胶原凝集素 12; COLEC12

具有 C 型凝集素结构域的清道夫受体；SRCL
胶原凝集素，胎盘，1；CLP1
A 级清道夫受体，成员 4；SCARA4

HGNC 批准的基因符号：COLEC12

细胞遗传学定位：18p11.32 基因组坐标（GRCh38）：18:316,737-500,701（来自 NCBI）

▼ 说明

胶原凝集素是 C 型凝集素家族，具有胶原蛋白样序列和碳水化合物识别域。它们通过与微生物的碳水化合物抗原结合的能力参与宿主防御。

▼ 克隆与表达

Nakamura等人（2001）使用大鼠Limk2（601988）作为酵母2-杂交筛选中的诱饵，从胎盘cDNA文库中克隆了COLEC12，他们将其命名为SRCL。推导的 742 个氨基酸的蛋白质的计算分子量约为 82 kD。COLEC12 包含 N 端亮氨酸拉链跨膜区、卷曲螺旋结构域、胶原蛋白结构域和 C 端 C 型凝集素/碳水化合物识别结构域。它还具有几个假定的 N-糖基化位点、富含丝氨酸/苏氨酸的区域和假定的内化信号。Nakamura等人（2001）也克隆了一种不包含C型碳水化合物识别基序的异构体。Northern 印迹分析检测到胎盘中主要 3.0-kb 转录物的表达水平最高，其次是肺、心脏和小肠。在胎盘中检测到 9.0、6.5、4.5 和 2.5 kb 的其他转录本。在其他几种组织中也发现了中等表达，但低于肝脏和脾脏中的检测水平。COLEC12 在转染的中国仓鼠卵巢（CHO）细胞中的免疫定位显示细胞外表面染色。点状染色表明 COLEC12 聚集在细胞表面。

Ohtani等人（2001）利用与胶原凝集素家族保守C端结构域的同源性，鉴定出含有COLEC12的EST，并将其命名为CLP1。他们使用该序列作为探针，通过帽位点狩猎，从胎盘 cDNA 文库中克隆了全长 COLEC12。Northern 印迹分析检测到胎盘、心脏和肺中 3.2 kb 转录物的表达，RT-PCR 检测到大多数检查组织中的表达。免疫组织化学分析表明，Colec12 定位于老鼠心脏的血管内皮细胞。COLEC12 在所有小鼠血管和人类心脏切片的大多数血管内皮细胞中均检测到，但在巨噬细胞、单核细胞和肝库普弗细胞中未检测到。免疫印迹和流式细胞分析表明，COLEC12 是人脐静脉或动脉内皮细胞、胎盘膜提取物和转染的 CHO 细胞中约 140 kD 的膜糖蛋白。体外翻译的 COLEC12 去糖基化产生表观分子量为 90 kD 的蛋白质。通过凝胶过滤色谱，缺乏跨膜结构域的截短形式的 COLEC12 以约 300 kD 的三聚体形式迁移。

Nakamura et al.（2001）克隆了小鼠Colec12。推导的 742 个氨基酸的蛋白质显示出与人类 COLEC12 相同的结构域，并且具有 92% 的序列同一性。Northern印迹分析揭示了小鼠Colec12的普遍表达，包括在肝脏和脾脏中的表达。Nakamura et al.（2001）发现Colec12在小鼠巨噬细胞系中高表达。在发育过程中，Colec12 在胚胎第 9 天（E9）之前的小鼠胚胎中表达。表达在E14时达到峰值并逐渐下降直至E18。

▼ 基因功能

Nakamura等人（2001）发现转染COLEC12的CHO细胞与大肠杆菌和金黄色葡萄球菌结合，但没有吞噬作用的证据。Nakamura et al.（2001）表明，小鼠Colec12也介导大肠杆菌和转染的CHO细胞之间的结合。

Ohtani et al.（2001）发现COLEC12转染CHO细胞后可介导细菌（E. 大肠杆菌和金黄色葡萄球菌）和酵母（S. 酿酒酵母）。它还与氧化型低密度脂蛋白（LDL）发生反应，但不与乙酰化LDL发生反应。结合被聚阴离子配体和氧化 LDL 抑制，但不被聚阳离子配体、LDL 或乙酰化 LDL 抑制。Ohtani et al.（2001）得出结论，COLEC12可能在宿主防御中发挥着不同于可溶性胶原凝集素在先天免疫中的作用。

▼ 分子遗传学

Ohmori 等人（2003）对 10 名日本志愿者的 COLEC12 基因进行了测序，并鉴定了 5 个 SNP（2 个内含子 2、1 个外显子 5、2 个外显子 6），次要等位基因频率至少为 29%。他们在该基因的 5-prime 上游区域发现了另一个 SNP。他们利用这 6 个 SNP，分析了来自 54 个人的 DNA 的基因单倍型结构。外显子 6 中的 SNP 导致氨基酸取代，因此是影响疾病易感性的候选者。

▼ 测绘

Nakamura等（2001）通过基因组序列分析，将COLEC12基因定位到染色体18p11.32。