溶酶体相关蛋白,跨膜 4,β; LAPTM4B
溶酶体相关跨膜蛋白 4,β
HGNC 批准的基因符号:LAPTM4B
细胞遗传学位置:8q22.1 基因组坐标(GRCh38):8:97,775,788-97,853,013(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Shao等人通过对肝细胞癌和正常肝组织进行差异显示,然后进行RT-PCR和RACE(2003) 克隆了 2 个使用不同聚腺苷酸化信号位点的人类 LAPTM4B 转录本。推导的 317 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 35 kD。它具有 4 个跨膜结构域、N 端和 C 端均具有 SH3 结构域结合 PxxP 基序、C 端具有保守的溶酶体靶向信号、1 个潜在的 N-糖基化位点、8 个假定的磷酸化位点和 4 个 N-肉豆蔻酰化位点。 LAPTM4B 与其小鼠同源物具有 92% 的氨基酸同一性,与人 LAPTM4A(618837) 具有 46% 的氨基酸同一性。 Northern blot分析检测到1.5和2.2 kb的LAPTM4B转录本,对应于Shao等人克隆的转录本(2003),以及一些较大的抄本。 LAPTM4B 在心脏、骨骼肌和睾丸中表达较高,在卵巢、肾脏和胰腺中表达中等,在肝脏、脾脏和胸腺中表达较低,在肺和外周白细胞中表达较弱。在其他测试的成体组织中未检测到表达。在胎儿肾脏、心脏和脾脏中检测到高表达。胎儿肝脏中表达中等,但显着高于成人肝脏中的表达。表位标记的 LAPTM4B 在转染的幼仓鼠肾(BHK) 细胞中以点状表达,尤其是在细胞核周围。
通过对肝细胞癌和正常肝组织进行蛋白质印迹分析,Liu 等人(2004) 表明 LAPTM4B 表达为从替代 ATG 密码子翻译而来的 2 个亚型。亚型的表观分子量分别为 35 和 24 kD,分别对应于预测的 317 个和 226 个氨基酸的蛋白质。 35-kD 亚型的表达在源自肝癌、前列腺癌和肺巨细胞癌的高转移细胞系中比在同源低转移细胞系中更高。
Kasper 等人使用 Northern blot 分析(2005) 检测到大约 2.35 kb 的主要 LAPTM4B 转录本,该转录本在心脏和骨骼肌中大量表达,而在大多数其他组织中表达较弱。约 1.4 kb 的小转录本也在心脏和骨骼肌中表达。 RT-PCR 显示子宫中 LAPTM4B 表达最高,其次是睾丸和骨骼肌。
▼ 基因功能
使用差分显示,Shao 等人(2003)发现LAPTM4B在肝细胞癌中较正常肝组织过度表达,且其表达与肿瘤细胞分化程度呈负相关。全长 LAPTM4B 的过表达增加了肝癌细胞系中集落形成的效率。
Kasper 等人使用微阵列、Northern blot 和 RT-PCR 分析(2005) 发现 LAPTM4B 的表达在多种实体瘤中显着升高,而其他 LAPTM 家族成员则没有,并且在激素依赖性器官(例如乳腺癌、子宫和卵巢)的癌症中过度表达的发生率很高。
李等人(2010) 发现人类乳腺癌中染色体 8q22 区域的扩增与蒽环类药物的从头化疗耐药性和转移性复发之间存在显着关联(114480)。在该区域内,YWHAZ(601288) 和 LAPTM4B 基因的过度表达被发现与观察结果相关。使用 siRNA 敲除这些基因中的任何一个都会导致肿瘤细胞对蒽环类药物敏感。广泛的体外研究证实了这种效果。进一步的研究表明,LAPTM4B 导致蒽环类药物的隔离并延迟进入细胞核,而 YWHAZ 可能保护细胞免于凋亡。该研究结果针对蒽环类药物。
▼ 基因结构
邵等人(2003) 确定 LAPTM4B 基因包含 7 个外显子,跨度至少 50 kb。启动子区域包含 DNA 重复序列、2 个肌肉起始序列和多个转录因子的结合位点,但缺少 CCAAT 和 TATA 框。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Shao 等人(2003) 将 LAPTM4B 基因定位到染色体 8q22.1。他们在染色体 1q、3q、3p、4q 和 7q33-q35 上鉴定出可能的 LAPTM4B 假基因。