蛋白质磷酸酶 6,催化子单元;PPP6C
HGNC 批准基因符号:PPP6C
细胞遗传学定位:9q33.3 基因组坐标(GRCh38):9:125,146,573-125,189,803(来自 NCBI)
▼ 说明
丝氨酸和苏氨酸残基上蛋白质的可逆磷酸化是调节多种细胞内过程的重要生化事件。磷酸化状态由丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白激酶和蛋白磷酸酶活性的良好控制平衡决定。PPP6C 是人丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶-6 的催化子单元(Bastians and Ponstingl, 1996)。
▼ 克隆与表达
Bastians 和 Ponstingl(1996)使用基于同源性的 RT-PCR 方法克隆了编码 PPP6C 的 cDNA。预测的 305 个氨基酸蛋白与 PPP4C(602035)、PPP2A 亚型(参见 176915 和 176916)、S. pombe ppe1 和 S. cerevisiae Sit4 具有 59%、56 至 57%、68% 和 61% 的同一性,分别。丝氨酸/苏氨酸 PPP 中不变且对于催化活性至关重要的所有 42 个氨基酸都存在于 PPP6C 中。Northern blot分析显示PPP6C在所有16个人体组织中均表达为1.8 kb、4.2 kb和4.7 kb 3个转录本。睾丸、心脏和骨骼肌中的表达水平最高,胎盘、肺和肾脏中的表达水平最低。免疫印迹分析在人心肌和公牛睾丸的裂解物中检测到 35 kD PPP6C 蛋白。
▼ 基因功能
Bastians and Ponstingl(1996)证明PPP6C可以补充酿酒酵母Sit4和S. pombe ppe1基因的突变,表明PPP6C是酵母Sit4和ppe1的功能同源物。由于Sit4是细胞周期从G1到S的转变所必需的,而ppe1参与细胞形状控制和有丝分裂,Bastians和Ponstingl(1996)认为PPP6C在细胞周期调节中发挥作用。
Stefansson 和 Brautigan(2006)利用免疫共沉淀和蛋白质下拉分析表明,表位标记的 PP6R1(SAPS1; 610875)、PP6R2(SAPS2;610877)、PP6R3(SAPS3;610879)结合内源性PPP6C,但不结合PPP2CA。PP6R1 的 SAPS 结构域足以与 PPP6C 关联。含有 PPP6C 和 PP6R1 或 PP6R2 的免疫沉淀物显示出针对测试蛋白的磷酸酶活性,并且该活性被丝氨酸/苏氨酸磷酸酶抑制剂冈田酸抑制。Stefansson and Brautigan(2006)发现PPP6C和PP6R1或PP6R2与I-kappa-B-ε(IKBE或NFKBIE)相关;HeLa 细胞中的 604548),PP6R1 或 PPP6C 的敲低增强了内源性 IKBE 响应 TNF-α(191160)的降解。
▼ 测绘
通过荧光原位杂交,然后在 YAC 重叠群上进行精细定位,Bastians 等人(1997)将 PPP6C 基因定位到染色体 Xq22.3。然而,Hartz(2009)根据Bastians等(1997)(GenBank X92972)提交的PPP6C序列与基因组序列(build 36.1)的比对,将PPP6C基因对应到染色体9q33.3。与 PPP6C 高度相关的序列对应到染色体 Xq22.3。