原钙粘蛋白10; PCDH10

  • KIAA1400

HGNC 批准的基因符号:PCDH10

细胞遗传学位置:4q28.3 基因组坐标(GRCh38):4:133,149,293-133,208,605(来自 NCBI)

▼ 说明

原钙粘蛋白形成钙粘蛋白超家族中钙依赖性细胞-细胞粘附分子的亚家族。 Protocadherin-10 属于原钙粘蛋白的一个亚类,具有高度保守的 17 个氨基酸胞质基序(Wolverton 和 Lalande,2001)。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过对从成人大脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(2000) 克隆了 PCDH10,他们将其命名为 KIAA1400。 RT-PCR ELISA 检测到在所检查的大脑的所有区域以及睾丸和卵巢中存在中等表达,而在所检查的所有其他组织中则检测到低表达。

通过数据库检索,Wolverton 和 Lalande(2001) 鉴定并表征了 3 种原钙粘蛋白:PCDH10、PCDH18(608287) 和 PCDH19(300460),它们与 PCDH8(603580) 共享高度保守的 17 个氨基酸胞质基序(CM2)。 推导的 1,041 个氨基酸的 PCDH10 蛋白的表观分子质量为 113 kD。 所有 4 种原钙粘蛋白均含有 6 个钙粘蛋白样细胞外重复(EC) 结构域。 与 PCDH8 的脑特异性表达相反,RT-PCR 证明 PCDH10、PCDH18 和 PCDH19 不仅在脑中表达,而且在心脏、肾、肺和气管中也表达。 PCDH18也在肝脏中表达,与PCDH19和PCDH18相比,PCDH10在气管中表达减少。

Morrow 等人在使用培养的大鼠海马神经元的微阵列筛选中(2008) 鉴定出转录因子 PCDH10 是氯化钾(KCl) 膜去极化后表达强烈上调的基因。 尽管 MEF2 的 RNA 干扰敲除对 PCDH10 转录没有太大影响(参见 600660),但 PCDH10 受到 MEF2-单纯疱疹病毒(HSV) 病毒粒子蛋白 16(VP16) 融合蛋白的强烈诱导,在 1 小时和 2.5 小时分别达到 1.31(+/- 0.09) 倍诱导转录和 1.94(+/- 0.23) 倍诱导。 莫罗等人(2008) 的结论是,这种转录活性也强烈表明 PCDH10 是 MEF2 的转录靶标。 该研究试图通过追踪最近的共同祖先来确定影响自闭症的位点和基因(209850); 莫罗等人(2008) 指出,在该测定中鉴定出与研究中发现的 2 个最大缺失相关的 3 个基因中的 2 个(另一个是 C3ORF58,612200)不太可能仅是偶然的(二项式检验,表达改变类别中的 2 个或多个基因的 P 小于 0.006),同时考虑到 KCl 去极化测定鉴定出不到 5% 的转录组表达发生改变。

▼ 基因结构

通过序列分析,Wolverton 和 Lalande(2001) 确定 PCDH10 基因包含 5 个外显子,其中第一个外显子异常大。

▼ 测绘

通过辐射杂交分析,Nagase 等人(2000) 将 PCDH10 基因定位到 4 号染色体。