EMG1 N1 特异性假尿苷甲基转移酶; EMG1

  • 有丝分裂生长必需的 1,酿酒酵母
  • 核仁必需蛋白 1 的同源物;NEP1
  • C2F

HGNC 批准的基因符号:EMG1

细胞遗传学位置:12p13.31 基因组坐标(GRCh38):12:6,970,912-6,997,427(来自 NCBI)

▼ 描述

EMG1 在前 18S rRNA 和小核糖体亚基组装的加工中发挥作用(Liu 和 Thiele,2001),并且可能在核糖体生物发生过程中的甲基化中发挥作用(Eschrich 等,2002)。

▼ 克隆和表达

通过应激反应基因表达和功能研究,Liu 和 Thiele(2001) 鉴定了酵母 Emg1,它在热休克和其他应激条件下受到短暂抑制。数据库分析鉴定出人和小鼠 EMG1,分别编码 239 和 244 个氨基酸的推导蛋白。生化分级分离研究将 Emg1 定位于细胞质和细胞核部分。荧光显微镜将 Emg1 定位于整个细胞,但具有清晰的核信号。

埃施里奇等人(2002) 表征了白色念珠菌、酿酒酵母和人类 EMG1 蛋白,他们将其称为 NEP1。荧光显微镜将人类 EMG1 定位于 HeLa 细胞的核仁。

Armistead 等人使用 RNA 印迹分析(2009) 检查了正常成人组织中的 EMG1 表达,并在心脏、肝脏和胃中检测到最强的信号,其次是肾脏和大脑。通过半定量 PCR 分析比较成人和胎儿组织中的 EMG1 表达,发现大多数成人组织中的表达相似或更高,但大脑除外,胎儿的表达高于成人。

▼ 测绘

Eschrich 等人的地图(2002) 指出 EMG1 基因定位于染色体 12p13。

▼ 基因功能

Liu 和 Thiele(2001) 表明,酵母 Emg1 是生存所必需的,并且小鼠 Emg1 的表达可以补充其损失。通过缺失图谱、酵母 2-杂交分析和免疫共沉淀,他们表明酵母 Emg1 与酵母 Nop14(611526) 的中心结构域相互作用。酵母 2 杂交分析证明了小鼠 Emg1 和人 NOP14 之间的相互作用。在存在 Nop14 的情况下,Emg1 定位于细胞核和细胞质部分,但仅在 Nop14 耗尽的细胞中定位于细胞质部分。条件性 Emg1 双突变酵母对氨基糖苷类抗生素过敏,这会影响蛋白质翻译,表明 Emg1 可能在 RNA 加工或核糖体生物发生中发挥作用。条件 Emg1 双突变酵母中核糖体 RNA 转录本加工的脉冲追踪标记显示加工缺陷,其特征是 35S 前体水平增加,18S rRNA 及其 20S 前体水平降低。进一步的研究确定加工缺陷主要发生在20S成熟阶段。在 Nop14 条件突变酵母中观察到类似的表型表明,Nop14 和 Emg1 在导致 18S rRNA 成熟的相同途径中发挥作用,但对于 25S rRNA 加工来说是可有可无的。细胞核糖体的蔗糖密度梯度分析和多核糖体径流研究表明,与 60S 相比,Emg1 和 Nop14 条件突变体的 40S 亚基水平显着降低。

埃施里奇等人(2002) 孤立证明人类 EMG1 补充了酵母 Emg1 的基本功能,并且 Emg1 对于 40S 核糖体亚基的生物发生至关重要。他们在温度敏感的 Emg1 四重突变酵母中分离出 MAT2A 作为致死表型的多拷贝抑制因子。通过增加 S-腺苷甲硫氨酸合成酶(SAMS) 恢复 Emg1 功能表明 Emg1 突变等位基因在 SAMS 依赖性功能方面存在缺陷,并且 Emg1 参与核糖体生物发生过程中的甲基化。

▼ 分子遗传学

使用来自 11 个患有 Bowen-Conradi 综合征的加拿大 Hutterite 家族(211180) 的 DNA 样本,Armistead 等人(2009) 分析了染色体 12p13.3 上先前绘制的 1.9-Mbp 间隔内的 35 个候选基因(Lamont 等人,2005),并鉴定了 EMG1 基因(611531.0001) 中与疾病完全分离的错义突变的纯合性。这种突变会破坏蛋白质最高度保守区域的 EcoRV 位点,但在 414 个非 Hutterite 等位基因中未发现这种突变。

▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):.

0001 BOWEN-CONRADI 综合征
EMG1、ASP86GLY
Armistead 等人在来自 11 个患有 Bowen-Conradi 综合征(BWCNS;211180)的加拿大 Hutterite 家族的受影响个体中(2009) 鉴定了 EMG1 基因中 400A-G 转变的纯合性,导致在完全保守的残基处发生 asp86 到甘氨酸(D86G) 的取代,预计会破坏 EcoRV 位点。在 414 个非哈特派等位基因中未发现该突变。对成纤维细胞的研究表明,与正常成纤维细胞相比,受 BWCNS 影响的患者的 EMG1 水平显着降低,尽管患者成纤维细胞并未完全缺乏 EMG1。幼仓鼠肾(BHK) 细胞中 D86G 突变 EMG1 的过度表达导致可溶性 EMG1 水平降低,酵母 2 杂交分析表明,D86G 突变增加了 EMG1 亚基的二聚化,表明 EMG1 的聚集导致蛋白质水平降低。