视网膜母细胞瘤结合蛋白 8; RBBP8

  • 视网膜母细胞瘤相互作用和肌球蛋白样;RIM
  • CTBP 相互作用蛋白;CTIP

HGNC 批准的基因符号:RBBP8

细胞遗传学位置:18q11.2 基因组坐标(GRCh38):18:22,914,120-23,026,485(来自 NCBI)

▼ 克隆和表达

Fusco 等人(1998) 描述了编码一种名为 RIM(视网膜母细胞瘤相互作用肌球蛋白样)的多肽的 cDNA 的分离和表征,该多肽在酵母 2-杂交系统以及哺乳动物细胞中与视网膜母细胞瘤(RB1; 614041) 蛋白相互作用。RIM cDNA 预测包含 2 个亮氨酸拉链基序、一个 RB1 结合域和一个 CTBP(参见 602618)结合域的 897 个氨基酸的多肽。RIM 蛋白在其整个长度上与肌球蛋白家族(参见 160720)蛋白具有弱同源性。Northern 印迹分析揭示了普遍表达的 3.6-kb mRNA。免疫沉淀实验表明,含有氨基酸 142-897 的截短 RIM 蛋白与哺乳动物细胞中的 RB1 相互作用。

为了了解 E1A 和 CTBP 之间的相互作用导致肿瘤发生抑制活性的机制,Schaeper 等人(1998) 寻找与 CTBP 复合的细胞蛋白。通过酵母 2-杂交筛选和 RACE PCR,Schaeper 等人(1998) 鉴定并克隆了 CTBP 相互作用蛋白(CTIP)。CTIP 包含一个 5 个氨基酸基序,即 PLDLS 基序,该基序在所有人类腺病毒的 E1A 蛋白中高度保守。CTIP 通过 PLDLS 基序与 CTBP 结合。

▼ 测绘

Fusco 等人的地图(1998)通过荧光原位杂交将RBBP8基因定位到染色体18q11.2。

▼ 基因功能

Yu et al.(1998) 使用 Sos 招募系统筛选与包含 BRCT 结构域的 BRCA1(113705) 区域结合的蛋白质。于等人(1998) 发现 BRCT 结构域在体内与 CTIP 相互作用,CTIP 是一种根据其与 CTBP 转录辅阻遏物关联而鉴定的蛋白质(Schaeper 等,1998)。于等人(1998) 得出结论,BRCA1 至少部分通过调节 CTBP 介导的转录抑制来调节基因表达。此外,于等人(1998) 发现 BRCA1 和 CTIP 之间的体内相互作用被影响 BRCA1 BRCT 基序的 3 个孤立肿瘤相关突变中的每一个完全消除。于等人(1998) 得出结论,BRCA1-CTIP 相互作用可能是 BRCA1 抑制肿瘤所必需的。

黄等人(1998)使用酵母2-杂交和体外生化测定来证明CTIP与人BRCA1的C末端片段从残基1602到1863特异性相互作用。从BRCA1的C末端去除最后11个氨基酸的种系突变不仅消除了其转录激活功能,而且还消除了与CTIP的结合。

李等人(2000) 证明 BRCA1 相关蛋白 CTIP 在电离辐射下变得过度磷酸化并从 BRCA1 解离。该磷酸化事件需要蛋白激酶 ATM(参见 607585)。ATM 在丝氨酸残基 664 和 745 处磷酸化 CTIP,这些位点突变为丙氨酸会消除 BRCA1 从 CTIP 的解离,导致电离辐射时持续抑制 BRCA1 依赖性诱导的 GADD45(126335)。李等人(2000) 得出结论,ATM 通过在电离辐射下磷酸化 CTIP,可以调节 BRCA1 介导的 DNA 损伤反应 GADD45 基因的调节,从而提供 ATM 缺陷和乳腺癌之间的潜在联系。

