双同源基因B; DUXB
HGNC 批准基因符号:DUXB
细胞遗传学定位:16q23.1 基因组坐标(GRCh38):16:75,693,893-75,701,461(来自 NCBI)
▼ 说明
DUXB是转录因子配对(PRD)样同源基因基因家族的成员。DUXB 在早期胚胎中表达,被认为在胚胎基因组激活和植入前胚胎发育的调节中发挥作用(Tohonen et al., 2015 和 Madissoon et al., 2016)。
▼ 克隆与表达
Tohonen 等人(2015)通过对 2 至 3 天大的人类胚胎的卵母细胞、受精卵和卵裂球进行单细胞 RNA 测序,鉴定了从卵母细胞到 4 细胞阶段以及从 4 细胞阶段过渡期间表达的基因。 - 植入前发育至8细胞阶段。其中PRD样同源基因DUXB、DUXA(611168)、ARGFX(611164)、DPRX(611165)、LEUTX(618701)、CPHX1(CPHXL);618700)和CPHX2。
Madissoon等(2016)描述了仅在早期胚胎中发现的9个人类PRD样同源基因域基因:ARGFX、CPHX1、CPHX2、DPRX、DUXA、DUXB、NOBOX(610934)、TPRX1(611166)和TPRX2(TPRX2P) )。他们鉴定了 DUXB 的 3 种剪接变体。PRD样同源基因基因中的同源结构域由大约60个氨基酸组成,折叠成N端臂和3个α螺旋。Madissoon 等人(2016)指出,DUXA 和 DUXB 与其他基因的不同之处在于具有 2 个同源域,而不是 1 个。DUXA 和 DUXB 的同源结构域序列与 ARGFX 的同源结构域分别具有 33% 和 28% 的同一性。作者发现 FANTOM5 数据库中没有一个基因表现出表达,这表明这些基因可能在发育的后期阶段被沉默。
▼ 基因功能
Madissoon等(2016)在胚胎干细胞(ESC)中过表达9个PRD样同源基因,证实这些基因主要是转录激活子(CPHX1、CPHX2、ARGFX)或阻遏子(DPRX、DUXA、TPRX2)和具有在人类植入前发育过程中被激活的独特靶基因。Madissoon et al.(2016)发现大多数PRD样同源基因调控的基因在转录起始位点上游富集了一个36-bp基序。DUXB、DPRX、TPRX2 和 NOBOX 下调的靶基因具有显着的重叠。
▼ 测绘
Madissoon et al.(2016)报道DUXB、CPHX1和CPHX2基因聚集在染色体16q23.1上的68-kb区域内。