IMP脱氢酶1

Inosine-5-prime-monophosphate dehydrogenase( EC 1.1.1.205 ) 催化从 IMP 形成单磷酸黄嘌呤(XMP)。在嘌呤从头合成途径中,IMP脱氢酶位于腺嘌呤和鸟嘌呤核苷酸合成的分支点,因此是鸟嘌呤核苷酸从头合成的限速酶。细胞 IMP 脱氢酶活性的抑制导致 DNA 合成的突然停止和 G1-S 界面处的细胞周期阻滞(由Collart 和 Huberman 总结,1988 年)。

▼ 克隆与表达

Collart 和 Huberman(1988)使用针对纯化蛋白的多克隆抗体分离人和中国仓鼠 IMP 脱氢酶 cDNA 克隆。这些克隆的序列显示了一个包含 514 个氨基酸的蛋白质的开放解读码组。产生的蛋白质的分子量为 56 kD,这是观察到的纯化蛋白质和免疫沉淀的体外翻译产物的分子量。人类和中国仓鼠 cDNA 克隆仅相差 8 个氨基酸的发现表明了 IMP 脱氢酶蛋白的高度保守性。

夏目田等人(1990)从人脾 cDNA 文库中分离出 2 种不同的 cDNA(I 型和 II 型)编码 IMP 脱氢酶。两个克隆都编码 514 个残基的蛋白质,显示出 84% 的序列同一性。发现 I 型 mRNA 是正常白细胞中的主要种类,而 II 型( 146691 ) 在人类卵巢肿瘤中占主导地位。

▼ 测绘

通过使用 IMPDH1 基因特异性引物对一组人/小鼠和人/仓鼠细胞体细胞杂交体进行聚合酶链反应分析,并使用 IMPDH1 基因组 DNA 作为探针,通过荧光原位杂交与中期染色体,Gu 等人(1994)确定 IMPDH1 基因位于 7q31.3-q32。

假基因

Doggett 等人(1993)描述了从人类 16 号染色体基因组 DNA 中随机生成的 STS,该 STS 与 IMPDH1 具有 90% 的序列同一性,与 IMPDH2 具有 72% 的同一性。通过对一组含有人类 16 号染色体不同部分的体细胞杂交体进行 PCR 分析,他们将 IMPDH 样序列对应到 16p13.3-p13.12。该区域映射分配通过高分辨率 FISH 进一步细化到子带 16p13.13。IMPDHL1 中存在内含子和移码突变表明该基因座可能是未加工的假基因。

▼ 分子遗传学

常染色体显性遗传性色素性视网膜炎(adRP) 是由几个不同基因引起的一组异质的进行性视网膜病变。一个基因座 RP10( 180105 ) 对应到人类染色体 7q31.1,可能占美国人和欧洲人中 adRP 病例的 5% 至 10%。通过链接映射,Bowne 等人(2002)确定了 2 个具有 RP10 形式 adRP 的美国家族,并使用这些家族将侧翼标记 D7S686 和 RP-STR8 之间的连锁间隔减少到 3.45 Mb。在候选区域内的 54 个孤立基因中鉴定出 10 个视网膜转录物,包括 IMPDH1。来自 3 个 RP10 家族的受影响个体的 DNA 测序揭示了 asp226 到 asn 的替换(D226N;146690.0001)。Asp226 在 IMPDH 基因中高度进化保守,表明这种突变可能是高度有害的。在一组 60 个 adRP 家族中的一个中观察到另一个 IMPDH1 替换,val268 到 ile(V268I;146690.0002 ),但在对照中没有。IMPDH1 是一种普遍表达的酶,作为同源四聚体发挥作用,可催化鸟嘌呤核苷酸从头合成中的限速步骤。因此,它可能在光感受器内的环核苷酸代谢中发挥重要作用。

凯南等人(2002)使用微阵列分析来比较野生型小鼠和具有靶向破坏视紫红质基因( 180380 ) 的小鼠之间的视网膜转录水平,指定为 Rho -/-。IMPDH1 基因在一系列以降低的水平存在的转录物中被鉴定出来。来自西班牙 adRP 家族的 DNA 突变筛选揭示了与疾病表型共分离的 arg224 到 pro 取代(R224P; 146690.0003 )。IMPDH1 蛋白的 Arg224 在物种之间是保守的,并且在欧洲对照组中不存在这种替代,这提供了额外的证据表明该突变是导致疾病表型的原因。

鲍恩等人(2006)在 265 名色素性视网膜炎患者、17 名黄斑变性患者和 24 名 Leber 先天性黑蒙患者中寻找 IMPDH1 基因的突变(见 LCA11, 613837)。他们确定了 8 个常染色体显性 RP 家族中的 5 个变体。他们还在 2 名分离出 LCA11 的患者(R105W,146690.0004;N198K,146690.0005)中发现了杂合变异。已鉴定的变体均未改变相应蛋白质的酶活性;在所有明显的致病突变中,单链核酸结合的亲和力和/或特异性都发生了改变。

