胶原蛋白,XXIV 型,α-1; COL24A1

胶原蛋白,XXIV 型,α-1; COL24A1HGNC 批准的基因符号:COL24A1

细胞遗传学定位:1p22.3 基因组坐标(GRCh38):1:85,728,506-86,156,986(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

通过EST数据库检索,Koch等人(2003) 鉴定出与 α-1 V 型胶原 C 末端三分之一同源的序列(COL5A1; 120215)。 他们使用基于 PCR 的策略,从胎盘 cDNA 文库中克隆了一种新型人类胶原蛋白,命名为 COL24A1。 推导的蛋白质包含一个 38 个氨基酸的信号肽、一个 544 个氨基酸的 N 肽结构域、一个 931 个氨基酸的三螺旋区域(具有无脊椎动物胶原蛋白的一个不完美的 4 个氨基酸插入特征)和一个 235 个氨基酸的 C 前肽。 推导的 N 肽结构域包含血小板反应蛋白 N 末端样(TSPN) 基序,该基序与 COL5A1 和 COL11A1(120280) 的 TSPN 基序具有 27.3% 的序列同一性。 其C-前肽结构域含有8个半胱氨酸,与COL5A1的C-前肽结构域有28.4%的同一性。 COL24A1 N 肽序列包含原纤维直径调节原纤维胶原链的保守序列特征的同源物。 预计 COL24A1 在处理后会保留 N 肽。 Koch 等人使用成人组织的 RT-PCR(2003) 证明小鼠 Col24a1 是一种不丰富的胶原蛋白,在骨骼和视网膜中表达,在角膜、皮肤和肌腱中表达较少。

▼ 基因功能

Koch 等人使用原位杂交(2003) 确定小鼠 Col24a1 在胚胎第 15 天首次在头部和附肢骨骼的新兴骨骼元件中检测到。在胚胎后期阶段在角膜、耳囊和骨骼中检测到表达,其中表达与初级骨化中心和 I 型胶原高表达位点的形成一致。 科赫等人(2003) 得出结论,Col24a1 是胚胎骨形成的标志物,可能在调节 I 型胶原纤维生成中发挥作用。

▼ 基因结构

科赫等人(2003)确定COL24A1基因包含49个外显子。

▼ 测绘

国际辐射混合测绘联盟将 COL24A1 基因测绘到 1 号染色体(SHGC-75097)。