PDZ 和 LIM 域蛋白 7; PDLIM7

  • LIM 域蛋白之谜;ENIGMA
  • LIM 矿化蛋白 1;LMP1

HGNC 批准的基因符号:PDLIM7

细胞遗传学位置:5q35.3 基因组坐标(GRCh38):5:177,483,393-177,497,603(来自 NCBI)

▼ 描述

LIM 结构域以首次发现的蠕虫蛋白(Lin11 和 Mec3)和脊椎动物蛋白(ISL1;600366)命名,是参与蛋白质-蛋白质相互作用的富含半胱氨酸的双锌指。含有 LIM 结构域的蛋白质,例如 PDLIM7,是形成多蛋白复合物的支架。这些蛋白质参与细胞骨架组织、细胞谱系规范、器官发育和肿瘤发生(Bach,2000)。

▼ 克隆和表达

Wu 和 Gill(1994) 使用酵母 2 杂交筛选 HeLa 细胞 cDNA 文库,以胰岛素受体(INSR; 147670) 的外显子 16 作为诱饵,然后筛选人神经母细胞瘤细胞系,孤立出编码 ENIGMA 的 cDNA。作者将蛋白质 ENIGMA 命名为 ENIGMA,参考第二次世界大战期间盟军根据其内吞代码识别特性破译了在恩尼格玛机器上加密的德国信息。序列分析预测该 455 个氨基酸的蛋白质含有 2 个 C 端 LIM 结构域。Northern 印迹分析揭示了细胞系中 1.7-kb 转录物的表达。蛋白质印迹分析显示 55-kD 蛋白质的表达,正如从一级序列中预期的那样。

Liu 等人通过使用从大鼠 Lmp1 设计的引物对成骨细胞系总 RNA 进行 PCR,然后对心脏 cDNA 文库进行筛选和 5-prime RACE(2002)克隆了LMP1。推导的 457 个氨基酸的蛋白质具有一个 N 端 PDZ 结构域,随后是一个独特的序列、一个 LIM 样基序和 2 个 C 端 LIM 结构域。刘等人(2002) 还鉴定了 2 个剪接变体,他们将其称为 LMP2 和 LMP3。LMP2 变体编码一个推导的 423 个氨基酸的蛋白质,该蛋白质保留了 PDZ 和 LIM 结构域,但具有改变的独特区域。LMP3 变体编码推导的 153 个氨基酸的蛋白质,该蛋白质在大约 30% 的独特区域后被截短。PCR 检测到所有检查组织中 1 个或多个变体的表达。全长LMP1主要存在于白细胞、脾脏、肺、胎盘和胎儿肝脏中,而LMP2主要存在于骨骼肌中,骨髓和心脏。在检测到的组织中,LMP3 是一种次要转录物。

▼ 基因功能

Wu 和 Gill(1994) 进行的酵母 2 杂交分析表明,ENIGMA 的完整 LIM2 结构域(而非 LIM1 结构域)与 INSR 的内吞密码特异性相互作用,但不与 IGF1R(147370)、LDLR(606945)、TFRC(190010) 或 EGFR(131550) 的内吞密码相互作用。Wu 和 Gill(1994) 认为 LIM 结构域为识别含酪氨酸的紧转结构提供了结构基础。

Kuroda 等人使用酵母 2 杂交分析(1996) 表明大鼠 Enh(605904) 和人 ENIGMA 的 LIM 结构域与不同的蛋白激酶 C(参见 176982)亚型相关。

Durick 等人使用免疫荧光和共聚焦显微镜(1998) 证明 ENIGMA 通过其 PDZ 结构域定位到细胞外周和一些细胞骨架成分,并且 ENIGMA 与 RET/PTC2 共定位(188830)。酵母 2 杂交分析表明,ENIGMA 通过其 LIM2 结构域以不依赖磷酸化的方式在 tyr586 处与 RET/PTC2 结合,这种相互作用以及 SHC1(600560) 的结合是 RET/PTC2 有丝分裂活性所必需的。

Guy 等人使用 GST Pull-down 和免疫沉淀分析(1999) 表明 ENIGMA PDZ 结构域与骨骼 β-原肌球蛋白(TPM2; 190990)(肌节蛋白丝的一个组成部分)的 C 端序列结合。免疫荧光和免疫电镜显示 ENIGMA 和 TPM2 共定位于肌节的 Z 线以及 Z 线和 I 带的边界。盖伊等人(1999) 提出 ENIGMA 很可能是一种接头蛋白,通过其 PDZ 结构域将 LIM 结合蛋白定位到肌节蛋白丝上。

刘等人(2002) 证明转染的全长 LMP1 诱导大鼠颅骨成骨细胞(ROB) 中骨结节的形成。将 LMP1 转染的细胞移植到无胸腺大鼠的皮下部位后,LMP1 诱导出内衬成骨细胞的骨小梁。来自转染的 ROB 培养物的条件培养基也在新鲜的 ROB 培养物中诱导骨结节。LMP3 变体的过度表达在 ROB 培养物中诱导结节方面同样活跃。在此测定中,LMP2 不诱导结节形成,而是抑制糖皮质激素刺激的结节形成。

米酰胺等人(2003)用携带人LMP1 cDNA(AdLMP1)的腺病毒感染人肺癌细胞。受感染的细胞表达骨形态发生蛋白-2(BMP2; 112261)、BMP4(112262)、BMP6(112266)、BMP7(112267) 和转化生长因子-β-1(TGFB1; 190180) 水平升高。感染AdLMP1的人血沉棕黄层细胞在异位植入无胸腺大鼠72小时后也显示出BMP4和BMP7蛋白水平升高,证实了体外假设。

▼ 基因结构

Liu et al.(2002) 确定 PDLIM7 基因包含 13 个外显子,跨度约为 24 kb。

通过基因组序列分析,Liu 等人(2002) 将 PDLIM7 基因定位到 5 号染色体。