泛素蛋白连接酶 E3 成分 N-识别 7; UBR7

HGNC 批准的基因符号:UBR7

细胞遗传学位置:14q32.12 基因组坐标(GRCh38):14:93,207,255-93,229,214(来自 NCBI)

▼ 描述

UBR7 基因编码一种推定的 E3 连接酶,该酶充当 N 识别蛋白,用于降解具有不稳定残基的底物。蛋白质降解的 N 端规则途径使用不稳定的 N 端残基,这些残基作为降解信号或 N-降解决定子的重要组成部分,以靶向蛋白质进行泛素化和蛋白酶体降解。N-降解决定子存在于短寿命的蛋白质中,或者可以通过对其他稳定的蛋白质进行特定的 N-末端修饰来产生。UBR7 预计是几种泛素 E3 连接酶之一,可将泛素链连接到含有 N-降解决定子的蛋白质上(Tasaki 和 Kwon 评论,2007)。

▼ 克隆和表达

Tasaki 和 Kwon(2007) 在他们的评论中指出,哺乳动物 UBR7 是一种 50-kD 的蛋白质,具有 N 端 UBR 结构域和 C 端植物同源结构域(PH) 指。

▼ 测绘

Hartz(2011) 根据 UBR7 序列(GenBank AK001345) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 UBR7 基因对应到染色体 14q32.12。

▼ 基因功能

使用邻近标记和蛋白质组分析,Zhang 等人(2019) 在模型植物本塞姆氏烟草中,鉴定出 Ubr7 是由 N 介导的免疫调节剂,N 是一种核苷酸结合的富含亮氨酸重复序列(NLR) 免疫受体。本塞姆氏烟草的 Ubr7 与 N 蛋白的 TIR 结构域相互作用并调节其稳定性,从而负向调节 N 介导的烟草花叶病毒(TMV) 防御。TMV效应子p50通过破坏Ubr7和N蛋白之间的相互作用来增强N的稳定性并诱导对TMV的抗性。

▼ 分子遗传学

Li 等人对来自 6 个不相关家庭的 7 名患有 Li-Campeau 综合征(LICAS; 619189) 的患者进行了研究(2021)鉴定了UBR7基因中的纯合或复合杂合突变(参见例如613816.0001-613816.0006)。这些突变是通过外显子组或基因组测序发现的,与家族中的疾病分开。这些突变包括 2 个移码、1 个无义、2 个剪接位点、1 个错义和一个基因内缺失。gnomAD 数据库(v2.1.1) 中除 1 之外均不存在;例外是在 gnomAD 中仅在 1 个等位基因中发现了移码。尽管没有进行具体的功能研究,但预计所有突变都会导致功能丧失。来自 3 名患者的细胞显示 UBR7 蛋白缺失。C 中直系同源基因的敲低。

▼ 等位基因变异体(6 个选定示例):.

0001 LI-Campeau 综合征
UBR7、GLU13TER
在一名患有 Li-Campeau 综合征(LICAS; 619189) 的 9 岁男孩(P1) 中,Li 等人(2021) 鉴定了 UBR7 基因中的复合杂合功能丧失突变:c.37G-T 颠换(c.37G-T,NM_175748.4),导致 glu13-to-ter(E13X)取代,以及 2 bp 重复(c.564_565dup;613816.0002),预计会导致移码和提前终止( Cys189PhefsTer14)。通过外显子组测序发现的突变与家族中的疾病分离。E13X 不存在于 gnomAD 数据库(v2.1.1) 中,而在 209,572 个等位基因中的 1 个中发现了移码。患者来源的类淋巴母细胞显示 UBR7 蛋白缺失。

.0002 LI-CAMPEAU 综合征
UBR7, 2-BP DUP, NT564
用于讨论 UBR7 基因中的 2-bp 重复(c.564_565dup, NM_175748.4),预计会导致移码和提前终止(Cys189PhefsTer14),该重复在 Li-Campeau 综合征(LIC) 患者的复合杂合状态中发现AS;619189),作者:Li 等人(2021),参见 613816.0001(在 Li 等人(2021) 的文章中,该突变也被列为 c.563_564insTT,导致相同的移码。)

.0003 李坎波综合症
UBR7, IVS6AS, AG, -2
在一名患有 Li-Campeau 综合征(LICAS; 619189) 的 3.9 岁男孩(P3) 中,他的父母为非近亲结婚,Li 等人(2021) 鉴定了 UBR7 基因中的复合杂合功能丧失突变:外显子 6(c.496-2A-G, NM_175748.4) 剪接受体位点处的 A 到 G 转变,被证明会导致剪接位点改变和外显子 6 的跳过,以及包含外显子 1-10(613816.0004) 的基因内缺失,最后一个外显子。这些突变是通过基于三重体的外显子组测序发现的,与家族中的疾病分开。它们不存在于 gnomAD 数据库(v2.1.1) 中。对患者成纤维细胞的分析显示 UBR7 蛋白丢失,表明剪接位点突变受到无义介导的 mRNA 衰减的影响。

.0004 li-campeau综合征
UBR7,EX1-10DEL
,供讨论包括外显子1-10(CHR14.93,660,388_93,690,906del,grch37,grch37)的UBR7基因中的UBR7基因,该基因在复合杂型杂质的LI-CYTEN中发现了Li-Cyn的Li-Cyn 18 Li-cyn li-cyn and li-cyn and li-cnnyn and li-cnnyn and li-cnnyn and li-cyn and li-cyn and li cynns and and li cyns inn and li cynn and li cyns的liby 9 eTn11(2021),参见 613816.0003。

.0005 LI-CAMPEAU 综合征
UBR7,1-BP DEL,618T
2 个无血缘关系的男孩(P4 和 P5),均由沙特阿拉伯血统的近亲父母出生,患有 Li-Campeau 综合征(LICAS;619189),Li 等人(2021) 在 UBR7 基因中发现了一个纯合 1-bp 缺失(c.618delT, NM_175748.4),预计会导致移码和提前终止(Glu207ArgfsTer12)。通过基因组测序发现的这种突变在两个家族中都与疾病分离。它不存在于 gnomAD 数据库(v2.1.1) 中。来自 P5 的成纤维细胞显示出 UBR7 蛋白的缺失,这与功能丧失一致。没有对该变体进行功能研究。

.0006 LI-Campeau 综合征
UBR7,c.1186-1G-C
2 名同胞(P6 和 P7),由近亲父母出生,患有 Li-Campeau 综合征(LICAS;619189),Li 等人(2021) 鉴定了 UBR7 基因(c.1186-1G-C, NM_175748.4) 中的纯合 G 到 C 颠换,预计会导致剪接改变。通过外显子组测序发现的突变与家族中的疾病分离。它不存在于 gnomAD 数据库(v2.1.1) 中。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究,但预计该变异会导致功能丧失。