CCR4-非转录复合体,子单元 8;CNOT8
CAF1 样因子; CALIF
PKG 启动子引导的过量生产 2,酿酒酵母,同源物;POP2
HGNC 批准的基因符号:CNOT8
细胞遗传学定位:5q33.2 基因组坐标(GRCh38):5:154,858,249-154,876,792(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
酵母 CCR4-NOT 蛋白复合物是 RNA 聚合酶 II 转录的全局调节因子。它部分由 CCR4(参见 608951)、NOT1 至 NOT5 和 CAF1(也称为 POP2)组成。通过搜索序列数据库,Albert等人(2000)鉴定了编码酵母NOT1、NOT2、NOT3、NOT4和CAF1同源物的人类EST。推导的酵母CAF1的293个氨基酸的人类同源物与人类CAF1(604913)具有75%的氨基酸序列同一性。因此,作者表示,他们已经鉴定了酵母 CAF1 的第二个人类同源物,并将这种新的同源物命名为 CAF1 样因子 CALIF。对人 CALIF、人 CAF1 和酵母 CAF1 的蛋白质序列的比较分析显示 CALIF 和酵母 CAF1 之间的总体同一性为 34%,人 CAF1 和酵母 CAF1 之间的总体同一性为 35%。Albert等人(2000)得出的结论是,仅根据这些数字无法确定CALIF或人CAF1是否是酵母CAF1的真正的人直系同源物。CALIF 和人 CAF1 都比酵母 CAF1 短,酵母 CAF1 包含约 140 个氨基酸的 N 端延伸。Northern 印迹分析在所有测试的人体组织中检测到主要的 2.5-kb CALIF 转录物,即脑、心脏、肺、肝、肾、小肠、结肠、脾、胸腺、外周血白细胞、骨骼肌和胎盘。与人类 NOT1、NOT2(604909)和 NOT3 的表达一样,CALIF 在脑、肾和胎盘中表达量较高,而在骨骼肌和结肠中表达量很低。
Fidler et al.(1999)发现预测的292个氨基酸的人类POP2蛋白与小鼠Caf1、线虫CAF1和酵母POP2分别具有75%、44%和38%的序列同一性。Northern 印迹分析显示,在所有测试的组织中,人 POP2 均以大约 2.5 kb 的 mRNA 形式表达。
▼ 基因功能
Albert等人(2000)利用酵母2-杂交实验证明重组CALIF可以与酵母NOT1、N端截短的人NOT1蛋白(604917)、人NOT3(604910)和酵母CCR4相互作用。免疫沉淀研究表明 CALIF 和 NOT3 在体内发生物理结合。作者认为 CALIF 是人类 CCR4-NOT 复合体的真正组成部分。他们发现重组 CALIF 不能补充酵母 caf1 无效突变所赋予的咖啡因敏感表型。
▼ 测绘
5q-综合征(153550)是一种与5q31-q33区域间质缺失相关的骨髓增生异常综合征。Fidler et al.(1999)发现人类POP2基因位于该区域。他们得出的结论是,POP2 是与 5q 综合征发生相关的肿瘤抑制基因的候选基因。