通过与 T-SNARES 1B 相互作用进行囊泡转移; VTI1B

  • VTI1,酿酒酵母,B 的同源物
  • VTI1
  • VTI1-LIKE; VTI1L

HGNC 批准的基因符号:VTI1B

细胞遗传学位置:14q24.1 基因组坐标(GRCh38):14:67,647,084-67,674,631(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

真核细胞中的膜转移需要转移囊泡上的囊泡相关的可溶性 NSF 附着蛋白受体(v-SNARE) 与目标膜上的 t-SNARE 相互作用。 请参见 603215。Vti1 是一种酿酒酵母 v-SNARE,对于生存能力至关重要。 Vti1 参与高尔基体到液泡前的转移以及到顺式高尔基体的转移。 Fischer von Mollard 和 Stevens(1998) 使用多拷贝抑制子筛选来鉴定能够在功能上补充酵母 vti1 缺失突变体的人类蛋白质,孤立出编码 VTI1 的胶质母细胞瘤 cDNA,VTI1 是酵母 Vti1 的人类同源物。 推导的 232 个氨基酸的人类蛋白包含一个 C 端跨膜结构域和 2 个预测的卷曲螺旋区域。 酵母和人类蛋白质有 29% 相同。 人VTI1在酵母中的表达表明VTI1可以在两个高尔基体转运反应中替代酵母Vti1。 Northern 印迹分析在所有测试的人体组织中检测到 1.2 kb VTI1 mRNA。 对 EST 数据库的搜索发现,编码小鼠蛋白的 cDNA 与人 VTI1 具有 93% 的序列同一性。

▼ 生化特征

晶体结构

米勒等人(2007) 描述了控制 SNARE 分选到网格蛋白包被囊泡中的分子细节,即人网格蛋白接头 epsinR(EPNR,也称为 CLINT1;607265) 直接识别小鼠 SNARE Vti1b 的 3 螺旋束 H(abc) 结构域。 每个结构域及其复合物的结构表明,这种相互作用(解离常数 22 µM)是由每个由大约 15 个残基组成的表面斑块介导的,其拓扑结构取决于每个结构域的整体折叠。 点突变破坏界面消除了体外相互作用,并导致 Vti1b 重新定位到晚期内体和溶酶体。 米勒等人(2007)指出,网格蛋白涂层成分和货物之间的这种新的高度特异性的表面-表面相互作用不同于广泛观察到的通过组装多肽(AP)复合物和GGA接头对短的线性货物基序的结合,因此不易受到来自标准包含基序的货物的竞争,以掺入网格蛋白包被的囊泡中。 米勒等人(2007)提出,概念上相似但机制上不同的相互作用指导了许多陷阱的后高尔基体贩运。