RAS 相关蛋白 RAB40A 样; RAB40AL

  • RAS样GTP酶基因;RLGP

HGNC 批准的基因符号:RAB40AL

细胞遗传学位置:Xq22.1 基因组坐标(GRCh38):X:102,937,271-102,938,299(来自 NCBI)

▼ 克隆和表达

Saito-Ohara 等人(2002) 鉴定了 RAB40AL 基因,该基因与酵母 Sec4 基因具有高度同源性,并编码一种假定的小鸟嘌呤蛋白,作者将其称为 RLGP(Ras 样 GTP 酶)。免疫细胞化学将 RAB40AL 定位于线粒体。

贝多扬等人(2012)发现RAB40AL在人脑和肾脏中表达。胎儿肺、心脏、肝脏和骨骼肌中的表达似乎低于成人组织中的表达。

▼ 测绘

Saito-Ohara 等人的地图(2002) 在 X 染色体中心倒位的 Xq22.2 断点处鉴定出 RAB40AL 基因。

▼ 进化

Bedoyan 等人(2012) 在灵长类动物(如恒河猴和黑猩猩)中鉴定出 RAB40AL 直系同源物,但在狗、大鼠、小鼠、非洲爪蟾或斑马鱼中未鉴定出 RAB40AL 直系同源物。核苷酸和蛋白质分析表明,小鼠 Rab40b 与人类 RAB40AL 表现出最高的同一性(83%) 和相似性(91%);然而,小鼠 11 号染色体上的 Rab40b 的直系同源物是人类 17 号染色体上的 RAB40B(619550)。人类 RAB40A(301065) 显示出与 RAB40AL 99% 的蛋白质同一性和相似性。RAB40A 与 X 染色体上的 RAB40AL 相比,端粒长约 560 kb,两侧是重复序列。RAB40AL 对灵长类动物的明显限制表明最近的进化分歧,并且与 RAB40AL 在神经发育中的假设功能作用一致。

▼ 细胞遗传学

斋藤大原等人(2002) 研究了一名患有杜氏肌营养不良症(310200)、严重智力低下、手足徐动症和眼球震颤的 16 岁患者,该患者被证明存在 X 染色体 46,Y,inv(X)(p21.2q22.2) 的中心周倒位。他的母亲在一个等位基因上携带了这种倒位。患者的病情最初被误诊为脑瘫。由于 DMD 基因(肌营养不良蛋白;300377)位于 Xp21.2,这是 inv(X) 的一个断点,并且由于其缺陷很少与严重智力低下相关,因此该患者的其他临床特征被认为可能与 Xq22 上的相反断点有关。两个断点的分子细胞遗传学特征揭示了 3 个可能对神经肌肉和认知发育产生灾难性影响的遗传事件:Xp21.2 处 DMD 基因的部分缺失、Xq22.2 处蛋白脂质蛋白基因(PLP1;300401)的重复以及 RAB40AL 基因的破坏。斋藤大原等人(2002) 推测 RAB40AL 的破坏是导致患者严重智力低下的原因。

▼ 分子遗传学

有关 Martin-Probst 综合征(MRXSMP; 300519) 与 RAB40AL 基因变异之间可能关联的讨论,请参见 300405.0001。

▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):

.0001 重新分类 - 意义未知的变异体
RAB40AL、ASP59GLY
该变异体以前名为 MARTIN-PROBST 综合征,现已根据 Oldak 等人的研究结果重新分类(2014)。

在患有 Martin-Probst 综合征(MRXSMP;300519)的 2 名受影响男性中,Bedoyan 等人(2012) 鉴定出 RAB40AL 基因中的 AC-GA 变化,导致 GTPase 结构域内 2 个假定的 β 链之间的环区域中高度保守的残基发生 asp59 到甘氨酸(D59G) 的取代。该变体是通过大规模并行测序鉴定的。与野生型相比,在 COS-7 细胞中转染变异蛋白会导致蛋白检测量减少,表明该蛋白存在不稳定和降解。变异蛋白表现出异常定位,积聚在细胞核或核周区域,而不是细胞质。所有具有偏向 X 失活的专性和非专性女性家庭成员都是该变异的杂合子,

李等人(2014) 在一名 20 岁男性中发现了半合子 D59G 变异,患有严重智力低下、中枢肌张力减退、周围痉挛性四肢瘫痪、癫痫发作、视神经萎缩和听力损失。其他特征包括体温不稳定的自主神经功能障碍、身材矮小和睾丸未降。畸形特征轻微,包括鼻根宽、颧骨发育不全和下唇饱满。李等人(2014) 得出的结论是,该患者的表型与极其严重的 MRXSMP 形式一致。

奥达克等人(2014) 在 2 名没有 MRXSMP 的无关男性中发现了半合子 D59G 变异。这些变异是在对这些患者进行全外显子组测序时发现的不相关表型,并且不与任一家族的表型分离。随后的人群研究在 405 名波兰男性对照中的 8 名和 405 名波兰女性对照中的 12 名中发现了 D59G 变异,频率为 2.47%。奥达克等人(2014) 得出结论,D59G 变体是一种多态性,与 MRXSMP 无关。

奥达克等人(2014) 指出,c.176_177delACinsGA 变体预计会导致密码子 59(D59G) 处的天冬氨酸被甘氨酸(GAC-GGA) 取代,也可被描述为与 c.177C-A 颠换(rs138133927) 共存的 c.176A-G 转变(rs145606134)。