LIN28 同系物 B; LIN28B

  • LIN28,C. 线虫,B 的同源物;LIN28B

HGNC 批准的基因符号:LIN28B

细胞遗传学位置:6q16.3-q21 基因组坐标(GRCh38):6:104,936,998-105,083,331(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

使用表达微阵列,Guo 等人(2006) 鉴定出一种在肝细胞癌(HCC) 中高度上调的人类 EST。通过使用来自 HCC 细胞系的 cDNA 文库进行 5-prime RACE 和随后的测序,他们克隆了一种新的 cDNA,命名为 LIN28B,编码预测的 250 个氨基酸的蛋白质。该蛋白包含线虫 lin28 蛋白(发育时间调节因子)和人 LIN28(611043) 的 RNA 结合基序的保守组合:一个冷休克结构域和一对逆转录病毒型 CCHC 锌指结构域。通过数据库检索,Guo 等人(2006) 鉴定了小鼠 Lin28b,它编码预测的 271 个氨基酸的蛋白质,与人类 LIN28B 具有大约 78% 的序列同一性。RT-PCR 分析显示 LIN28B 在正常人睾丸、胎儿肝脏和胎盘中高表达,以及来自 9 对肿瘤/非肿瘤样本的肝脏肿瘤。Northern 印迹分析检测到在 6 个 HCC 细胞系中高表达的 5.6-kb 转录物。通过使用针对 LIN28B 的多克隆抗体进行蛋白质印迹分析,Guo 等人(2006) 鉴定了第二种由 180 个氨基酸组成的 LIN28B 同工型,命名为 LIN28BS,它是通过选择性剪接产生的,存在于非肿瘤肝组织和胎儿肝脏中。

通过序列分析进行作图,Guo 等人(2006) 将 LIN28B 对应到 6 号染色体,将小鼠同源物对应到 10 号染色体。Scott(2007) 根据 LIN28B 序列(GenBank AK131411) 与基因组序列(build 36.2) 的比对,将 LIN28B 对应到染色体 6q21。

▼ 基因功能

通过 Huh7 细胞的激光共聚焦显微镜,Guo 等人(2006)表明LIN28B蛋白在所有细胞期都存在于细胞质中,但在S期和G2期有核积累。稳定转染子中 LIN28B 和 LIN28BX 的诱导表达表明,LIN238B 显着促进细胞生长,而 LIN28BS 则不然。与秀丽隐杆线虫和人类 LIN28 一样,LIN28B 表达受到靶向 3 素 UTR 中位点的 miRNA 的调节。海拉细胞特别能够下调报告基因。LIN28B 3-prime UTR 的序列包括 let-7b 的预测 miRNA 结合位点,let-7b 是一种在 HeLa 细胞中高度表达的 miRNA,已知以 LIN28 为目标。

维斯瓦纳坦等人(2009) 发现小鼠 Lin28 和 Lin28b 在 NIH/3T3 细胞中的过度表达会耗尽 LET7 家族中多种成熟 miRNA 的水平(参见 605386),并导致 c-Myc(190080) 以及集落形成增加。表达 Lin28 或人 LIN28B 的细胞在裸鼠体内形成肿瘤。对细胞因子依赖性 BaF/3 细胞的体外和体内研究表明,LIN28 的过度表达可以促进细胞转化。LIN28和LIN28B被发现在原发性人类肿瘤和人类癌细胞系中过度表达(总体频率约为15%),并且过度表达与LET7家族miRNA的抑制和LET7靶基因的去抑制有关。这些发现提供了一种在人类癌症子集中观察到的 LET7 miRNA 协调抑制的机制,

袁等人(2012)报道LIN28B在小鼠和人胎儿肝脏和胸腺中特异性表达,但在成人骨髓或胸腺中不表达。他们证明,Lin28 的异位表达会重新编程来自成人骨髓的造血干/祖细胞,这赋予它们介导类似于胎儿淋巴细胞生成的多谱系重建的能力,包括 B-1a、边缘区 B、γ/δ T 细胞和自然杀伤 T 细胞的发育增加。

莫莱纳尔等人(2012) 报道称,与其他几种肿瘤实体和正常组织相比,LIN28B 在高风险神经母细胞瘤中显示出基因组畸变和广泛的过度表达。LIN28B 高表达是神经母细胞瘤不良结局的孤立危险因素。LIN28B 通过抑制 LET7 miRNA 发出信号,从而导致神经母细胞瘤细胞中 MYCN(164840) 蛋白表达升高。LIN28B-LET7-MYCN 信号传导阻断正常神经母细胞和神经母细胞瘤细胞的分化。这些发现在小鼠模型中得到了充分的重现,其中交感肾上腺素谱系中的 Lin28b 表达诱导了神经母细胞瘤的发展,其特征是低 Let7 miRNA 水平和高 Mycn 蛋白表达。

在 MYCN 扩增的神经母细胞瘤细胞系中,Powers 等人(2016) 表明,尽管 LET7 被抑制,但 LIN28B 是可有可无的。鲍尔斯等人(2016) 证明扩增疾病中的 MYCN mRNA 水平异常高,足以吸收 LET7,从而协调 LIN28B 的可有可无。作者发现 LET7 的遗传缺失在神经母细胞瘤中很常见,与 MYCN 扩增呈负相关,并且与不良结果孤立相关,这为神经母细胞瘤中染色体缺失模式提供了理论依据。鲍尔斯等人(2016) 提出,LIN28B、MYCN 海绵或遗传丢失对 LET7 的破坏是神经母细胞瘤发展的统一机制,对癌症发病机制具有广泛的影响。

巴萨克等人(2020) 表明,BCL11A(606557) 在人类造血发育过程中在 mRNA 翻译水平上受到调节。尽管 BCL11A 蛋白质合成在发育早期有所减少,但 BCL11A mRNA 仍然与核糖体相关。通过公正的基因组和蛋白质组分析,Basak 等人(2020) 证明,RNA 结合蛋白 LIN28B 的发育表达模式与 BCL11A 相反,可直接与核糖体和 BCL11A mRNA 相互作用。此外,Basak 等人(2020) 表明,BCL11A mRNA 翻译被 LIN28B 通过直接相互作用抑制,与其在调节 LET7 microRNA 中的作用无关,并且 BCL11A 是 LIN28B 介导的胎儿血红蛋白(HbF) 诱导的主要靶标。巴萨克等人。

▼ 分子遗传学

关联有待确认

有关 LIN28B 基因变异与初潮年龄之间可能关联的讨论,请参阅 MENAQ2(612882)。

有关 LIN28B 基因变异与手指长度比之间可能关联的讨论,请参阅 136100。

有关 LIN28B 基因变异与身高之间可能关联的讨论,请参阅 606255。