IGF1R 反义印迹非编码 RNA

IRAIN 是与 IGF1R 基因( 147370 )重叠的长非编码 RNA(lncRNA),从 IGF1R的内含子启动子以反义方向转录(Sun 等,2014)。

▼ 克隆与表达
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使用 PCR,Sun 等人(2014)将 IRAIN 鉴定为从人类白血病细胞中的 IGF1R 基因位点转录的 5,366 bp lncRNA。进一步分析表明,IRAIN 转录与 IGF1R 发生反义,起源于 IGF1R 内含子 1 中的启动子,并与 IGF1R 的启动子和外显子 1 重叠。等位基因表达分析表明 IRAIN 被印记,父本等位基因表达,母本等位基因被抑制。然而,染色质免疫沉淀分析表明,与许多印迹基因不同,IRAIN 的等位基因表达不受白血病细胞启动子组蛋白甲基化的控制。

▼ 测绘
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孙等人(2014)报道 IRAIN 基因在反义方向上与染色体 15q26.3 上的 IGF1R 基因重叠。

▼ 基因功能
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孙等人(2014)发现 IRAIN 在 IGF1R 启动子区域和白血病 KG-1 细胞的内含子增强子中结合染色质 DNA。IRAIN 与这些区域的结合形成了一个染色体内环,这可能使 IRAIN 积极参与 IGF1R 基因的 2 个远程区域的相互作用。RT-PCR 分析显示 IRAIN 在人类白血病细胞系和造血系统恶性肿瘤中下调。