DNMT1 相关蛋白 1;DNMAP1
DNA 甲基转移酶 1 相关蛋白 1;DMAP1
HGNC 批准的基因符号:DMAP1
细胞遗传学定位:1p34.1 基因组坐标(GRCh38):1:44,213,471-44,220,673(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Rountree等人(2000)使用DNMT1(126375)的前1,125个氨基酸作为诱饵,在小鼠大脑和胚胎cDNA文库的酵母2-杂交筛选中鉴定出DMAP1蛋白。他们从成人大脑 cDNA 文库中克隆了 DMAP1 cDNA。467 个氨基酸的 DMAP1 蛋白与同源 小鼠蛋白具有约 98% 的氨基酸保守性,并包含假定的核定位信号和预测的卷曲螺旋结构域。
▼ 基因功能
真核细胞在其基因组复制过程中面临着重大的机械挑战,因为新合成的 DNA 必须快速组装成正确的染色质构型以促进或抑制转录。真核基因组由转录活性域和非活性域组成,通常分别以常染色质和异染色质区域为特征。常染色质区域往往在 S 期早期复制,其一般特征是存在活跃转录或转录就绪基因、缺乏 DNA 甲基化以及含有超乙酰化组蛋白的开放染色质构型。或者,异染色质区域(包括着丝粒周围和端粒重复)、失活的 X 染色体和选定印记基因的转录沉默等位基因与缺乏转录活性、重 CpG 甲基化和具有低乙酰化组蛋白的致密染色质有关,并且倾向于复制处于S期后期。在这些染色质构型中,甲基化表观遗传“标记”的遗传似乎是转录沉默的重要组成部分。DNA 甲基化可通过多种转录抑制复合物促进转录沉默,其中包括甲基 CpG 结合域蛋白(例如 MBD1;156535)和组蛋白脱乙酰酶(例如HDAC1;601241)。Rountree等(2000)表明,维持哺乳动物DNA甲基化的主要酶DNMT1(126375)也可以建立由DNMT1、HDAC2(605164)和DMAP1组成的抑制性转录复合物。DMAP1 直接与 DNMT1 的前 120 个氨基酸相互作用。Rountree et al.(2000)证明DMAP1可以孤立于组蛋白脱乙酰酶活性抑制转录。DNMT1、HDAC2和DMAP1在体内形成复合物,DMAP1可以直接与转录辅阻遏物TSG101(601387)相互作用。DMAP1 通过在整个 S 期与 DNMT1 的远 N 末端相互作用来靶向复制灶,而 HDAC2 仅在 S 期后期加入 DNMT1 和 DMAP1,为复制后异染色质中组蛋白如何脱乙酰化提供了平台。因此,DNMT1不仅维持DNA甲基化,而且还可以在DNA复制过程中以可遗传的方式直接将转录抑制染色质靶向基因组。
为了阐明DAXX(603186)在IFNA(147660)/IFNB(147640)介导的B细胞发育和凋亡抑制中的作用,Muromoto et al.(2004)使用酵母2-杂交筛选并将DMAP1鉴定为DAXX 相互作用蛋白。DAXX 突变体的免疫沉淀和蛋白质印迹分析表明 DAXX 的 N 末端与 DMAP 的 C 末端相互作用。免疫印迹分析和共聚焦显微镜证明 DAXX-DMAP 复合物与细胞核中的 DNMT1 相互作用。DAXX或DMAP1的短暂表达导致糖皮质激素受体(GCCR)的抑制;138040)介导的转录。Muromoto et al.(2004)得出结论,DAXX和DNMT1之间的连接在细胞核中形成了有效的转录抑制复合物。
NuA4 组蛋白乙酰转移酶(HAT)复合物负责酵母中组蛋白 H4(见 602822)和 H2A(见 613499)N 末端尾部的乙酰化。其催化子单元Esa1与人TIP60(HTATIP; 601409)。Doyon等人(2004)利用亲和纯化、蛋白质印迹分析、细胞分级分离、免疫沉淀和质谱分析,发现TIP60及其剪接变体TIP60B/PLIP是多子单元NuA4复合物的一部分,在多个细胞中具有HAT活性。人类细胞系。他们鉴定了 12 个酵母 NuA4 子单元中的 11 个的人类同源物,包括 DMAP1。DMAP1 也存在于包含 SWI2(SMARCA2;600014)相关的ATP酶活性。
Fazzio et al.(2008)利用RNA干扰小鼠胚胎干(ES)细胞,发现Tip60-p400(EP400;EP400;606265) HAT 和核小体重塑复合物(包括 Dmap1)引起相同的表型。与在球形 3 维集落中生长的正常 ES 细胞不同,耗尽任何 7 个 Tip60-p400 HAT 成分的 ES 细胞表现出扁平且拉长的形态,具有单层生长和减少的细胞与细胞接触。这些敲低细胞继续循环,S期细胞减少,G2期细胞增加。Tip60-p400 HAT 成分敲低的效果是 ES 细胞所特有的,因为在小鼠胚胎成纤维细胞中敲低后观察到的变化可以忽略不计。