雄激素受体调节的长非编码 RNA 1； ARLNC1

• AR 调控的 lncRNA 1
• 长基因间非编码RNA 2170； LINC02170

HGNC 批准的基因符号：ARLNC1

细胞遗传学位置：16q23.2 基因组坐标（GRCh38）：16:80,828,734-80,892,595（来自 NCBI）

▼ 说明

ARLNC1 是一种前列腺谱系特异性长非编码 RNA（lncRNA），参与雄激素受体（AR; 313700） 信号传导（Zhang et al., 2018）。

▼ 克隆与表达

使用 RNA 测序数据和定量 PCR（qPCR） 分析，Zhang 等人（2018）表明ARLNC1在AR阳性细胞系中高度富集，在人前列腺癌细胞系MDA-PCa-2b和LNCaP中表达最高。 数据库分析表明存在几种具有不同外显子和转录起始位点使用的 ARLNC1 同工型。 RACE 和 Northern 印迹分析揭示了 MDA-PCa-2b 和 LNCaP 细胞系中 ARLNC1 的共同转录起始位点，转录本大小约为 2.8 kb。 单分子 FISH 和 qPCR 分析表明 ARLNC1 分子在细胞核和细胞质之间均匀分布。

▼ 基因结构

张等人（2018） 报道 ARLNC1 包含 4 个外显子，并在其启动子区域具有多个转录因子结合位点，包括 AR 和 FOXA1 位点（602294）。

▼ 测绘

Gross（2018） 根据 ARLNC1 序列（GenBank NR_131947） 与基因组序列（GRCh38） 的比对，将 ARLNC1 基因对应到染色体 16q23.2。

▼ 基因功能

张等人利用转录组分析（2018） 将 ARLNC1 鉴定为前列腺谱系特异性 lncRNA，通过 ARLNC1 启动子区域的 AR 结合位点直接受 AR 调节。 进一步的分析确定 FOXA1 是 ARLNC1 的额外调节因子，AR 和 FOXA1 的表达几乎完全在前列腺组织中重叠。 MDA-PCa-2b 细胞中 ARLNC1 敲低显着降低 AR 表达，抑制 AR 正向调节的基因，上调 AR 负向调节的基因，表明 ARLNC1 和 AR 之间存在正反馈循环。 ARLNC1 和 AR 转录本共定位，作者发现 ARLNC1 的 700 至 1300 位核苷酸对于与 AR 转录本的 3 素 UTR 结合至关重要。 对 ARLNC1 耗尽的前列腺癌细胞系中 AR 转录本的亚细胞定位的跟踪表明，ARLNC1 调节 AR 转录本的细胞质水平。 敲除ARLNC1可抑制AR阳性前列腺癌细胞的增殖并促进细胞凋亡，与对照组相比，小鼠组织特异性敲除Arlnc1可显着降低肿瘤生长。