锌指,MYM-4 型; ZMYM4

  • 锌指蛋白 262; ZNF262
  • KIAA0425

此条目中代表的其他实体:

  • 包含细胞死亡抑制 RNA; CDIR,包括

HGNC 批准的基因符号:ZMYM4

细胞遗传学定位:1p34.3 基因组坐标(GRCh38):1:35,268,693-35,422,057(来自 NCBI)

▼ 说明

ZMYM4 包含一个 DUF3504 结构域,与低等生物中存在的 Crypton DNA 转座子的酪氨酸重组酶(YR) 元件相关。 DUF3504 结构域源自 Cryptons 的 YR 元件,但缺乏 YR 活性必需的完整催化四联体。 含有 DUF3504 结构域的蛋白质可充当转录激活子或阻遏子(Kojima 和 Jurka,2011)。

▼ 克隆与表达

Ishikawa 等人通过对从尺寸分级的脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(1997) 克隆了 ZNF262,他们将其命名为 KIAA0425。 推导的蛋白质含有1,224个氨基酸。 RT-PCR 在所有检查的组织中检测到不同的 ZNF262 表达,其中肾脏中的表达最高,脾脏中的表达最低。

通过在 EST 数据库中搜索编码锌指样蛋白的序列,Smedley 等人(1999) 鉴定出 ZNF262。 推导的蛋白质包含 5 个串联的骨髓增殖和智力迟钝(MYM) 基序,这些保守基序与锌结合序列非常相似。 Northern 印迹分析检测到所有检查组织中多种 ZNF262 转录物的可变表达,其中在心脏、骨骼肌、肾脏和肝脏中表达最高。

Shchors 等人通过筛选可抑制干扰素 γ(147570) 诱导的 HeLa 细胞细胞死亡的 cDNA(2002) 获得了一个 441 个核苷酸的 ZNF262 剪接变体,他们称之为 CDIR。 CDIR 仅包含来自全长 6,108 核苷酸 ZNF262 转录物的 3 引物 UTR 的核苷酸 4,416 至 4,856。 CDIR 具有编码假定的 70 个氨基酸肽的短 ORF 和 14 段 3 个或更多连续 U 核碱基,其特征在于富含 U 或 AU 的元件。

Kojima 和 Jurka(2011) 使用数据库分析来鉴定 Crypton 相关蛋白,鉴定出了 ZMYM4。 推导的蛋白质具有中央 MYM 型锌指结构域,随后是富含脯氨酸的区域,以及 C 端 347 个氨基酸的 DUF3504 结构域。 ZMYM4 的 DUF3504 结构域与 ZMYM2(602221) 和 ZMYM3(300061) 的 DUF3504 结构域非常相似。 在脊椎动物中检测到了 ZMYM 蛋白的直系同源物,在脊索动物和无脊椎动物中检测到的距离更远。

▼ 基因功能

肖尔斯等人(2002)表明HeLa细胞中CDIR的表达以剂量依赖性方式抑制干扰素-γ诱导的细胞凋亡。 结构域分析表明,只有全长 CDIR,而不是其分离的 3 引物或 5 引物末端或 ORF,才具有对细胞杀伤的抗性。 突变分析表明,富含 U 的基序 AUUUUC 和 UUUCAUUUU 是这种保护所必需的。 对细胞杀伤的抵抗力伴随着 p21(CDKN1A; 116899) 和 BCL2(151430) mRNA 和蛋白质水平的升高。 体外 RNA 蛋白结合测定和蛋白质印迹分析表明,HSP27(HSPB1;602195) 和 AUF1(HNRNPD;601324) 的所有亚型是结合 CDIR 的蛋白复合物的组成部分。 重组蛋白的使用表明,AUF1(而非 HSP27)直接结合 CDIR。 用另一个 AUF1 靶标(MYC(190080) 的 3-prime UTR)转染 HeLa 细胞,也能抑制干扰素 γ 诱导的细胞杀伤,但抑制方式有限。 肖尔斯等人(2002)得出结论,CDIR的抗凋亡作用是由于CDIR隔离AUF1,导致p21和BCL2的水平和活性升高。

▼ 测绘

Smedley 等人利用荧光原位杂交和基因组序列分析(1999)和索哈尔等人(1999) 将 ZNF262 基因孤立定位到染色体 1p34-p32。

▼ 进化

Kojima 和 Jurka(2011) 确定果蝇 Woc 的祖先基因和哺乳动物 ZMYM 基因起源于 9.1 亿多年前所有两侧对称动物的共同祖先,并且代表了已知的第三古老的转座子驯化事件,仅次于产生 TERT(187270) 和 PRP8(607300) 的转座子驯化事件。 ZMYM2、ZMYM3 和 ZMYM4 基因是在脊椎动物早期进化过程中(无颌类和有颌类脊椎动物分裂之前)的 2 轮全基因组复制过程中从单个基因复制而来的。