(来自家庭1的2位同胞和患者4,来自家庭3的8岁女孩)在内含子8中发生了由G到A的转变(c.1014 + 1G-A;600944.0002) ; 一名7岁女孩(家庭2的患者3)的框内缺失6 bp(c.912_917delTTACAT; 600944.0003)导致高度保守的残基(Tyr305_Ile306del)的缺失;一名24岁妇女(家庭4的5名患者)进行了c.1A-G转换,导致从met1-to-?(M1 ?; 600944.0004) 替代。通过外显子组测序发现的突变,在所有家庭中都与疾病分开。在gnomAD数据库中,除了6 bp缺失(在gnomAD中未发现)外,其他所有基因均处于杂合状态,频率非常低。单倍型分析表明,家庭1、3和4之间存在N173S变体的遥远共同祖先,而家庭2具有不同的单倍型。剪接位点变体被证明引起异常转录产物的产生,如果翻译,该转录产物被预测会在没有酶活性位点的情况下引起过早终止。纯化后的酶在大肠杆菌中的体外功能表达研究表明,与野生型相比,N173S和Y305_I306del变体损害了脱氧hy碱的生物合成,Y305_I306del变体几乎完全没有酶活性。N173S变体保留了一些部分活性(约占野生型的18%至25%)。这些发现已通过进一步研究eIF5A的羟化作用得到了证实(600187)在HEK293细胞中,这两个变体均显着降低,而Y305_I306del的作用更为严重。

.0002神经发育障碍伴有感觉,言语和步行障碍
DHPS,IVS8DS,GA,+ 1
为了讨论DHPS基因中内含子8的内含子8(c.1014 + 1G-A,NM_001930.3)中的G到A过渡,导致剪接位点改变,在患有神经发育疾病的患者中以复合杂合状态存在Ganapathi等人的癫痫发作,言语和步行障碍(NEDSSWI; 618480)(2019),请参阅600944.0001。

.0003神经发育障碍伴有感觉,言语和行走障碍
DHPS,6-BP DEL,912TTACAT
为了讨论DHPS基因中6 bp的读码框内缺失(c.912_917delTTACAT,NM_001930.3),导致产生Tyr305_Ile306del的情况,该结果在患有癫痫发作,语音和步行障碍的神经发育障碍患者中以复合杂合状态存在(NEDSSWI;618480)由Ganapathi等人(2019),请参阅600944.0001。

.0004神经发育障碍伴有感觉,言语和步行障碍
DHPS,MET1?
为了讨论DHPS基因中的c.1A-G过渡(c.1A-G,NM_001930.3),导致翻译起始密码子(met1?)的破坏,该密码子在患者中以复合杂合状态存在Ganapathi等人的神经发育障碍伴有癫痫发作和言语和步行障碍(NEDSSWI; 618480)(2019),请参阅600944.0001。