转录延伸因子,线粒体; TEFM

  • 17 号染色体开放解读码组 42; C17ORF42

HGNC 批准的基因符号:TEFM

细胞遗传学位置:17q11.2 基因组坐标(GRCh38):17:30,898,982-30,907,628(来自 NCBI)

▼ 说明

TEFM 是一种核编码线粒体蛋白,与线粒体 RNA 聚合酶(POLRMT;601778) 形成复合体,增强 POLRMT 对单链和双链 DNA 的持续合成能力(Minczuk 等,2011)。

▼ 克隆与表达

基于其与原核和真核转录因子的相似性,Minczuk 等人(2011) 确定了人类 TEFM。 推导的蛋白质包含 N 端线粒体靶向信号,随后是 2 个螺旋-发夹-螺旋(HhH) 基序和 C 端 RuvC 型 RNase H 折叠。 细胞分级分离和免疫组织化学分析表明,内源性和表位标记的 TEFM 在人类细胞系中与线粒体标记一起定位。 TEFM 在线粒体中的点状分布表明它可能是转录活性线粒体核的组成部分,或者它可能与新合成的 mtRNA 相互作用。

▼ 基因功能

Minczuk 等人使用小干扰 RNA(2011) 发现人骨肉瘤细胞中 TEFM 的敲除降低了线粒体复合物 IV 亚基 COX2(516040) 的丰度,并且更弱地降低了复合物 I 亚基 NDUFB8(602140) 的丰度,并降低了线粒体耗氧率。 TEFM 的敲低减少了对应到多顺反子 mtRNA 重链(H) 和轻链(L) 远端位置的转录本丰度,而对对应到更靠近启动子区域的转录本丰度影响较小。 对与固定化 TEFM 结合的 HEK 细胞线粒体蛋白进行亲和纯化和质谱分析表明,TEFM 与 POLRMT、PTCD3(614918) 和假定的 RNA 解旋酶 DHX30(616423) 以及一组可变的线粒体核糖体蛋白相互作用。 RNase 处理表明 TEFM 与 PTCD3 和 DHX30 的相互作用需要 RNA,而 TEFM 与 POLRMT 之间的相互作用则不需要。 TEFM 不与引发因子相互作用。 突变分析表明 TEFM 与 POLRMT 的 C 端催化区域相互作用。 在没有 TEFM 的情况下,POLRMT 产生长达 75 个核苷酸的短 RNA 片段。 在相同的时间内,但在 TEFM 存在的情况下,POLRMT 合成了长达 400 个核苷酸的 RNA 产物。 明祖克等人(2011) 假设 TEFM 作为线粒体转录延伸因子发挥作用。

线粒体 DNA 的 L 链有一个脊椎动物保守的富含 G 的区域,称为保守序列块 II(CSBII),它可以与新生 mtRNA 相互作用并形成杂合 G 四链体,通过相反 H 链上的延伸复合物终止翻译。 阿加罗尼安等人(2015) 发现 TEFM 与延伸复合物下游的 DNA 以及 mtRNA 的 G-四链体区域相互作用。 这些相互作用干扰了庞大的 G-四链体结构的形成,从而允许通过 CSBII 进行转录。

▼ 测绘

Hartz(2015) 根据 TEFM 序列(GenBank AF086465) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 TEFM 基因对应到染色体 17q11.2。