神经母细胞瘤，易感性，6; NBLST6

细胞遗传学定位：1q21.1 基因组坐标（GRCh38）：1:143,200,000-147,500,000

迪斯金等人（2009） 描述了在 846 名患有神经母细胞瘤的白种人患者和 803 名对照者的发现组中鉴定出与神经母细胞瘤相关的染色体 1q21.1 上的常见拷贝数变异（CNV）。 研究结果在 2 个孤立的复制组（包括 595 个病例和 3,357 个对照）中得到证实。 他们首先观察到 1q21.1 处存在大约 300 kb 的半合子缺失，这种缺失发生在 15.6% 的病例中，但仅在 9.1% 的对照中发生。 半合子缺失频率差异显着，p = 1.83 x 10（-19）。 观察到的纯合缺失频率在病例和对照中是相同的（总体为 1.3%）。 最大缺失大小约为143 kb； 在这个区域内，Diskin 等人（2009） 鉴定了一个新基因 NBPF23（612970）。

▼ 分子遗传学

在对 18 种神经母细胞瘤（包括肿瘤和细胞系）的分析中，1q21.1 的拷贝数已知，Diskin 等人（2009） 观察到 CNV 状态和 NBPF23 转录物表达之间存在明显的相关性。 值得注意的是，2 拷贝样本聚类成 2 个不同的表达类别（p = 0.007），分别具有低表达和高表达，并且这些被认为代表不同的 1q21.1 CNV 基因型。 2 个拷贝样本有 2 种可能的 CNV 基因型，作者根据二倍体基因组中每个染色体上存在的 NBPF23 拷贝数将其称为 2:0（顺式）和 1:1（反式）。 低表达组中的两个神经母细胞瘤样本可以被证明源自2:0组成性CNV基因型，因为它们在体细胞上获得了1q染色体（1q染色体的3个拷贝），但该基因有2个拷贝具有杂合SNP。 迪斯金等人（2009）提出了一个模型，其中当 2 个 NBPF23 拷贝处于顺式构型而不是反式构型时，NBPF23 表达会降低。 研究结果表明该基因与神经母细胞瘤的早期肿瘤发生有关。