环指蛋白125; RNF125

  • 激活筛选中鉴定出 T 细胞环蛋白;TRAC1

HGNC 批准的基因符号:RNF125

细胞遗传学位置:18q12.1 基因组坐标(GRCh38):18:32,018,584-32,090,755(来自 NCBI)

▼ 描述

TRAC1 是一种环指 E3 泛素连接酶,在 CD4(186940) 阳性和 CD8(参见 186910)阳性 T 细胞中表达。它参与 T 细胞激活(Zhao et al., 2005)。

▼ 克隆和表达

通过筛选表达 CD69(107273) 的 T 细胞系来鉴定参与 T 细胞受体(TCR;参见 186880) 诱导的细胞激活的新分子,Zhao 等人(2005) 分离出编码 RNF125 的 cDNA,他们将其称为 TRAC1。该蛋白由 232 个氨基酸组成,包含 N 端环指结构域。RT-PCR 分析检测到在骨髓、脾脏和胸腺中表达最高,在大多数其他检查组织中表达弱至中等。T 细胞中的表达比 B 细胞中高得多。

▼ 基因功能

通过以TRAC1为诱饵的酵母2-杂交筛选,然后进行E2/E3结合测定,Zhao等人(2005) 确定 UBCH7(UBE2L3; 603271) 和 UBCH8(UBE2L6; 603890) 为 TRAC1 结合伴侣。然而,功能和蛋白质印迹分析表明,在 UBC4(UBE2D2;602962)、UBCH5C(UBE2D3;602963) 或 UBC13(UBE2N;603679)/UEV1A(UBE2V1;602995) 存在的情况下,TRAC1 具有 E3 活性,但在 UBCH7 存在的情况下,TRAC1 不具有 E3 活性。突变分析证实TRAC1的E3泛素连接酶活性依赖于完整的RING指,但不需要C末端。反义治疗可阻断 TRAC1 表达并抑制 T 细胞系中抗 TCR 诱导的 CD69 上调。赵等人(2005) 得出结论,TRAC1 在 TCR 信号通路中发挥正向调节作用。

Arimoto 等人使用酵母 2-杂交分析(2007) 将 RNF125 分离为具有 E3 连接酶活性的泛素样蛋白,可与 E2 酶 UBCH8 相互作用。此外,他们发现RIGI(DDX58;609631)与UBCH8和RNF125相互作用。RIGI 与 RNF125 的相互作用需要 RIGI 的 CARD 结构域和 C 端区域。小干扰RNA下调RNF125可降低RIGI水平并阻止RIGI多泛素化。RNF125 的 cys72 和 cys75 突变为 ala,消除了其介导 RIGI 泛素化的能力。IFNA(147660) 上调 RNF125、UBCH5(UBE2D1; 602961) 和 RIGI 的表达。RNF125 还具有 MDA5(IFIH1; 606951) 和 IPS1(609676) 的泛素缀合 E3 连接酶活性,从而抑制这些蛋白质的信号传导活性,如荧光素酶分析所示。有本等人。

▼ 基因结构

Giannini 等人(2008)确定RNF125基因含有6个外显子。

▼ Mapping

Gross(2016) 根据 RNF125 序列(GenBank BC012021) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 RNF125 基因对应到染色体 18q12.1。