Yu 和 Baer(2000) 表明,CTIP 与其相关因子一样,主要是一种核蛋白。CTIP 多肽内源库的一个子集存在于蛋白质复合物中,该蛋白质复合物包括 BRCA1 和 BRCA1 相关 RING 结构域蛋白(BARD1;601593)。在蛋白质水平上,CTIP 表达随细胞周期进展而变化,其模式与 BRCA1 相同。因此,当分裂细胞穿过G(1)/S边界时,在静息细胞和G(1)循环细胞中保持较低水平的CTIP多肽的稳态水平急剧增加。然而,与 BRCA1 不同,CTIP 表达的 G(1)/S 诱导主要由转录后机制介导。Yu 和 Baer(2000) 发现 CTIP 和 BRCA1 之间的相互作用在面对由紫外线、阿霉素、或过氧化氢。Yu 和 Baer(2000) 认为 CTIP 可以潜在地调节 BRCA1 在转录调节、DNA 修复和/或细胞周期检查点控制中的功能。

在寻找微卫星不稳定性(MSI)的新靶基因时,Vilkki 等人(2002) 研究了 14 个中性内含子重复序列的突变率,并将这些突变率与潜在 MSI 靶基因的外显子编码重复序列中观察到的突变率进行了比较。正如预期的那样,内含子单核苷酸重复的长度与 G/C 和 A/T 重复的滑移数量呈正相关。测序显示,与类似的内含子重复序列相比,CTIP 的外显子 A9 重复序列的突变率显着增加(25/109 = 22.9%)(p 小于或等于 0.001)。维尔基等人(2002) 得出结论,CTIP 应作为 MSI 目标基因进行评估。

Sum 等人在几种蛋白质相互作用测定中使用人和小鼠表达质粒(2002) 将 CTIP 和 BRCA1 鉴定为 LMO4(603129) 结合蛋白。LDB1(603451) 还与转染的人胚胎肾细胞中含有 LMO4、CTIP 和 BRCA1 的复合物相关。在功能测定中,LMO4 抑制酵母和哺乳动物细胞中 BRCA1 介导的转录激活。

萨托里等人(2007) 证明人类 CTIP 蛋白具有对双链断裂诱导剂的抗性,并且仅在 S 和 G2 细胞周期阶段被募集到双链断裂。此外,萨托里等人(2007) 揭示 CTIP 是双链断裂切除所必需的,从而将复制蛋白 A(参见 RPA1, 179835) 和蛋白激酶 ATR(601215) 募集到双链断裂,以及随后的 ATR 激活。此外,萨托里等人(2007) 确定 CTIP 在物理上和功能上与 MRE11(600814) 复合物相互作用,并且 CTIP 和 MRE11 都是有效同源重组所必需的。最后,萨托里等人(2007) 证明 CTIP 与 Sae2 具有序列同源性,Sae2 参与酵母中 MRE11 依赖性双链断裂加工。萨托里等人(2007) 得出的结论是,他们的发现确立了 CTIP 样蛋白在控制双链断裂切除、检查点信号传导和同源重组方面的进化保守作用。

Mimitou 和 Symington(2008) 证明,酵母 Exo1 核酸酶(606063) 和 Sgs1 解旋酶(参见 604611)在双链断裂(DSB) 加工的替代途径中发挥作用。新的、部分切除的中间体最初的产生依赖于 Sae2,在缺乏 Exo1 和 Sgs1 的酵母中积累,并且是同源重组的不良底物。当 Sae2 缺失时,除了 Exo1 和 Sgs1 之外,同源依赖性修复失败并且未处理的 DSB 积累。Mimitou 和 Symington(2008) 得出结论,同源重组期间 DSB 加工有一个两步机制,即 Mre11 复合体和 Sae2 从 DNA 末端去除一个小的寡核苷酸,形成早期中间体,

