Rho靶蛋白 2; RTKN2
HGNC 批准基因符号:RTKN2
细胞遗传学定位:10q21.2 基因组坐标(GRCh38):10:62,183,900-62,268,844(来自 NCBI)
▼ 说明
RTKN2 参与细胞对内在凋亡剂的抵抗,包括氧甾醇(Collier et al., 2009)。
▼ 克隆与表达
通过差异显示-PCR分析,Gregorio-King等人(2004)根据RTKN2在HL60人类早幼粒细胞中的上调来鉴定RTKN2,该细胞对氧化甾醇25-羟基胆固醇(25-OHC)的细胞毒性作用具有抵抗力,与对照HL60细胞相比。利用生物信息分析和 RACE,他们克隆了全长人类 RTKN2。推导的 609 个氨基酸的 RTKN2 蛋白包含一个 N 端 RHO(见 165390)结合域和一个中央-白细胞C 氧气底物(PLEK; 173570)同源域。
Collier et al.(2004)报道全长609个氨基酸的人RTKN2蛋白,预测分子量为69.3 kD,与人rhotekin(RTKN;RTKN;602288)。人、大鼠和小鼠 RTKN2 在其 RHO 结合域中含有完全保守的基序(EIMRREG)。生物信息学和 PCR 分析揭示了除了全长 RTKN2(作者指定为变体 1)之外,还有 2 个 RTKN2 选择性剪接变体(指定为变体 2 和 3)。对人体组织的实时PCR分析表明,variant-1在结肠、胸腺和大脑中表达最高;肺和结肠中variant-2的表达最高;Variant-3 的表达在胸腺和脾脏中最高。RTKN2 在人 B 细胞和 T 细胞中表达,但在活化的增殖 T 细胞中 RTKN2 表达显着降低。与正常 B 细胞相比,RTKN2 在 B 细胞恶性肿瘤中的表达没有差异,但与对照 T 细胞相比,它在一些 T 细胞恶性肿瘤中高表达。免疫荧光分析将 RTKN2 定位于转染 CHO 细胞的细胞质和细胞核中。
▼ 基因功能
Gregorio-King等人(2004)利用PCR分析证实,与对照HL60细胞相比,氧甾醇抗性HL60细胞中RTKN2的表达显着上调。
Collier et al.(2009)发现表达RTKN2的HEK293细胞通过激活NF-kappa-B(见164011)通路而对内在凋亡产生抵抗。实时PCR分析显示促凋亡基因BAX(600040)和BIM(BCL2L11;RTKN2(603827)在表达RTKN2的HEK293细胞中表达下调,而抗凋亡基因BCL2(151430)的表达没有变化。相反,敲除RTKN2的人CD4(186940)阳性T细胞对氧甾醇的凋亡作用敏感,并表现出BAX和BIM的上调以及BCL2的下调。
▼ 基因结构
Collier et al.(2004)确定RTKN2基因长约69 kb,包含至少12个外显子。
▼ 测绘
Collier等(2004)通过基因组序列分析,将RTKN2基因定位到染色体10q21.3。