补充成分 2; C2

HGNC 批准的基因符号:C2

细胞遗传学位置:6p21.33 基因组坐标(GRCh38):6:31,897,782-31,945,671(来自 NCBI)

▼ 克隆和表达

Bentley 和 Porter(1984) 使用 64 种合成寡核苷酸的混合物作为探针,从人肝脏 cDNA 文库中分离出 2 个 C2 cDNA 克隆。

Bentley(1986) 发现 C2 的一级结构与功能类似的补体因子 B(CFB; 138470) 有 39% 的同一性。

Raum 等人的绘图(1976) 得出结论,CFB 基因座(138470) 和 C2 缺陷基因座靠得很近(未观察到重组),并且这 2 个基因座距 6p 染色体上的 HLA-A(142800) 和 HLA-B(142830) 基因座 3 至 5 厘摩。C2 与 HLA-B 发生 57 次交叉,观察到 2 次交叉;CFB 与 HLA-B 发生 72 次交叉,观察到 3 次交叉。基因的顺序为HLA-A、-B、-D、CFB、C2。劳姆等人(1979) 发现 C2 和 HLA-B 重组分数为 0.02 时,对数值为 14.39。没有观察到 Bf 和 C2 之间的交叉。在黑猩猩中,与人类一样,C2 和 Bf 与 MHC 密切相关,而 C3 和 C8 都与 MHC 没有密切相关。Tokunaga 等人在日语中发现了 C2 和 Bf 之间的连锁不平衡,这与紧密连锁一致(1982)。

通过对无关人员的基因组 DNA 进行 Southern 印迹分析,Bentley 和 Porter(1984) 鉴定出单个 C2 基因座,并且显示与 6p 附近的 CFB 基因座没有交叉杂交。邓纳姆等人(1987) 给出了 MHC III 类基因簇的有用图谱。顺序为着丝粒--DR--21-OH--C2--TNFA--TNFB--HLA-B--pter。C2 和肿瘤坏死因子 α 基因之间的距离为 390 kb。

▼ 分子遗传学

Roychoudhury 和 Nei(1988) 将等位基因变异的基因频率数据制成表格。

补充成分 2 的缺乏

通过对 2 名 I 型 C2 缺陷患者(217000) 的整个 C2 cDNA 进行测序,Johnson 等人(1991) 鉴定出纯合 28 bp 缺失(613927.0001);该缺失并不存在于正常 C2 基因或 II 型 C2 缺陷基因中。

Wetsel 等人在患有 II 型 C2 缺乏症的患者中(1996) 鉴定了 C2 基因中 2 个错义突变的复合杂合性(613927.0002-613927.0003)。

年龄相关性黄斑变性

H 因子基因(CFH; 134370) 的变异体编码补体替代途径的主要抑制剂,与发生年龄相关性黄斑变性的风险相关(ARMD; 参见 603075)。黄金等人(2006) 检验了编码同一途径的其他调节蛋白的基因变异与 ARMD 相关的假设。他们在 2 个孤立队列中筛选了 CFB(138470) 和 C2 基因的遗传变异,该队列由大约 900 名 ARMD 患者和大约 400 名匹配的对照者组成。单倍型分析确定了具有统计显着性的常见风险单倍型和 2 个保护性单倍型。单倍型 H10,由 CFB 的 L9H 变体(138470.0003) 和 C2 的 E318D 变体(613927.0004) 组成,以及单倍型 H7,由内含子 10 中的变体(613927.0004) 组成。

他金斯蒂安等人(2012) 通过汇集 2006 年至 2011 年间发表的 19 项研究的数据,回顾了 C2/CFB 基因多态性与 ARMD 的关联,其中涉及 4 个多态性:C2 基因中的 rs9332739(613927.0004) 和 rs547154(613927.0005) 以及 rs4151667(138470.00) CFB 基因中的 rs641153(138470.0004) 和 rs641153(138470.0004)。所有 4 个 SNP 的汇总次要等位基因频率均在 4.7% 至 9.6% 之间,但印度人群除外,其中 rs9332739 处的 C 等位基因是主要等位基因。对于 C2 多态性,rs9332739 处的次要 C 等位基因和 rs547154 处的次要 T 等位基因的估计相对风险(比值比)分别为 0.55(95% 置信区间(CI) 0.46, 0.65)和 0.47(95% CI 0.39, 0.57)。对于 CFB 多态性,rs4151667 和 rs614153 处的次要 A 等位基因的估计风险分别为 0.54(95% CI 0.45,0.64)和 0.41(95% CI 0.34,0.51),分别。这些等位基因效应使白种人群体中所有 AMD 的风险绝对降低了 2.0-6.0%。