Yun 和 Hiom(2009) 确定了 CTIP 在修复鸟类 B 细胞系 DT40 的 DNA 双链断裂(DSB) 中的作用。他们确定 CTIP 不仅是 S/G2 期通过同源重组修复 DSB 所必需的,而且也是 G1 期微同源介导的末端连接(MMEJ) 所必需的。CTIP 在同源重组中的功能(而非 MMEJ)依赖于丝氨酸残基 327 的磷酸化和 BRCA1 的募集(113705)。表达不能在 Ser327 位点磷酸化的 CTIP 蛋白的细胞在同源重组方面存在特异性缺陷,并且在 DNA 损伤后单链 DNA 水平降低,而 MMEJ 不受影响。

奎耶等人(2009) 使用微细胞介导的染色体转移方法和表达微阵列分析来鉴定与卵巢癌(167000) 细胞系中肿瘤抑制相关的候选基因。在来自 3 项欧洲人群研究的 1,600 多名卵巢癌患者中,他们对来自 9 个候选基因的 68 个标记 SNP 进行了基因分型,发现生存与 RBBP8 基因 rs4474794(风险比,0.85;95% CI,0.75-0.95;p = 0.007)和 rs9304261(风险比, 0.83;95% CI,0.71-0.95;p = 0.009)。对 314 个卵巢肿瘤中标记 SNP 的杂合性丢失(LOH) 分析确定了体细胞基因缺失与生存之间的关联。101 个信息丰富的病例中,35% 的肿瘤显示 RBBP8 基因 LOH,这与显着较差的预后相关(风险比,2.19;95% CI,1.36-3.54;p = 0.001)。奎耶等人(2009) 得出结论,肿瘤中 RBBP8 基因的种系遗传变异和体细胞改变与卵巢癌患者的生存相关。

在体内,Helmink 等人(2011) 证明,在小鼠细胞中,组蛋白 H2AX(601772) 可以阻止除 Artemis(605988) 之外的核酸酶处理发夹密封的编码末端;在没有H2AX的情况下,CtIP可以有效促进RAG(参见179615)裂解产生的DNA末端的发夹打开和切除。这种 CtIP 介导的切除受到 γ-H2AX 和 MDC1(607593) 的抑制,MDC1 与染色质侧翼 DNA 双链断裂中的 γ-H2AX 结合。此外,共济失调毛细血管扩张突变激酶(ATM;607585)激活调节这种切除的拮抗途径。CtIP DNA 末端切除活性通常仅限于细胞周期复制后阶段的细胞,在该阶段,它对于同源介导的修复至关重要。在 G1 期淋巴细胞中,CtIP 处理的 DNA 末端不能通过经典的非同源末端连接有效地连接,而形成的接头经常使用微同源性并显示出显着的染色体缺失。赫尔明克等人(2011) 得出结论,H2AX 保留了 G1 期淋巴细胞中断裂 DNA 末端的结构完整性,从而阻止这些 DNA 末端进入促进基因组不稳定的修复途径。

罗伯特等人(2011) 表明组蛋白脱乙酰酶(HDAC) 抑制/消融特异性抵消酵母 Mec1(人 ATR 的直系同源物)激活、双链断裂加工和单链 DNA-RFA 核丝形成。而且,酵母重组蛋白Sae2在HDAC抑制后被乙酰化并被降解。两种 HDAC、Hda1(参见 HDAC4,605314)和 Rpd3(HDAC1;601241)和 1 种组蛋白乙酰转移酶(HAT)Gcn5(GCN5L2;602301)在这些过程中发挥关键作用。罗伯特等人(2011) 还发现 HDAC 抑制通过促进自噬触发 Sae2 降解,从而影响 Hda1 和 Rpd3 突变体的 DNA 损伤敏感性。雷帕霉素通过抑制 Tor(MTOR; 601231) 刺激自噬,也会导致 Sae2 降解。罗伯特等人(2011) 提出 Rpd3、Hda1、