▼ 动物模型

Aherne 等人(2004)确定小鼠光感受器中的大部分 GTP 是由 IMPDH1 产生的。Impdh1 -/- 空小鼠表现出一种缓慢进展的视网膜变性形式,其中通过视网膜电波函数分析的视觉转导逐渐受到损害,尽管在 12 个月大时,大多数感光器在结构上保持完整。Aherne 等人(2004)注意到,相比之下,由 IMPDH1 基因突变引起的人类 RP 是一种严重的常染色体显性遗传性退行性视网膜病变。突变 IMPDH1 蛋白在细菌和哺乳动物细胞中的表达以及计算模拟表明,蛋白质错误折叠和聚集,而不是 IMPDH1 酶活性降低,是导致人类严重表型的可能原因。

在涉及 IMPDH1 基因内 arg224-to-pro 突变表达的常染色体显性 RP(RP10; 180105 ) 小鼠模型中, Tam 等人(2010)表明,用 17-烯丙氨基-17-去甲氧基格尔德霉素(17-AAG)(一种与热休克蛋白 Hsp90(HSP90AA1;140571 ) 结合的安沙霉素抗生素)处理可激活哺乳动物细胞中的热休克反应。处理保护光感受器免受聚集突变 IMPDH1 蛋白诱导的退化。claudin-5(CLDN5; 602101 ) 促进了药物向视网膜的全身输送) siRNA 介导的内血视网膜屏障调节。作者提出,单一的低分子量药物有可能抑制引起 RP 的多种突变蛋白的聚集。

▼ 等位基因变体( 6个精选示例):

.0001 色素性视网膜炎 10
IMPDH1, ASP226ASN
在 3 个与 7q(RP10; 180105 ) 相关的常染色体显性遗传性视网膜色素变性家族中,Bowne 等人(2002)确定了 IMPDH1 基因密码子 226 处的 G 到 A 转换,用天冬酰胺代替天冬氨酸(D226N)。Asp226 在 IMPDH 基因中高度进化保守,表明这种突变可能是高度有害的。

和田等人(2005 年)在 183 名不相关的常染色体显性 RP 患者中的 6 名中发现了 D226N 突变。考虑到由于先前发现的其他显性 RP 基因突变而被排除在研究之外的 135 名患者,Wada 等人(2005)估计 IMPDH1 突变约占北美主要 RP 病例的 2%。Wada 等人比较了 IMPDH1 D226N 突变、RP1 突变 R677X( 603937.0001 )、视紫红质突变 P23H( 180380.0001 ) 和视紫红质突变 P347L( 180380.0002 )携带者的视网膜电图(ERG) 振幅(2005)得出的结论是,最常见的突变 D226N 似乎导致视杆功能丧失的程度至少与视锥功能丧失一样多,并且这种 RP 形式的患者平均每单位剩余视觉区域保留 2 至 5 倍的 ERG 幅度比其他 3 种主要 RP 形式的患者。

比绍夫等人(2006 年)鉴定了一个经过加工的 IMPDH1 假基因,该假基因携带 676G-A 转换,产生 D226N 取代。作者认为,这个案例可能代表了一个涉及加工假基因的新基因转换事件。

.0002 色素性视网膜炎 10
IMPDH1, VAL268ILE
在一个与 7q(RP10; 180105 )相关的常染色体显性遗传性色素性视网膜炎家族中, Bowne 等人(2002)确定了 IMPDH1 基因的密码子 268 处的 G 到 A 转换,用异亮氨酸代替缬氨酸(V268I)。欧洲对照组中不存在该突变。

.0003 色素性视网膜炎 10
IMPDH1, ARG224PRO
在一个与 7q(RP10; 180105 )相关的常染色体显性遗传性视网膜色素变性的西班牙家庭中, Kennan 等人(2002)确定了 IMPDH1 基因的密码子 224 中的 G 到 C 转换,用脯氨酸代替精氨酸。Arg224 在 IMPDH 基因中高度进化保守,表明这种突变可能是高度有害的。

.0004 LEBER 先天性黑毛病 11
IMPDH1,ARG105TRP
在一名患有孤立性 Leber 先天性黑蒙 11( 613837 ) 的患者(UTAD463 家族)中,Bowne 等人(2006)确定了 IMPDH1 基因中 313C-T 转换的杂合性,导致 arg105 到 trp(R105W) 取代。该突变位于 CBS 亚结构域的交界处并改变 IMPDH1 的核酸结合特性。

.0005 LEBER 先天性黑毛病 11
IMPDH1、ASN198LYS
在患有孤立性 Leber 先天性黑蒙 11(LCA11; 613837 ) 的患者(UTAD391 家族)中,Bowne 等人(2006)确定了 IMPDH1 基因中 594T-G 颠换的杂合性,导致 asn198 到 lys(N198K) 取代。该突变位于 CBS 亚结构域的交界处并改变 IMPDH1 的核酸结合特性。在未受影响的父母或未受影响的姐妹中未发现突变。

.0006 色素性视网膜炎 10
IMPDH1、GLN318HIS
在一名患有视网膜色素变性 10(RP10; 180105 ) 的法裔加拿大人中,Coussa 等人(2015)确定了 IMPDH1 基因中 c.954G-C 颠换的杂合性,导致 gln318 到他的(Q318H) 替换。未进行变体的功能研究。