蛋白酪氨酸磷酸酶样(脯氨酸代替催化精氨酸),成员 B; PTPLB
3-羟酰辅酶A脱水酶2;HACD2
极长链 3-羟酰辅酶A 脱水酶 2
HGNC 批准的基因符号:HACD2
细胞遗传学位置:3q21.1 基因组坐标(GRCh38):3:123,491,554-123,585,053(来自 NCBI)
▼ 说明
长链脂肪酸(LCFA) 可以通过内质网(ER) 膜结合酶在缩合、还原、脱水和进一步还原的 4 步循环中转化为极长链脂肪酸(VLCFA),并添加 2 个碳每个周期。PTPLB 属于催化 VLCFA 合成脱水步骤的酶家族(Ikeda 等人,2008 年总结)。
▼ 克隆与表达
Wang 等人使用 BAP31(BCAP31;300398)作为诱饵,对 HeLa 细胞 cDNA 表达文库进行酵母分裂泛素分析,然后进行 EST 数据库分析以及 5-prime 和 3-prime RACE(2004)克隆PTPLB。推导的 254 个氨基酸蛋白具有 4 个跨膜结构域、胞质 N 和 C 末端以及 C 末端 ER 保留信号(KKFE)。它与蛋白质酪氨酸磷酸酶具有显着的相似性,但催化活性所需的保守精氨酸被改变为脯氨酸,使 PTPLB 失活。PTPLB 与小鼠 Ptplb 具有 96% 的氨基酸同一性,与人 PTPLA(610467) 具有 66% 的同一性。Northern blot 分析检测到 4.3 kb PTPLB 转录物在所有 16 个人体组织中均有不同表达,其中在睾丸、脾脏、前列腺、结肠和心脏中表达最高,在肾脏、胎盘、大脑和肺中表达最低。表位标记的 PTPLB 与转染 COS-1 细胞内质网中的 BAP31 共定位。
▼ 基因功能
Wang 等人使用免疫共沉淀分析(2004) 证实 PTPLB 与 ER 中的 BAP31 短暂相互作用。蛋白酶体的抑制增加了 PTPLB 在失活蛋白酶体的点状分布特征中的检测和积累。小鼠胚胎干细胞中 Bap31 的敲低使荧光标记的 PTPLB 不稳定。
池田等人(2008) 发现荧光标记的人 HACD2 的表达挽救了缺乏 3-羟酰基辅酶 A 脱水酶活性的酵母菌株的致死表型,并部分恢复了含有神经酰胺(C26 VLCFA)的鞘脂的合成。从转染的 HeLa 细胞中纯化的 HACD2 亲和力将 3-羟基棕榈酰基-CoA 转化为 2,3-反式十六烯酰基-CoA。HACD 酶家族的其他成员,包括 HACD1(PTPLA)、HACD3(PTPLAD1; 615940) 和 HACD4(PTPLAD2; 615941),显示出相同的活性,但各自具有不同的亲和力和反应速率。转染的 HEK293T 细胞的免疫共沉淀分析表明,HACD2 优先与几种 FA 缩合酶(参见 611813)相互作用,很可能在 FA 延伸酶复合物中。
▼ 基因结构
王等人(2004)确定PTPLB基因含有6个外显子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Wang 等人(2004) 将 PTPLB 基因对应到染色体 3。
Hartz(2014) 根据 PTPLB 序列(GenBank AF052159) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 PTPLB 基因对应到染色体 3q21.1。