序列相似性家族149,成员B1; FAM149B1

  • KIAA0974

HGNC 批准的基因符号:FAM149B1

细胞遗传学位置:10q22.2 基因组坐标(GRCh38):10:73,168,089-73,244,503(来自 NCBI)

▼ 描述

FAM149B1 基因编码一种在小鼠早期胚胎阶段表达的蛋白质,被认为在初级纤毛生物学中发挥作用(Shaheen 等人的总结,2019)。

▼ 克隆和表达

Nagase 等人通过对从大小分级的脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,(1999) 克隆了 FAM149B1,他们将其命名为 KIAA0974。推导的蛋白质含有565个氨基酸。RT-PCR ELISA 显示 FAM149B1 在人体组织中普遍表达,其中在肾脏、睾丸和卵巢中表达最高。

▼ Mapping

Gross(2019) 根据 FAM149B1 序列(GenBank BC015394) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 FAM149B1 基因对应到染色体 10q22.2。

▼ 分子遗传学

Shaheen 等人在来自 4 个不相关的中东血统近亲家庭的 6 名患有 Joubert 综合征 36(JBTS36; 618763) 的患者中(2019) 鉴定了 FAM149B1 基因(618413.0001-618413.0002) 中移码或无义突变的纯合性。这些突变是通过外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。其中一种变体在 gnomAD 数据库中未发现,而另一种变体的发现频率较低。与对照组相比,来自 1 名患者的成纤维细胞显示出更长的纤毛和更大的纤毛长度变异性。免疫染色显示 IFT88(600595) 和 IFT46 在纤毛尖端异常积累,导致形态膨胀,表明逆行转移受损。与对照组相比,经过 siRNA 介导的 FAM149B1 敲低的患者细胞和 HEK293 细胞显示出 SHH(600725) 的显着失调。此外,沙欣等人(2019) 证实 FAM149B1 与 TBC1D32(615867) 相互作用,这与 1 名患者的 OFD 表型相关(参见 615867.0001)。来自该患者的细胞还显示出 IFT 复合物在纤毛尖端的异常积累,并显示出与来自 FAM149B1 突变患者的成纤维细胞相似的基因表达谱。沙欣等人(2019) 得出结论,FAM149B1 是正常纤毛发育所必需的。来自该患者的细胞还显示出 IFT 复合物在纤毛尖端的异常积累,并显示出与来自 FAM149B1 突变患者的成纤维细胞相似的基因表达谱。沙欣等人(2019) 得出结论,FAM149B1 是正常纤毛发育所必需的。来自该患者的细胞还显示出 IFT 复合物在纤毛尖端的异常积累,并显示出与来自 FAM149B1 突变患者的成纤维细胞相似的基因表达谱。沙欣等人(2019) 得出结论,FAM149B1 是正常纤毛发育所必需的。

▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):.

0001 JOUBERT 综合征 36
FAM149B1、2-BP DEL、356AG
Shaheen 等人在来自 3 个阿拉伯近亲家庭(家庭 1-3)的 5 名患有 Joubert 综合征 36(JBTS36;618763)的患者中(2019) 在 FAM149B1 基因的外显子 4 中发现了纯合 2-bp 缺失(c.356_357delAG, NM_173348.1),导致移码和提前终止(Lys119IlefsTer18)。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在所有家族中都与该疾病分离。它不存在于 gnomAD 数据库或包含 2,379 个种族匹配的对照外显子组的数据库中。单倍型分析证实了创始人效应。与对照组相比,来自 1 名患者的成纤维细胞显示出更长的纤毛和更大的纤毛长度变异性。免疫染色显示 IFT88(600595) 和 IFT46 在纤毛尖端异常积累,导致形态凸出,表明逆行转移受损。与对照组相比,经过 siRNA 介导的 FAM149B1 敲低的患者细胞和 HEK293 细胞显示出 SHH(600725) 的显着失调。

.0002 JOUBERT 综合征 36
FAM149B1、GLN1147TER
Shaheen 等人发现,一名由近亲土耳其父母(家庭 4)出生的男孩患有 Joubert 综合征 36(JBTS36;618763)(2019) 在 FAM149B1 基因中发现了纯合 c.439C-T 转换(c.439C-T,NM_173348.1),导致 gln1147 到 ter(Q1147X) 的取代。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。该变体在 gnomAD 数据库中发现频率较低(6.637 x 10(-6))。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。