含有卷曲螺旋结构域的蛋白质 88B; CCDC88B
钩相关蛋白 3;HKRP3
内质网应激诱导的 GPR78 相互作用蛋白;GIPIE
HGNC 批准的基因符号:CCDC88B
细胞遗传学定位:11q13.1 基因组坐标(GRCh38):11:64,340,204-64,357,534(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
基于HKRP1(CCDC88A)序列的计算机分析;609736)作为查询,Simpson 等人(2005)鉴定了一个同源基因,他们将其命名为 HKRP3,编码一个假定的 1,607 个氨基酸的蛋白质。Enomoto等人(2006)也基于克隆FLJ00354描述了HKRP3,其编码1,476个氨基酸的蛋白质。数据库分析表明该蛋白优先在造血系统中表达。
Matsushita et al.(2011)通过对出生后和成人小鼠组织进行RT-PCR,发现Gipie表达无处不在,在出生后肝脏、脾脏、心脏以及成人骨髓和心脏中表达量最高。Western blot 分析在人脐静脉内皮细胞(HUVEC)以及人骨髓细胞和单核细胞白血病细胞系中检测到表观分子量为 170 kD 的人 GIPIE,但在上皮细胞、间质细胞或肿瘤细胞系中未检测到。免疫荧光分析显示Gipie在小鼠心脏内皮血管和血管内皮中表达。GIPIE 与 HUVEC 中内质网(ER)和高尔基体的标记物共定位。
Kennedy等人(2014)利用整体原位杂交和共聚焦显微镜发现,小鼠Ccdc88b仅在造血组织中表达,特别是在T淋巴细胞和骨髓细胞中表达。
▼ 测绘
Hartz(2011)根据CCDC88B序列(GenBank AK090436)与基因组序列(GRCh37)的比对,将CCDC88B基因定位到染色体11q13.1。
▼ 基因功能
Matsushita等人(2011)通过对HUVEC和U937人单核细胞瘤细胞系进行免疫沉淀分析,发现GIPIE与ER伴侣蛋白GPR78(606921)相互作用。突变分析表明,GIPIE 的 C 端结构域是其与 GPR78 相互作用所必需的。多种内质网应激源诱导HUVECs中GIPIE的表达,GIPIE与GPR78的相互作用稳定了GPR78与IRE1(ERN1; 604033),抑制IRE1诱导的JNK(见601158)通路的上调和ER应激诱导的细胞凋亡的诱导。球囊损伤后大鼠颈动脉新生内皮细胞和新内膜的细胞质中 Gipie 表达增加。Matsushita et al.(2011)得出结论,GIPIE/GPR78 相互作用控制 IRE1-JNK 信号传导并保护内皮细胞免受 ER 应激诱导的细胞凋亡。
▼ 动物模型
Kennedy等人(2014)通过对化学诱变小鼠进行全基因组筛选,鉴定失活后可预防实验性脑型疟疾(ECM)的基因,发现了影响Ccdc88b基因内含子21供体剪接位点第二个核苷酸的突变。该突变完全废除了外显子 21 的正常剪接。相反,使用外显子 21 和内含子 21 边界上游的隐蔽剪接位点导致移码和氨基酸 1286 处的过早终止,产生了一种可能无功能的蛋白质,缺乏 C 的一部分-末端卷曲螺旋结构域和细胞器结合结构域。突变小鼠的脾脏 Cd4(186940)和 Cd8(见 186910)T 细胞数量正常,但幼稚 T 细胞数量较多,增殖和细胞因子(例如 TNF)的产生较低。191160)响应Cd3(见186790)/Cd28(186760)共刺激。突变小鼠在感染伯氏疟原虫后抵抗 ECM 的诱导。Kennedy等(2014)指出人类CCDC88B定位的染色体11q13与炎症性疾病的易感性相关,并提出CCDC88B是T细胞成熟和炎症功能的重要调节因子。