环指蛋白 40; RNF40

  • BRE1,酿酒酵母,B的同源物;BRE1B
  • 突触蛋白 1 相互作用的无名指蛋白;STARING
  • RB1 结合蛋白,95-KD;RBP95
  • KIAA0661

HGNC 批准的基因符号:RNF40

细胞遗传学定位:16p11.2 基因组坐标(GRCh38):16:30,761,611-30,800,230(来自 NCBI)

▼ 克隆和表达

使用酵母 2 杂交分析来鉴定 突触融合蛋白-1(参见 186590)相互作用蛋白,Chin 等人(2002) 鉴定了大鼠 Rnf40,他们称之为 Staring。通过搜索 EST 数据库,他们鉴定出了人类 RNF40。人RNF40蛋白含有1,001个氨基酸,与大鼠蛋白的氨基酸一致性约为93%。两种蛋白质都有 6 个卷曲螺旋结构域和一个 C 端环指基序。人类和大鼠组织组的 Northern 印迹分析表明 RNF40 普遍表达。蛋白质印迹分析显示 Rnf40 在整个大鼠大脑中表达,它存在于细胞质和膜相关池中。

黄等人(2003) 鉴定了酿酒酵母蛋白 Bre1,它是一种进化上保守的环指蛋白,是体内组蛋白 H2B 泛素化和组蛋白 H3 在 lys4 上甲基化所必需的(有关组蛋白的信息,请参阅 142711)。他们鉴定了 Bre1 的 2 个人类同源物:RNF20(607699) 和 RNF40,他们分别将其命名为 BRE1A 和 BRE1B。

▼ 基因功能

Chin 等(2002) 表明,大鼠 Rpf40 蛋白将大脑富集的 E2 泛素结合酶 Ubch8(603890) 结合并招募到 突触融合蛋白-1,并促进 突触融合蛋白-1 的泛素化和蛋白酶体依赖性降解。这些发现表明 RPF40 是一种新型 E3 泛素蛋白连接酶,其靶向 突触融合蛋白-1,通过泛素蛋白酶体途径进行降解。

黄等人(2003) 表明酿酒酵母 Bre1 蛋白是体内 H2B 泛素化和 H3 lys4 甲基化所必需的。他们确定 Bre1 的 RING 结构域对于这两种修饰都是必需的,large-1(Lge1) 也是如此,large-1(Lge1) 是一种与 Bre1 共纯化的细胞大小控制所需的蛋白质。在缺乏常染色质相关组蛋白变体 H2A.Z、Bre1、Rad6(参见 312180)和 Lge1 的细胞中,它们均对细胞活力至关重要,支持 H2B 泛素化和活性染色质形成中 H2A 取代的冗余功能。突变体分析证明了 Bre1/Lge1 依赖性 H2B 单泛素化在控制细胞大小方面的功能。

伍德等人(2003) 表明,酿酒酵母 Bre1 的环指是 H2B 泛素化、H3 的 lys4 和 lys79 甲基化以及端粒沉默所必需的。染色质免疫沉淀实验表明 Rad6 和 Bre1 均被募集到启动子上。作者确定 Bre1 对于 Rad6 的招募至关重要,并且致力于 Rad6 的转录途径。结果表明,Bre1 可能是指导 Rad6 修饰染色质并最终影响基因表达的 E3 酶。