RAP 鸟嘌呤核苷酸交换因子 6; RAPGEF6

  • RAS 相关鸟嘌呤核苷酸交换因子 2; RAGEF2
  • 含有 PDZ 结构域的鸟嘌呤核苷酸交换因子 2; PDZGEF2

HGNC 批准的基因符号:RAPGEF6

细胞遗传学位置:5q31.1 基因组坐标(GRCh38):5:131,423,920-131,635,228(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

通过搜索与 RAGEF1(RAPGEF2; 609530) 相似的序列,然后筛选胎儿脑 cDNA 文库和 5-prime 和 3-prime RACE,Gao 等人(2001) 克隆了 RAPGEF6,他们将其称为 RAGEF2。 推导的 1,509 个氨基酸的蛋白质包含 RAPGEF2 中存在的几个结构域,包括 cNMP 结合、REM、PDZ 和 RA 结构域以及 GEF 催化结构域。 Northern印迹分析检测到约8kb的RAPGEF6转录物,其在心脏、脑、胎盘、肺和肝脏中大量表达,但在骨骼肌、肾和胰腺中几乎检测不到。

库佩里吉等人(2003) 从人脐带和 Jurkat T 细胞 cDNA 文库中克隆了 RAPGEF6 的 2 个剪接变体,他们将其称为 PDZGEF2A 和 PDZGEF2B。 推导的蛋白质分别含有 1,601 和 1,391 个氨基酸,它们在 1,249 个氨基酸之后有所不同。 与 RAPGEF2 一样,PDZGEF2A 含有富含脯氨酸的 C 端和 PDZ 结合基序,而 PDZGEF2B 缺乏这些基序。 与 RAPGEF2 不同,两种 PDZGEF2 同种型都包含第二个不太保守的 N 末端 RCBD(相关环核苷酸结合域)结构域。 Northern 印迹分析检测到大约 9.0 kb RAPGEF6 转录物的普遍表达。

▼ 基因功能

高等人(2001) 发现昆虫细胞中表达的人类 RAPGEF6 对 RAP1A(179520) 和 RAP2A(179540) 表现出 GEF 活性,但对其他 RAS 家族成员没有活性。 RAPGEF6 与激活的 MRAS(608435) 共定位于共转染的 COS-7 细胞的质膜中,导致质膜 RAP1 的 GTP 结合形式增加。 高等人(2001) 得出结论,RAPGEF6 充当质膜中 MRAS 下游 RAP1 和 RAP2 的 GEF。 库佩里吉等人(2003) 证明 RAPGEF2 激活 RAP1 和 RAP2。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Gao 等人(2001) 和 Kuiperij 等人(2003) 将 RAPGEF6 基因定位到 5 号染色体。