溶质载体家族 46(叶酸转运蛋白),成员 1; SLC46A1

血红素载体蛋白 1; HCP1
质子耦合叶酸转运蛋白; PCFT

HGNC 批准的基因符号:SLC46A1

细胞遗传学位置:17q11.2 基因组坐标(GRCh38):17:28,394,642-28,406,592(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

沙耶吉等人(2005) 克隆了小鼠 Slc46a1,他们将其称为 Hcp1,并通过数据库分析鉴定了其人类同源物。小鼠和人类蛋白质含有 459 个氨基酸,并具有 9 个预测的跨膜结构域。 Northern blot分析检测到Hcp1在小鼠十二指肠中显着表达,在肝脏和肾脏中表达较低,在其他小鼠组织中没有表达。免疫电镜显示小鼠十二指肠刷状缘膜和顶端细胞质中存在Hcp1。

Qiu 等人通过对人体组织进行 Northern 印迹分析(2006) 发现 2.7-和 2.1-kb 转录本在肾、肝、胎盘、小肠和脾中强表达,在结肠和睾丸中表达较低,在脑、肺、胃、心脏和肌肉中表达极低。人肠道定量PCR检测到十二指肠高表达,其次是空肠、回肠、盲肠、结肠和直肠。

夏尔马等人(2007) 确定人类 HCP1 与牛、大鼠和小鼠 Hcp1 分别具有 80%、84% 和 87% 的氨基酸同一性。他们预测牛 Hcp1 具有 12 个跨膜结构域以及细胞内 N 和 C 末端,序列分析表明该结构在真核生物中是保守的。 RT-PCR检测人脑、乳腺、肾脏、前列腺、脾脏、视网膜和视网膜色素上皮中HCP1的表达。

▼ 基因结构

沙耶吉等人(2005)确定SLC46A1基因含有5个外显子。

▼ 测绘

沙耶吉等人(2005) 指出 SLC46A1 基因对应到人类染色体 17q11.1 和小鼠染色体 11B5。

▼ 基因功能

沙耶吉等人(2005) 发现小鼠 Hcp1 在非洲爪蟾卵母细胞和 HeLa 细胞中表达后,以温度依赖性和可饱和的方式介导血红素的跨膜摄取,并且 HCP1 对卟啉环具有特异性。将小鼠暴露在缺氧环境中会诱导铁的吸收,从而诱导 Hcp1 mRNA 的表达。在缺铁的小鼠十二指肠中,Hcp1 定位于刷状缘膜,细胞质染色很少或没有。相比之下,在铁负载小鼠中,Hcp1 似乎积聚在细胞质中,没有顶端染色。

拉通德-达达等人(2006) 表明,HCP1 介导转染的 Caco-2 肠细胞中​​时间和温度依赖性血红素摄取。 Caco-2 细胞分化后 HCP1 mRNA 表达增加,这种增加与分化过程中血红素摄取的增强相关。血红素加氧酶-1(HMOX1;141250) 的诱导,而非铁或铁螯合,诱导 HCP1 mRNA。

邱等人(2006) 确定 PCFT 是一种质子耦合的高亲和力叶酸转运蛋白,可在肠道的低 pH 条件下运行。

中井等人(2007) 表明,PCFT 在人胚胎肾细胞中瞬时表达,在细胞外 pH 为 5.5 时以不依赖 Na+ 且对膜电位不敏感的方式介导叶酸转运。在接近中性 pH 值时不存在转运活性。叶酸转运是饱和的,并受到叶酸减少(包括甲氨蝶呤)的抑制。当在犬肾细胞中表达时,PCFT主要位于顶膜,并且甲氨蝶呤的细胞积累在顶侧高于基侧。中井等人(2007) 得出结论,PCFT 负责肠道对叶酸的吸收并减少叶酸。

▼ 分子遗传学

在患有遗传性叶酸吸收不良的家庭成员中(229050),Qiu 等人(2006) 鉴定出 SLC46A1 基因中的纯合突变(611672.0001)。

在 5 名患有遗传性叶酸吸收不良的婴儿中,Zhao 等人(2007)在SLC46A1基因中鉴定出6种不同的双等位基因突变(参见例如611672.0002-611672.0005)。

▼ 等位基因变异体(10 个精选示例):

.0001 叶酸吸收不良,遗传性
SLC46A1、IVS2AS、G-A、-1

在 2 名患有遗传性叶酸吸收不良的波多黎各姐妹中(229050)(Geller 等人,2002),Qiu 等人(2006) 在 SLC46A1 基因的内含子 2 中发现了纯合的 G 到 A 的转变,导致剪接位点突变和外显子 3 的跳跃。体外功能表达研究表明,突变蛋白被捕获在细胞内,缺乏转运功能。每个未受影响的亲本都是该突变的杂合子。

.0002 叶酸吸收不良,遗传性
SLC46A1,1-BP DEL,194G

在一名患有遗传性叶酸吸收不良的非洲裔美国男孩(229050) 中,Zhao 等人(2007) 在 SLC46A1 基因中发现了一个纯合 1-bp 缺失(194delG),导致移码和提前终止。体外功能表达研究表明突变蛋白不具有叶酸转运活性。

