APEX 核酸酶(脱嘧啶/脱嘧啶核酸内切酶)2; APEX2

  • APE2
  • XTH2
  • 脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶LIKE-2; APEX2
  • APEX 核酸酶样 2

HGNC 批准的基因符号:APEX2

细胞遗传学定位:Xp11.21 基因组坐标(GRCh38):X:55,000,362-55,009,056(来自 NCBI)

▼ 说明

APEX2 是无嘌呤/无嘧啶(AP) 核酸内切酶家族的成员(参见 APEX1;107748),它启动对由 N-糖基键自发水解、诱变剂诱导的碱基释放或 DNA 修复糖基酶切除受损碱基形成的 AP 位点的修复(Hadi 等,2002)。

▼ 克隆与表达

Tsuchimoto 等人通过使用来自粟酒裂殖酵母和其他生物体的 AP 核酸内切酶序列作为查询进行数据库分析,然后对人类白血病 cDNA 文库进行 PCR(2001) 克隆了 APEX2,他们将其称为 APE2。 推导的 518 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 59.1 kD。 APEX2 包含预测的 N 端线粒体靶向序列、与酿酒酵母 APN2/ETH1 具有同源性的 C 端区域、推定的 PCNA(176740) 结合基序以及与 DNA 拓扑异构酶 III(参见 TOP3A;601243)家族蛋白 C 端区域串联重复同源的 C 端亚区。 RT-PCR检测HeLa细胞、Jurkat细胞以及人肾、脑和胎儿脑组织中APEX2的表达。 土本等人(2001)通过免疫细胞化学将 APEX2 定位于线粒体,并证明 APEX2 氨基酸残基 1 至 15 作为线粒体靶向序列发挥作用。 免疫组织化学研究表明,APEX2 和 PCNA 在 HeLa 细胞的核灶中部分共定位。

艾德等人(2003) 使用人 APEX2 序列作为探针从小鼠脾 cDNA 文库中分离出小鼠 Apex2 cDNA。 人类 APEX2 与其小鼠同源物具有 83% 的氨基酸同一性。 小鼠组织的 Northern 印迹分析检测到在胸腺、脾脏、骨髓和肾脏中强表达,在眼、肺、脑和子宫中表达较低,在胃和唾液腺中无表达。

▼ 基因功能

土本等人(2001) 使用免疫沉淀和体外 Pull-down 结合测定来检测 APEX2 和 PCNA 之间的相互作用。 Tsuchimoto 等人使用 HAT 培养基和脱氧尿苷补充剂(2001) 表明尿嘧啶在核 DNA 中的错误掺入增加了核灶中 APEX2-PCNA 的关联,他们认为 APEX2 参与核和线粒体碱基切除修复(BER)。

哈迪等人(2002) 确定了影响 APEX2 酶活性的关键催化残基和结构决定因素,并证明与 APEX1 相比,APEX2 显示出较弱的 AP 位点特异性和 3 引物核酸酶活性。

艾德等人(2003) 确定小鼠 Apex2 mRNA 水平短暂增加,并在血清刺激的 BALB/3T3 细胞的 S 期晚期达到最大值。 他们认为 Apex2 参与复制后 BER。

布尔科维奇等人(2006) 使用纯化的重组 APEX2 进行了生化研究。 他们发现APEX2表现出弱的AP核酸内切酶活性,但表现出强的3-5-引发核酸外切酶和3-引发磷酸二酯酶活性。 他们认为 APEX2 在处理 3 引物损坏的末端或 3 引物不匹配的核苷酸中发挥作用。

▼ 基因结构

土本等人(2001)确定APEX2基因含有6个外显子。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,土本等人(2001) 将 APEX2 基因定位到染色体 Xp11.21。

▼ 动物模型

艾德等人(2004) 证明 Apex2 缺失小鼠表现出生长迟缓表型(大小为野生型同窝小鼠的 80%),伴有中度造血障碍和严重的淋巴细胞生成缺陷。 与野生型相比,Apex2缺失小鼠在G2/M期表现出胸腺细胞和丝裂原刺激的脾细胞的显着积累,表明APEX2是增殖淋巴细胞的正确细胞周期进程所必需的。