真核翻译起始因子 2D; EIF2D

  • 肝细胞癌相关抗原 56; HCA56
  • 以前的连接素; LGTN,前

HGNC 批准的基因符号:EIF2D

细胞遗传学位置:1q32.1 基因组坐标(GRCh38):1:206,572,483-206,612,465(来自 NCBI)

▼ 说明

EIF2D 是一种翻译起始因子,以不依赖 GTP 的方式将 tRNA 递送至 40S 核糖体的 P 位点。 此前,EIF2D 在文献中被错误地称为连接蛋白(LGTN; 151625)(参见命名法)(Dmitriev 等人,2010)。

▼ 克隆与表达

使用质谱分析法,Dmitriev 等人(2010) 鉴定出 EIF2D 是从 HeLa 细胞中纯化的一种因子,可促进起始 tRNA 或 met-tRNA-i(met)(参见 180621)与 40S 核糖体 P 位点的 GTP 孤立结合。 通过 HEK293T 细胞总 RNA 的 RT-PCR,Dmitriev 等人(2010) 分离出 EIF2D cDNA。 推导的 584 个氨基酸的 EIF2D 蛋白的计算分子量为 65 kD。 它包含一个 N 端 PUA 结构域(存在于参与 RNA 代谢的蛋白质中)和一个 C 端 SUI1 结构域(存在于 EIF1 中并在起始密码子识别中发挥作用)。 从 HeLa 细胞中纯化的 EIF2D 的表观分子质量为 70 至 72 kD。 转染的 EIF2D 与内源性 EIF3(参见 602039)共定位于 HeLa 细胞的细胞质中。 EIF2D 直系同源物存在于所有真核生物基因组中。

▼ 基因功能

德米特里耶夫等人(2010)表明重组人EIF2D以不依赖GTP的方式促进met-tRNA-i(met)与40S核糖体P位点的结合。 在缺少 AUG 密码子的情况下,EIF2D 无法将 met-tRNA-i(met) 递送至 40S 核糖体。 met-tRNA-i(met) 的氨酰基部分对于 EIF2D 促进其与 40S 核糖体复合物的形成是可有可无的。 此外,EIF2D 对于起始 tRNA 和 AUG 密码子并不严格具有特异性,并且当用相应密码子编程时,可以将一些延伸 tRNA(例如 tRNA(phe))传递到 40S 核糖体的 P 位点。 EIF2D 稳定了 40S 核糖体与无前导 mRNA 的复合物,并强烈促进 40S 核糖体与含有单链富含 A 的 5 素 UTR 的 RNA 形成复合物。

▼ 测绘

Gross(2011) 根据 EIF2D 序列(GenBank AF220417) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 EIF2D 基因对应到染色体 1q32.1。

使用 FISH,Malnar-Dragojevic 等人(1997) 将小鼠 Eif2d 基因(他们称之为连接蛋白)(参见命名)对应到 1F 染色体。 该区域与人类染色体 1q31-q32 同线。

▼ 命名法

德米特里耶夫等人(2010) 指出,Jakoi 等人之前已将包含移码的部分人 EIF2D 序列定性为连接蛋白(LGTN; 151625) 的 cDNA(1989)。 德米特里耶夫等人(2010) 提出的几条证据表明 EIF2D 与连接蛋白无关,连接蛋白是一种外周膜蛋白,可结合并定位细胞表面的磷酸糖蛋白。 德米特里耶夫等人(2010) 指出,EIF2D 被错误地识别为连接素导致了一些报告,包括 Jakoi 等人的报告(1995),Severt 等人(1999),Dang 等人(2006)和李等人(2007),其中 EIF2D 的表达和/或调节被错误地归因于连接素。