SKI-INTERACTING 蛋白质; SKIIP

  • SKIP
  • BX42,果蝇,
  • SNW1的同源物

HGNC 批准的基因符号:SNW1

细胞遗传学位置:14q24.3 基因组坐标(GRCh38):14:77,717,598-77,761,155(来自 NCBI)

▼ 描述

SKIIP 具有核受体共激活剂的特性,它与核受体相互作用并增强配体激活的转录。它还与剪接体成分相互作用,表明它可能作为耦合因子发挥作用,将核受体依赖性转录与 RNA 加工联系起来(Zhang 等人的总结(2003))。

▼ 克隆和表达

果蝇 Bx42 核蛋白响应类固醇激素蜕皮激素而与多线染色体上的特定泡芙子集结合,并被认为在染色质调节中发挥作用。福尔克等人(1996) 克隆了盘基网柄菌属基因 snwA,该基因包含 SH2 基序并与 Bx42 有同源性。通过在 EST 数据库中搜索 snwA 同源物,Folk 等人(1996) 鉴定了编码一种蛋白质的部分人类 cDNA,他们将其命名为 SNW1。Dahl 等人使用 2 杂交筛选来鉴定与 SKI(164780) 逆转录病毒癌基因相互作用的蛋白质(1998) 孤立分离出人类 SNW1 cDNA。他们将基因 SKIP 称为“SKI 相互作用蛋白”。预测的 536 个氨基酸蛋白与 Bx42 具有近 60% 的氨基酸同一性。

Baudino 等人使用 Northern blot 分析(1998) 发现人类 SKIP 作为 2.2 kb mRNA 广泛表达。

张等人(2003) 在 SKIP 的 C 末端发现了一个核定位信号。内源性SKIP在COS-7、HeLa、SaOS-2和大鼠骨肉瘤细胞中显示出严格的核定位,并且在这些细胞中以精细的点状亚核模式分布。

▼ 基因功能

Dahl 等人(1998) 在体外和体内试验中发现 SKIP 与 SKI 相关。通过分析突变型 SKI 蛋白,他们确定 SKIP 与 SKI 的高度保守区域相互作用,而该区域是转化活性所需的。细胞分级分离和免疫荧光研究表明,SKIP 与 SKI 一样,存在于细胞核内。然而,SKI 和 SKIP 的定位模式并不相同,这表明这两种蛋白并不总是彼此结合,并且它们的关联可能受到其他因素的调节。

Baudino 等人使用酵母 2-杂交筛选(1998) 鉴定出 SKIP 或 NCoA-62(“核受体共激活剂,62-kD”)是一种与维生素 D 受体(VDR; 601769) 的配体结合结构域形成直接蛋白质-蛋白质接触并与类视黄醇受体相互作用的蛋白质。SKIP 表达增强了维生素 D、视黄酸、雌激素和糖皮质激素介导的基因表达。这些作者认为 SKIP 是一组转录共激活蛋白之一,其功能是促进维生素 D 和其他核受体介导的转录途径。

张等人使用各种提取程序(2003) 表明内源性 SKIP 与大鼠和人骨肉瘤细胞的核基质紧密相关。染色质免疫沉淀分析表明,Skip 与 Vdr 共定位于维生素 D 反应元件(VDRE) 上。交联和免疫沉淀实验表明,在用活化的维生素 D(1,25-(OH)2D3) 处理后,内源性 Vdr、Src1(NCOA1; 602691) 和 Skip 与大鼠 24-羟化酶(CYP24A1; 126065) 启动子中的 VDRE 相关。蛋白质下拉分析、SDS-PAGE 和质谱分析表明,人 SKIP 与 HeLa 细胞核提取物中剪接体的多种成分相互作用。COS-7 细胞中显性失活 SKIP 的表达会干扰源自生长激素(GH1; 139250) 小基因的转录物对 1,25-(OH)2D3 处理的响应的正确剪接。张等人(2003) 得出结论,SKIP 将 VDR 介导的转录与 RNA 剪接结合起来。

眼咽肌营养不良症(OPMD; 164300) 是由编码多聚(A) 结合蛋白 2(PABP2; 602279) 的聚丙氨酸束的 GCG 三核苷酸重复序列的短暂扩展引起的。金等人(2001) 建立了表达人 PABP2 的稳定小鼠骨骼肌 C2 细胞系。这些细胞表现出形态上增强的肌管形成,伴随着生肌因子 MyoD(159970) 和肌细胞生成素(159980) 转录的增加。使用酵母 2-杂交系统,SKIP 被证明可以与 PABP2 结合。免疫荧光研究表明 PABP2 与 SKIP 共定位于核斑点中。报告基因检测表明,PABP2 与 SKIP 合作,通过 MyoD 协同激活 E框 介导的转录。此外,PABP2 和 SKIP 均与 MyoD 直接相关,形成单一复合物。

Kittler 等人使用核糖核酸内切酶制备的短干扰 RNA(esiRNA) 文库(2004) 鉴定了细胞分裂所需的 37 个基因,其中之一是 SKIIP。这 37 个基因包括几个剪接因子,敲低这些剪接因子会产生有丝分裂纺锤体缺陷。此外,还发现一种假定的核输出终止子可以在敲除后加速细胞增殖和有丝分裂进展。

通过对胎脑 cDNA 文库进行酵母 2 杂交分析,Scott 和 Plon(2005) 发现转录抑制因子 FOXN3(602628) 的 C 末端结构域与 SKIIP 相互作用。表位标记蛋白的免疫共沉淀分析证实了 HeLa 细胞中的相互作用。结构域分析表明,SKIIP 的极端 C 末端与 FOXN3 的 C 末端结构域相互作用。