RABENOSYN,RAB 效应蛋白; RBSN

  • 锌指 FYVE 结构域蛋白 20;ZFYVE20
  • RABENOSYN 5

HGNC 批准的基因符号:RBSN

细胞遗传学位置:3p25.1 基因组坐标(GRCh38):3:15,070,068-15,099,162(来自 NCBI)

▼ 克隆和表达

使用凝胶覆盖测定,Nielsen 等人(2000) 鉴定出 ZFYVE20,他们将其称为 rabenosyn-5,是一种与 RAB5 直接相互作用的蛋白质(179512)。通过肽分析、EST 数据库分析和 HeLa 细胞 cDNA 文库的 PCR,他们克隆了 rabenosyn-5 cDNA。推导的 784 个氨基酸的蛋白质包含一个 N 端 C2H2 型锌指结构域、一个中央 FYVE 指结构域以及位于其 C 端的 5 个氨基酸基序 NPF 拷贝。SDS-PAGE显示rabenosyn-5的表观分子量为110 kD。

▼ 基因功能

Nielsen 等人(2000) 确定 rabenosyn-5 与 EEA1(605070) 共定位于 HeLa 细胞的 RAB5 阳性核内体上。rabenosyn-5 和 EEA1 的募集取决于磷脂酰肌醇 3-激酶(参见 601232)。突变分析表明 rabenosyn-5 的 FYVE 结构域是内体靶向所必需的。Rabenosyn-5 与 Sec1 样蛋白 VPS45(VPS45A; 610035) 复合,并且 rabenosyn-5 似乎充当 VPS45 和 RAB5 之间的分子连接。EEA1 和 rabenosyn-5 都是早期内体融合所必需的,但只有 rabenosyn-5 过表达抑制了组织蛋白酶 D(116840) 加工成其 47-kD 中间体,这表明这两种蛋白在内体转移中发挥着不同的作用。

Naslavsky 等人通过 HeLa 细胞的免疫荧光显微镜观察(2004) 在囊泡和管状结构中检测到 rabenosyn-5 与 EHD1(605888) 部分共定位。RNA 干扰(RNAi) 消耗 HeLa 细胞中的 EHD1 或 rabenosyn-5 会延迟转铁蛋白(190000) 及其受体(TFRC; 190010) 以及主要组织相容性复合物 I 类(参见 HLA-A; 142800)到质膜的再循环。EHD1 的消耗导致内化物质在紧凑的核旁区室中积累,但 rabenosyn-5 的消耗导致物质保留在分散的外围区室中。同时去除 rabenosyn-5 和 EHD1 导致的表型与单独使用 rabenosyn-5 RNAi 时观察到的表型相似,表明 rabenosyn-5 在调节内吞再循环中先于 EHD1 发挥作用。纳斯拉夫斯基等人。

▼ 生化特征

Ethiraj 等人使用结构蛋白质组学方法(2005) 确定了多价效应器 rabenosyn-5 与 Rab 家族相互作用的特异性和结构基础。结果表明,即使 rabenosyn-5 中结构相似的效应器结构域也可以仅通过与开关和开关间区域的相互作用来实现对 Rab GTPases 不同子集的高度选择性识别。观察到的特异性是在家族范围内由活性构象的结构多样性决定的,活性构象控制着关键保守识别决定簇的空间分布,并且由少量的正序列和负序列决定簇决定,这些决定簇允许进一步区分具有相似开关构象的 Rab GTPases。

▼ 测绘

国际辐射混合定位联盟将 ZFYVE20 基因定位到 3 号染色体(STS-N59228)。

▼ 分子遗传学

Stockler 等人对一名患有癫痫、发育迟缓、颅面畸形、骨质减少、巨红细胞增多症和巨幼红细胞生成的 6 岁女孩进行了研究(2014) 鉴定了 RBSN 基因(609511.0001) 中错义突变的纯合性。

▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):

.0001 意义不明的变异体
RBSN、GLY425ARG
该变异体被归类为意义不明的变异体,因为其对癫痫发作的多效性表型的贡献和内吞转移缺陷的证据尚未得到证实。

Stockler 等人对一名患有发育迟缓、癫痫性脑病以及多效性临床和生化表型的 6.5 岁女孩进行了全外显子组测序(2014) 鉴定了 RBSN 基因外显子 14 中 c.1273G-A 转变的纯合性,导致 gly425 到 arg(G425R) 突变。该突变随着家族中的疾病而分离。这个女孩是欧洲血统的非近亲父母在一次平安怀孕后所生的三姐妹中的第二个。她在 5 个月大时出现了耐药性婴儿痉挛症,14 个月大时开始生酮饮食后情况有所改善。40 个月大时,她接受了脑部 MRI 检查,结果显示第三脑室中度增大,髓鞘形成和皮质结构正常。严重的高甘油三酯血症需要改变生酮饮食。6.5岁时,经过改良的生酮饮食和 4 种抗惊厥药物后,她没有出现癫痫发作。她患有小头畸形、身材矮小和肌张力低下,能够在支撑下坐着,但无法站立或行走。她举止快乐、友善,不爱说话,无法自己进食,也没有上厕所的习惯。她的头发稀疏、稀疏,面部特征畸形,特征是距离过远、面中部发育不全、眼睛深陷、鼻梁宽、鼻子短、嘴巴宽、牙齿小、舌头突出。6岁时,观察到中度骨质减少,涉及骨盆和长骨以及圆锥形骨骺、短指和骨龄延迟。骨髓穿刺显示巨幼细胞样红细胞生成和偶尔的细胞质间桥接。在生酮饮食之前,该患者的生化检查结果正常,但尿甲基丙二酸(MMA) 偏高、血浆同型半胱氨酸轻度升高以及钴胺素(维生素 B12)水平偏低。治疗使 B12 水平恢复正常;同型半胱氨酸水平正常,但尿液和血清 MMA 水平仍轻度升高。该患者还存在微量白蛋白尿和高尿钙排泄,血浆 25-羟基维生素 D、钙、磷和碱性磷酸酶水平正常。她患有持续性红细胞巨细胞增多症和短暂性中性粒细胞减少症。外周血显示靶细胞和口细胞增加。对成纤维细胞的研究揭示了突变蛋白以野生型方式表达和定位,但转铁蛋白(190000) 积累减少了 50%,这通过野生型等位基因转染得到了纠正。此外,患者的成纤维细胞增殖率受损以及细胞骨架和溶酶体异常。蛋白质印迹分析显示,与野生型相比,前体组织蛋白酶 D(CTSD;116840) 增加,但成熟组织蛋白酶 D 减少,表明加工受损。G425R 突变位于 NG(D/E) 基序的中央残基中,该基序是可变片段内的一个保守岛,并且一直保守到果蝇。该突变在千人基因组计划数据库中的频率为 0.003987。G425R 突变位于 NG(D/E) 基序的中央残基中,该基序是可变片段内的一个保守岛,并且一直保守到果蝇。该突变在千人基因组计划数据库中的频率为 0.003987。G425R 突变位于 NG(D/E) 基序的中央残基中,该基序是可变片段内的一个保守岛,并且一直保守到果蝇。该突变在千人基因组计划数据库中的频率为 0.003987。