Tigger 转座子衍生基因 1; TIGD1

HGNC 批准的基因符号:TIGD1

细胞遗传学位置:2q37.1 基因组坐标(GRCh38):2:232,543,882-232,550,556(来自 NCBI)

▼ 说明

DNA 转座子是通过切除和重新整合在基因组中移动的重复元件,无需 RNA 中间体。 Tiggers 是祖先转座子,似乎是人类基因组中几个中等重复频率重复(MER) 的来源。 TIGD1 属于源自跳跳虎的基因家族(Smit 和 Riggs,1996;Dou 等人,2004)。

▼ 测绘

Hartz(2009) 根据 TIGD1 序列(GenBank AK056329) 与基因组序列(build 36.1) 的比对,将 TIGD1 基因对应到染色体 2q37.1。

▼ 进化

跳跳虎转座子

DNA转座子的特征是10至500 bp的末端反向重复序列(TIR),它们编码与TIR结合并催化元件剪切和粘贴的转座酶。 通过在人类基因组中搜索包含 TIR 的重复元件,然后进行数据库分析,Smit 和 Riggs(1996) 确定了 2 个具有编码能力的相关元件,他们将其命名为 Tigger1 和 Tigger2。 推导的Tigger1和Tigger2产物具有48%的氨基酸同一性,并且都与果蝇pogo转座酶相关。 Smit 和 Riggs(1996) 鉴定了基因组中的几个 MER,这些 MER 似乎是由跳跳虎复制产生的。 Tigger1 主要由全长元素表示,而与 Tigger2 相关的大多数元素是部分副本或包含内部删除。