▼ 命名法

世界卫生组织推荐了补体成分变体的标准化命名法(Austen 等,1968)。

WHO-IUIS 命名小组委员会(1993) 对 C2 命名提出了建议。

▼ 等位基因变体(5 个选定示例):.

0001 C2 缺陷,I 型
C2,28-BP DEL
约翰逊等人(1991) 发现从具有 I 型 C2 缺陷的纯合子(217000) 培养的成纤维细胞在 C2 蛋白的合成中表现出选择性缺陷。对 2 个纯合子的整个 C2 cDNA 进行测序显示 134 bp 的单个外显子存在缺失。这将生成终止密码子 TGA 的阅读框移动到删除下游 16 bp。C2 缺陷基因中的 28 bp 缺失从 134 bp 外显子(外显子 6)的 3 引物末端 9 bp 开始,包括供体剪接位点。在对 8 个亲属的研究中,Johnson 等人(1992) 在与常见的 I 型 C2 缺陷复合型/单倍型相关的所有 C2Q0 等位基因中发现了 28 bp 缺失;这种缺失不存在于正常 C2 基因或 II 型 C2 缺陷基因中。

.0002 C2 缺陷,II 型
C2,SER189PHE
II 型 C2 缺乏症(217000) 的特点是选择性阻断 C2 分泌。II 型 C2 无效等位基因(C2Q0) 与 2 个主要组织相容性单倍型相关,这些单倍型不同于常见的 I 型 C2 缺陷的 MHC。为了确定 II 型缺陷的分子基础,Wetsel 等人(1996)分离出2个II型C2Q0基因并将它们分别转染到L细胞中。在每个 C2Q0 等位基因的高度保守残基处发现了不同的错义突变。其中之一是外显子 5 中的 566C-T 转换,导致 ser189 至 phe(S189F) 取代。另一个是外显子 11 中的 1930G-A 转变,导致 gly444 到 arg(G444R) 取代(613927.0003)。每个都具有不同的 MHC 单倍型,并且每个突变的 C2 基因产物都保留在分泌途径的早期。

.0003 C2 缺乏症,II 型
C2,GLY444ARG
参见 613927.0002 和 Wetsel 等人(1996)。

.0004 与年龄相关的黄斑变性,14,降低
C2、GLU318ASP 的风险
Gold 等人在大约 900 名 ARMD(ARMD14;615489)个体和大约 400 名对照者中进行了研究(2006) 发现单倍型 H10(由 CFB 基因的 L9H 变体(138470.0003) 和 C2 基因的 glu318-to-asp(E318D; rs9332739) 变体组成)与 ARMD 风险降低之间存在显着关联。

马勒等人(2006) 重复了 CFB 的 L9H 变体和 C2 的 E318D 变体与 ARMD 风险的关联,并指出虽然这对 SNP 具有赋予同等保护作用的次要等位基因,但他们发现这些作用是孤立且不同的。

.0005 与年龄相关的黄斑变性,14,降低
C2、IVS10、GT 的 风险
Gold 等人在约 900 名 ARMD(ARMD14;615489)患者和约 400 名对照者中进行了研究(2006) 发现单倍型 H7(由 CFB 基因的 R32Q 变体(138470.0004) 和 C2 基因的内含子 10 变体(rs547154) 组成)与 ARMD 风险降低之间存在显着关联。

马勒等人(2006) 重复了 CFB 的 R32Q 变体和 C2 的内含子 10 变体与 ARMD 风险的关联,并指出虽然这对 SNP 具有赋予同等保护作用的次要等位基因,但他们发现这些作用是孤立且不同的。

▼ 另请参阅:

阿尔珀(1976);戴等人(1976);德瓦尔德和里特纳(1979);傅等人(1974);约翰逊等人(1992);梅奥等人(1976);德永等人(1981);沃尔斯基等人(1976)