▼ 分子遗传学

Tenorio 等人通过 SNP 阵列筛选了西班牙过度生长综合症登记处的 270 个家庭,但没有对其疾病进行分子特征分析(2014) 鉴定出 1 名患者的 18 号染色体上有 9 Mb 的从头缺失,其中包含多个候选基因,包括 RNF125 和 RNF138(616319)。通过筛查所有 270 个家族中 RNF125 和 RNF138 基因的突变,他们在来自 3 个家族的 5 名患者中发现了 RNF125 基因(610432.0001-610432.0003) 中的 3 个杂合错义突变(参见 TNORS,616260)。在 1 名先证者中,错义突变是从头开始的,而在另外 2 名先证者中,在他们受影响的母亲中观察到了突变。在健康西班牙对照的 600 条染色体或西班牙对照的 350 条外显子组中未发现突变。千人基因组计划数据库中未发现这 3 个变体;在Exome Variant Server数据库中,未发现M112I突变(610432.0001),另外2个变异在13,005条染色体中的1条(0.0077%)中发现。与对照组相比,所有患者的 RNF125 mRNA 水平均较低。特诺里奥等人(2014) 在 RNF125 参与的 3 个主要途径中应用了全基因组表达阵列和定量 RT-PCR 确认:RIGI-IPS1、PI3K(参见 171834)-AKT(参见 164730)和干扰素信号传导。他们证明,RNF125 的单倍体不足会导致 RIGI、IPS1 和 MDA5 的上调以及 3 个主要途径的错误调节。与对照组相比,所有患者的 RNF125 mRNA 水平均较低。特诺里奥等人(2014) 在 RNF125 参与的 3 个主要途径中应用了全基因组表达阵列和定量 RT-PCR 确认:RIGI-IPS1、PI3K(参见 171834)-AKT(参见 164730)和干扰素信号传导。他们证明,RNF125 的单倍体不足会导致 RIGI、IPS1 和 MDA5 的上调以及 3 个主要途径的错误调节。与对照组相比,所有患者的 RNF125 mRNA 水平均较低。特诺里奥等人(2014) 在 RNF125 参与的 3 个主要途径中应用了全基因组表达阵列和定量 RT-PCR 确认:RIGI-IPS1、PI3K(参见 171834)-AKT(参见 164730)和干扰素信号传导。他们证明,RNF125 的单倍体不足会导致 RIGI、IPS1 和 MDA5 的上调以及 3 个主要途径的错误调节。

▼ 等位基因变异体(3 个选定示例):

.0001 TENORIO 综合征
RNF125、MET112ILE
在一名患有过度生长、大头畸形和智力障碍综合征(TNORS; 616260) 的 12 岁西班牙男孩中,Tenorio 等人(2014) 鉴定了 RNF125 基因中的杂合 c.336G-A 转变,导致 met112 到 ile(M112I) 取代。在他受影响的母亲中也发现了这种突变。在来自健康西班牙对照的 600 条染色体或来自西班牙对照的 350 个外显子组中未发现该基因,并且在 1000 个基因组计划或外显子组变异服务器数据库中也不存在该基因。先证者还患有持续发作的角膜炎、结膜炎、边缘炎、浆液性中耳炎和肺炎。

.0002 TENORIO 综合征
RNF125、SER163LEU
对于一名患有过度生长、大头畸形和智力障碍综合征(TNORS; 616260) 的 19 岁西班牙男子,Tenorio 等人(2014) 在 RNF125 基因中发现了一个从头杂合的 c.488C-T 转变,导致 ser163 到 leu(S163L) 的取代。在健康西班牙对照的 600 条染色体或西班牙对照的 350 条外显子组中未发现该突变。它不存在于千个基因组计划数据库中,但在外显子组变异服务器数据库的 13,005 条染色体中的 1 条(0.0077%)中发现了它。患者还出现数次雷诺现象、干性结膜炎和复发性口疮性口炎。

.0003 TENORIO 综合征
RNF125、ARG174CYS
在一名患有过度生长、大头畸形和智力障碍综合征(TNORS; 616260) 的 11 岁西班牙女性中,Tenorio 等人(2014) 鉴定了 RNF125 基因中的杂合 c.520C-T 转换,导致 arg174 到 cys(R174C) 取代。她受影响的母亲也发现了这种突变。在健康西班牙对照的 600 条染色体或西班牙对照的 350 条外显子组中未发现该基因。它不存在于千个基因组计划数据库中,但在外显子组变异服务器数据库的 13,005 条染色体中的 1 条(0.0077%)中发现了它。