PTCSC3 基因; PTCSC3

HGNC 批准的基因符号:PTCSC3

细胞遗传学位置:14q13.3 基因组坐标(GRCh38):14:36,135,709-36,176,650(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Jendrzejewski 等人通过计算机搜索位于甲状腺乳头状癌全基因组关联研究(参见 188550)中鉴定的 SNP(rs944289) 附近的基因,然后搜索正常甲状腺组织的 5-prime 和 3-prime RACE(2012)克隆了PTCSC3。 转录本包含一个潜在的 95 密码子开放解读码组; 然而,大部分编码区位于重复元件内,表明转录本可能不会被翻译。 甲状腺组织的 Northern 印迹分析检测到 1.2 kb 的转录物。 对 15 种人体组织进行 RT-PCR 检测,甲状腺中高表达,仅肾脏中弱表达。

▼ 基因结构

Jendrzejewski 等人(2012) 确定 PTCSC3 基因包含 4 个外显子,跨度至少 40 kb。 5 素 UTR 包含功能性 CEBP-α(CEBPA; 116897)/CEBP-β(CEBPB; 189965) 结合元件。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Jendrzejewski 等人(2012) 将 PTCSC3 基因定位到染色体 14q13.3。

▼ 基因功能

Jendrzejewski 等人(2012)发现,与 46 名患者的邻近正常组织相比,所有甲状腺乳头状肿瘤组织中 PTCSC3 的表达均降低。 表达谱显示 PTCSC3 抑制参与 DNA 复制、重组和修复、细胞运动、肿瘤形态和细胞死亡的基因表达。

▼ 分子遗传学

Jendrzejewski 等人(2012) 发现在甲状腺乳头状癌全基因组关联研究中鉴定出的 SNP(rs944289) 位于 PTCSC3 的 5 素 UTR 中的 CEBP-α/CEBP-β 结合元件中。 他们提供的证据表明,与非风险等位基因相比,rs944289 的风险等位基因通过降低 CEBP-α 和 CEBP-β 结合亲和力来降低 PTCSC3 启动子激活,从而诱发甲状腺乳头状癌。

在一项全基因组关联研究中,Takahashi 等人采用了切尔诺贝利事故发生时年龄为 18 岁或以下的白俄罗斯乳头状甲状腺癌患者和年龄匹配的白俄罗斯对照受试者(2010) 发现放射相关乳头状甲状腺癌与 14q13.3 的 rs944289 之间没有关联,这显示与欧洲人中散发性 PTC 的关联性第二强。