▼ 分子遗传学

在一个患有 Seckel 综合征的伊拉克近亲家庭中,对应到染色体 18p11.31-q11.2(SCKL2;606744),Qvist 等人(2011) 对候选基因 RBBP8 进行了测序,并鉴定了与疾病分离的剪接位点突变(604124.0002) 的纯合性,但在 100 个对照中未发现该突变。对患有另一种小头畸形综合征的巴基斯坦近亲家庭中 RBBP8 的分析,对应到 18p11.22-q11.2(贾瓦德综合征;251255),Qvist 等人(2011) 在受影响的个体中鉴定出 2 bp 缺失(604124.0003) 的纯合性。

Shaheen 等人对一名患有塞克尔综合征的 9 岁沙特阿拉伯女孩进行了研究(2014) 鉴定了 RBBP8 基因错义突变的纯合性(R100W; 604124.0004)。

体细胞突变

黄等人(1998) 筛选了一组 89 个肿瘤细胞系 cDNA 的 CTIP 编码区突变,并鉴定了 5 个错义变体,其中 1 个位于胰腺癌细胞系中(604124.0001)。作者认为 CTIP 可能是一种肿瘤抑制因子,其作用途径与 BRCA1(113705) 相同。

▼ 历史

Kaidi 等人的文章(2010) 描述 CTIP 和 SIRT6(606211) 之间相互作用的内容被撤回,因为剑桥大学的一项调查得出结论,第一作者 Abderrahmane Kaidi 伪造了数据。

▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):.

0001 胰腺癌、体细胞
RBBP8、LYS337GLU
Wong 等(1998)筛选了一组 89 个肿瘤细胞系 cDNA 的 CTIP 编码区突变,并鉴定了 5 个错义变体。在胰腺癌细胞系 BxPC3 中,密码子 337 处赖氨酸变为谷氨酸的变化伴随着杂合性的明显丧失或野生型等位基因的不表达。因此,黄等人(1998) 得出的结论是,CTIP 本身可能是一种肿瘤抑制因子,与 BRCA1(113705) 具有相同的途径。

.0002 塞克尔综合症 2
RBBP8、IVS15、TG、+53
Borglum 等人之前研究过,来自伊拉克近亲家庭的 4 名受影响同胞患有 Seckel 综合征 2(SCKL2;606744)(2001),Qvist 等人(2011) 鉴定了 RBBP8 基因(2347+53T-G) 内含子 15 内 53 bp TG 颠换的纯合性,产生选择性剪接的转录物和 C 端截短的蛋白质。未受影响的父母都是剪接位点突变的杂合子,而在 100 个对照中未发现这种突变。对家族成员细胞系的分析表明,DNA 损伤诱导的单链 DNA 形成有缺陷,单链 DNA 是 ATR(601215) 激活的关键辅助因子;因此,SCKL2 细胞呈现较低的凋亡阈值和对 DNA 损伤的高度敏感性。在非 Seckel 细胞中过表达类似的截短 CTIP 变体以剂量依赖性方式重现了 SCKL2 细胞表型。奎斯特等人(2011)指出,这代表了一种新型遗传疾病机制,其中显性失活突变会产生隐性遗传性疾病。

.0003 JAWAD 综合征
RBBP8, 2-BP DEL, 1868TA
在患有小头畸形、智力迟钝和指趾异常的巴基斯坦近亲家庭受影响成员中(JWDS; 251255),对应到染色体 18p11.22-q11.2,Hassan 等人之前研究过(2008),Qvist 等人(2011) 鉴定出 RBBP8 基因外显子 11 中 2 bp 缺失的纯合性,导致移码导致提前终止密码子。在 2 名专性携带者的杂合性中检测到该突变,而在任何对照中均未发现该突变。Qvist(2012) 指出突变为 1868delTA。

.0004 SECKEL 综合征 2
RBBP8、ARG100TRP
对于一名患有 Seckel 综合征 2(SCKL2;606744) 的 9 岁沙特阿拉伯女孩,Shaheen 等人(2014) 鉴定了 RBBP8 基因中 c.298C-T 转变的纯合性,导致 arg100 到 trp(R100W) 取代。