含有三联基序的蛋白质 40; TRIM40
环指蛋白 35; RNF35
HGNC 批准的基因符号:TRIM40
细胞遗传学定位:6p22.1 基因组坐标(GRCh38):6:30,136,140-30,148,735(来自 NCBI)
▼ 说明
TRIM40 是 NF-kappa-B(参见 164011)活性的负调节因子(Noguchi et al., 2011)。
▼ 克隆与表达
Noguchi等人(2011)通过对小鼠小肠cDNA文库和人胃cDNA文库进行PCR克隆,克隆了小鼠和人TRIM40。对小鼠组织进行蛋白质印迹分析,检测到 Trim40 的表观分子质量为 36.5 kD。在小肠中检测到最高表达,其次是小脑和心脏。TRIM40 在人类和小鼠癌细胞系中也有不同的表达。
▼ 基因功能
利用酵母2-杂交分析和体内结合测定,Noguchi等人(2011)检测到了小鼠Trim40和Nedd8(603171)之间的非共价相互作用。Trim40 也通过 Nedd8 缀合进行共价修饰。Trim40促进Nedd8与IKK-γ(IKBKG;300248)以剂量依赖的方式,导致I-kappa-B-α(NFKBIA;164008)并抑制 NF-kappa-B p65 子单元(RELA; 164014)、核NF-κ-B活性和细胞生长。相比之下,TRIM40 的敲除促进了 NF-kappa-B 活性和细胞生长。缺少 RING Finger 结构域的 Trim40 突变体不会影响 NF-kappa-B 活性。
▼ 测绘
Hartz(2016)根据TRIM40序列(GenBank AF489517)与基因组序列(GRCh38)的比对,将TRIM40基因定位到染色体6p22.1。