细胞外富含亮氨酸重复序列和纤连蛋白 III 型结构域蛋白 1; ELFN1

  • 蛋白质磷酸酶 1,调节亚基 28;PPP1R28

HGNC 批准的基因符号:ELFN1

细胞遗传学位置:7p22.3 基因组坐标(GRCh38):7:1,666,063-1,747,953(来自 NCBI)

▼ 描述

ELFN1 基因编码细胞外富含亮氨酸的重复纤连蛋白 contains-1 蛋白,该蛋白作为蛋白磷酸酶抑制剂,在突触形成和分化中发挥重要作用(Dursun 等人总结,2021)。

▼ 克隆和表达

通过计算机分析来鉴定可能的具有 RVxF 基序的蛋白磷酸酶-1(PP1;参见 176875)相互作用蛋白,Hendrickx 等人(2009) 鉴定了 ELFN1。

杜尔森等人(2021) 指出 ELFN1 基因编码具有 5 个结构域的 828 个氨基酸的蛋白质:信号肽、6 个富含亮氨酸的重复(LRR) 区域、III 型纤连蛋白(FN3) 结构域、跨膜结构域和细胞内结构域。

▼ 基因功能

Hendrickx 等人(2009)表明ELFN1抑制PP1的磷酸酶活性。

Sylwestrak 和 Ghosh(2012) 证明,细胞外富含亮氨酸的重复纤维连接蛋白 1(Elfn1) 蛋白由海马的东方-腔隙分子(O-LM) 中间神经元选择性表达,并调节突触前释放概率,以指导高度促进的锥体-O-LM 突触的形成。Sylwestrak 和 Ghosh(2012) 得出结论,Elfn1 的突触后表达调节锥体细胞轴突的目标特异性突触特性。

▼ Mapping

Hartz(2012) 根据 ELFN1 序列(GenBank BF434584) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 ELFN1 基因对应到染色体 7p22.3。

▼ 分子遗传学

关联有待确认

有关发育性脑病和癫痫性脑病(参见例如 DEE1, 308350)与 ELFN1 基因变异之间可能关联的讨论,请参见 614964.0001。

Rasheed 等人使用全外显子组测序(2021) 在 3 个同胞的 ELFN1 基因中发现了一个纯合错义变异(c.149C-A,P50H),这些同胞的父母都是巴基斯坦近亲(MRID175 家族),智力发育受损。一名患者出现癫痫发作。这些患者还携带另外 2 个基因的变异:ABCB5(611785) 中的 c.149C-A(V391D) 和 C7ORF50 中的 c.535delC(Leu179CysfsTer136)。所有 3 个变体均位于 7 号染色体上的纯合血统区域。未进行变体的功能研究和患者细胞的研究。

▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):

.0001 意义不明的变异体
ELFN1、8-BP DEL、NT42
该变异体被归类为意义不明的变异体,因为其对发育性脑病和癫痫性脑病的贡献尚未得到证实(例如,参见 DEE1, 308350)。

Dursun 等人在 3 名同胞中,由近亲土耳其父母所生,患有未明确的发育性和癫痫性脑病(2021) 在 ELFN1 基因中发现了一个纯合 8 bp 缺失(c.42_49del, NM_001128636.2),预计会导致信号肽结构域中的移码和提前终止(Ala15ProfsTer241)。该变异是通过纯合性作图和全外显子组测序相结合发现的,并通过桑格测序证实,与该家族中的疾病分离。gnomAD 数据库中不存在该变体。与对照组相比,患者细胞的 ELFN1 mRNA 减少了约 52%,但尚未对该变体进行其他功能研究。变体测序确定了第二个候选改变(c.215G-T,NM_005806。3;染色体 21q22 上 OLIG2 基因(606386) 中的 Gly72Val) 可能对表型有贡献,但尚未对 OLIG2 进行进一步分析。患者出现严重的整体发育迟缓、智力发育受损、自闭症特征、早期婴儿难治性癫痫性脑病、锥体征、关节松弛和面部畸形。其他特征包括躯干肌张力低下、无法行走、缺失言语、目光接触不良和整体生长不良。畸形的面部特征包括深陷的眼睛、大耳朵、宽嘴、长人中、斜视和外斜视。两名年长同胞的脑部成像显示明显的小脑裂和胼胝体薄。智力发育受损、自闭症特征、早期婴儿难治性癫痫性脑病、锥体征、关节松弛和面部畸形。其他特征包括躯干肌张力低下、无法行走、缺失言语、目光接触不良和整体生长不良。畸形的面部特征包括深陷的眼睛、大耳朵、宽嘴、长人中、斜视和外斜视。两名年长同胞的脑部成像显示明显的小脑裂和胼胝体薄。智力发育受损、自闭症特征、早期婴儿难治性癫痫性脑病、锥体征、关节松弛和面部畸形。其他特征包括躯干肌张力低下、无法行走、缺失言语、目光接触不良和整体生长不良。畸形的面部特征包括深陷的眼睛、大耳朵、宽嘴、长人中、斜视和外斜视。两名年长同胞的脑部成像显示明显的小脑裂和胼胝体薄。斜视和外斜视。两名年长同胞的脑部成像显示明显的小脑裂和胼胝体薄。斜视和外斜视。两名年长同胞的脑部成像显示明显的小脑裂和胼胝体薄。