锌指蛋白 407; ZNF407

HGNC 批准的基因符号：ZNF407

细胞遗传学位置：18q22.3 基因组坐标（GRCh38）：18:74,590,474-75,065,670（来自 NCBI）

▼ 说明

锌指蛋白，例如 ZNF407，结合 DNA 并调节基因表达（Ren et al., 2013）。

▼ 克隆与表达

通过数据库分析，Ren 等人（2013） 鉴定了 3 个 ZNF407 剪接变体。 Variant-1 缺乏外显子 4，编码全长 ZNF407 蛋白。 变体 2 缺乏外显子 4 和 9，变体 3 缺乏外显子 5 至 9，编码的蛋白质相对于全长蛋白质在 C 端被截短。 全长 ZNF407 包含 22 个 C2H2 型锌指。

坎布里斯等人（2014） 报道全长 ZNF407 蛋白含有 2,248 个氨基酸，计算分子量为 247.4 kD。 数据库分析显示ZNF407 mRNA和蛋白在大多数正常组织中表达。

▼ 基因结构

任等人（2013）确定ZNF407基因含有9个外显子。

▼ 测绘

任等人（2013） 报道 ZNF407 基因对应到染色体 18q22.3。

▼ 分子遗传学

在一个阿拉伯近亲家庭中，有 2 个兄弟身材矮小、智力发育受损和畸形特征（SIMHA; 619557），Kambouris 等人（2014） 鉴定了 ZNF407 基因错义突变的纯合性（S1685W; 615894.0001）。 该突变与家族中的疾病完全分离，并且在 400 个种族匹配的对照或公共变异数据库中未发现。

Zahra 等人在一个患有神经发育障碍的巴基斯坦大家庭中发现，该障碍涉及智力发育受损以及对应到 18q22.2-23 的可变其他特征（2020） 鉴定了 ZNF407 基因（615894.0002） 中 3 bp 重复的纯合性，该重复在公共变异数据库中未发现。 使用 GeneMatcher，作者鉴定了一名 7 岁巴西女孩和一名 6 岁菲律宾男孩，他们的智力发育受损，并且具有可变的重叠特征，他们还携带 ZNF407 中的双等位基因突变：女孩中存在纯合 G802V 替换，男孩中存在复合杂合错义突变（R962G 和 K1214N）。 所有突变均通过桑格测序进行验证，并在各自家族中与疾病分离。

▼ 等位基因变异体（2 个选定示例）：

.0001 身材矮小、智力发育受损、小头畸形、肌张力减退和眼睛异常
ZNF407、SER1685TRP
在一个阿拉伯近亲家庭中，有 2 个兄弟智力发育受损并具有畸形特征（SIMHA; 619557），Kambouris 等人（2014） 鉴定了 ZNF407 基因中 c.5054C-G 颠换的纯合性，导致锌指结构域 18 和 19 之间的接头内高度保守的残基发生 ser1685 到 trp（S1685W） 的取代。该变体与家族中的疾病完全分离，在 400 个种族匹配的对照或 1000 个基因组计划或 NCBI dbS 中未发现该变体NP 构建 135 个数据库。 作者指出，该突变影响 3 个 ZNF407 同工型中的 2 个。

.0002 身材矮小、智力发育受损、小头畸形、肌张力减退和眼睛异常
ZNF407，3-BP DUP
Zahra 等人在巴基斯坦的一个大型多近亲结婚家庭（家庭 I）中，其中 2 代有 9 名成员患有神经发育障碍，涉及智力发育受损，并具有可变的其他特征（SIMHA；619557）（2020） 鉴定了 ZNF407 基因中 3 bp 框内重复（c.2814_2816dup, NM_001146189） 的纯合性，导致缬氨酸残基（V939dup） 重复。 这种重复经过桑格测序验证，并显示与家族中的疾病完全分离，但在 gnomAD 数据库中并未发现。