Y框结合蛋白3;YBX3

冷休克域蛋白 A; CSDA
冷休克域蛋白 A1; CSDA1
DNA 结合蛋白 A; DBPA

HGNC 批准的基因符号:YBX3

细胞遗传学定位:12p13.2 基因组坐标(GRCh38):12:10,699,089-10,723,323(来自 NCBI)

▼ 说明

冷休克结构域(CSD)蛋白,如CSDA,其特征是具有大约100个氨基酸的高度保守的中心结构域,与细菌冷休克蛋白同源(Sakura等人总结,1988)。

▼ 克隆与表达

为了鉴定编码DNA结合蛋白(DBPs)的cDNA,Sakura等人(1988)筛选了含有人表皮生长因子受体(EGFR;EGFR)的DNA片段的人胎盘cDNA表达文库。131550)增强子或人c-erbB2(164870)启动子。他们分离出了编码DBPA和DBPB(154030)的cDNA。DBPA cDNA 由 2 种形式组成,其区别在于内部 207 bp 缺失。HeLa 细胞 RNA 的 Northern 印迹分析检测到主要的 2.5-kb DBPA 转录本和次要的 2.3-kb DBPA 转录本。推导的 DBPA 和 DBPB 蛋白共享一个中心区域,其中 2 个蛋白的 109 个氨基酸中有 100 个是相同的。

Kudo等人(1995)通过筛选与人白唾液酸蛋白(182160)启动子结合的蛋白质,孤立出编码DBPA和DBPB的全长人cDNA。推导的 342 个氨基酸的 DBPA 蛋白具有冷激结构域和 DNA 结合结构域。人体组织的 Northern 印迹分析表明骨骼肌和心脏中 DBPA 转录水平最高。免疫荧光检测HeLa细胞细胞质和细胞核中DBPA蛋白的表达。

Coles 等人(1996)孤立地通过筛选能够与人 GMCSF(138960)启动子中的阻遏元件结合的蛋白质,孤立出了 DBPA 和 DBPB cDNA。他们确定,与之前报道的 DBPA cDNA 序列相比,他们的 DBPA cDNA 具有变异序列,从而推导出 372 个氨基酸的蛋白质,其中有 4 个氨基酸取代和 30 个氨基酸的 C 端延伸。该变体 DBPA 的过度表达导致 GMCSF 启动子的抑制。

▼ 基因结构

Kudo et al.(1995)分离出DBPA基因组序列,发现其包含10个外显子,跨度24 kb;编码 69 个氨基酸的外显子 6 是选择性剪接的。

▼ 测绘

Kudo et al.(1995)通过原位杂交将CSDA基因定位到染色体12p13.1。

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