.0003 叶酸吸收不良,遗传性
SLC46A1、ARG113SER

在一名患有遗传性叶酸吸收不良的土耳其女孩(229050) 中,Zhao 等人(2007) 鉴定了 SLC46A1 基因中的纯合 337C-A 颠换,导致 arg113 到 Ser(R113S) 取代。体外功能表达研究表明突变蛋白不具有叶酸转运活性。患者5个月大时出现发烧、腹泻和抽搐病史。她患有贫血、白细胞减少症、骨髓巨幼细胞增多和低免疫球蛋白血症。尽管接受了肠外叶酸治疗,但她仍患有慢性癫痫发作和持续性神经系统缺陷,包括偏瘫和智力低下。 Corbeel 等人此前曾报道过她(1985)。

.0004 叶酸吸收不良,遗传性
SLC46A1、SER318ARG

在一名患有遗传性叶酸吸收不良的男婴中(229050),Zhao 等人(2007) 鉴定了 SLC46A1 基因中 2 个突变的复合杂合性:954C-G 颠换,导致 Ser318-to-arg(S318R) 取代,以及 1126C-T 转换,导致 arg376-to-trp(R376W) ; 611672.0005) 替代。该患者为西班牙/巴西/墨西哥血统,4 个月大时出现严重大红细胞贫血和血小板减少症。随后,他患上了卡氏肺孢子虫肺炎。他的血清叶酸和免疫球蛋白水平较低。叶酸替代治疗导致临床改善。一位姐姐在 3 个月大时出现全血细胞减少症,并因巨细胞病毒肺炎死亡。体外功能表达研究表明,两种突变蛋白均缺乏叶酸转运活性。

.0005 叶酸吸收不良,遗传性
SLC46A1、ARG376TRP

讨论Zhao等人在遗传性叶酸吸收不良患者(229050)中发现的复合杂合状态的SLC46A1基因中的arg376-to-trp(R376W)突变(2007),参见 611672.0004。

.0006 叶酸吸收不良,遗传性
SLC46A1、ARG113CYS

在患有遗传性叶酸吸收不良的患者(229050) 中,Lasry 等人(2008) 在 SLC46A1 基因的外显子 2 中鉴定出纯合的 337C-T 转换,导致连接跨膜螺旋 2 和 3 的第一个细胞内环中的 arg113-to-cys(R113C) 取代。中国仓鼠卵巢(CHO)细胞显示,突变蛋白靶向质膜​​,但叶酸转运活性显着受损。在另一名患有该疾病的患者中发现了该密码子的另一个突变(R113S;611672.0003)。生物信息学分析表明,arg113残基高度保守,面向膜内疏水口袋,该口袋可能是叶酸易位孔的一部分。

.0007 叶酸吸收不良,遗传性
SLC46A1,1-BP INS,17C

Jebnoun 等人(2001 年)之前曾报道过一名突尼斯患者,其父母为近亲,患有遗传性叶酸吸收不良(229050),Shin 等人(2011) 在 SLC46A1 基因中发现了一个纯合 1-bp 插入(17insC),导致移码和提前终止,并预计会导致蛋白质功能完全丧失。

.0008 叶酸吸收不良,遗传性
SLC46A1、ALA335ASP

Shin 等人在一名患有遗传性叶酸吸收不良的英国男孩(229050) 中进行了研究(2011) 鉴定了 SLC46A1 基因中 2 个突变的复合杂合性:外显子 2 中的 1004C-A 颠换,导致 ala335-to-asp(A335D) 取代,以及外显子 1 中的 2-bp 缺失(204_205delCC; 611672.0009) ,导致移码和提前终止。 A335D取代发生在第九跨膜结构域,Hela细胞中的体外功能表达测定表明突变蛋白失活,没有叶酸摄取活性。该儿童在 2 个月大时患上耶氏肺孢子虫肺炎,并伴有贫血和血浆叶酸检测不到。后来他表现出运动发育迟缓、反射亢进、动作急促、震颤和近端肌肉萎缩。 3 岁 9 个月时的脑部 MRI 显示髓鞘形成略有延迟。通过治疗,他的神经系统症状有所改善,但在精细运动技能和阅读方面有轻微困难,但数学技能良好。他在 5 岁时出现枕叶癫痫发作。

.0009 叶酸吸收不良,遗传性
SLC46A1,2-BP DEL,204CC

Shin 等人讨论了在遗传性叶酸吸收不良(229050) 患者中以复合杂合状态发现的 SLC46A1 基因(204_205delCC) 中的 2-bp 缺失(2011),参见 611672.0008。

Atabay 等人在患有遗传性叶酸吸收不良的土耳其同胞中(2010) 在 SLC46A1 基因的外显子 1 中发现了纯合 2-bp 缺失(204_205delCC),导致移码和过早终止。分别在 3.5 岁和 1 个月大时检测到血液和脑脊液叶酸水平较低。肠外注射 5-甲酰四氢叶酸治疗分别导致 3 岁和 1 岁时发育正常。

.0010 叶酸吸收不良,遗传性
SLC46A1、GLY338ARG

Shin 等人对一名 8 岁突尼斯男孩进行了研究,该男孩由近亲父母出生,患有遗传性叶酸吸收不良(229050)(2011) 鉴定出 SLC46A1 基因中的纯合 1012G-C 颠换,导致第九个跨膜结构域中的 gly338 至 arg(G338R) 取代。 Hela 细胞的体外功能表达测定表明,突变蛋白失活,没有叶酸摄取活性。患者在 2.5 个月大时出现大细胞性贫血并伴有低血清叶酸。他接受了亚叶酸治疗,纠正了贫血和轴性肌张力过高。脑电图和头部 CT 扫描均正常。两名受影响的兄弟姐妹已经死亡。