POU 结构域,6 类,转录因子 2; POU6F2
视网膜衍生的 POU 域因子 1; RPF1
HGNC 批准的基因符号:POU6F2
细胞遗传学位置:7p14.1 基因组坐标(GRCh38):7:38,977,909-39,468,601(来自 NCBI)
▼ 说明
POU6F2 是一个基因家族的成员,其特征是存在二分 DNA 结合结构域,由 POU 特异性结构域和 POU 异质结构域组成,由可变多接头分隔。 POU 结构域家族成员是转录调节因子,其中许多显示出高度受限的表达模式,并且已知可控制细胞类型特异性分化途径(参见 Phillips 和 Luisi,2000 年的评论)。
▼ 克隆与表达
周等人(1996) 从视网膜 cDNA 文库中分离出人类 POU6F2,并将其命名为视网膜衍生 POU 结构域因子 1。 POU6F2 编码推导的 648 个氨基酸的蛋白质。选择性剪接可能会产生 24 种具有不同 DNA 结合活性的不同 mRNA 亚型。周等人(1996) 发现,在成人中,Pou6f2 仅在中枢神经系统内表达,其表达仅限于内侧缰核、背侧下丘脑中分散的神经元群体,以及神经节和无长突细胞的亚群。视网膜。
Perotti 等人对小鼠 Pou6f2 基因进行 RT-PCR 分析(2004)揭示了在胚胎第(E)18天的小鼠胎儿的肾脏、肾上腺、心脏、胃、肌肉和眼睛中的表达,但不在肺或皮肤中的表达,以及在肾脏、心脏、肌肉、脾脏和眼睛中的表达。成年小鼠的卵巢中,但不在肺中。
▼ 基因结构
周等人(1996) 确定 POU6F2 基因至少包含 10 个外显子,长度超过 125 kb。序列分析揭示了 4 个位置发生交替剪接,可能产生多个转录本。
▼ 测绘
Gross(2019) 根据 POU6F2 序列(GenBank BC152915) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 POU6F2 基因对应到染色体 7p14.1。
▼ 基因功能
周等人(1996) 发现人类视网膜中最丰富的 POU6F2 同工型在 POU 特异性结构域的 DNA 识别螺旋中插入了一个进化上保守的 36 个氨基酸肽。在体外,缺少插入片段的 POU6F2 POU 结构域与共有的 OCT1 结合位点结合,而选择性剪接的 POU 结构域则不然。 POU6F2 蛋白首先出现在 E11 发育中的视网膜中,它定位于最近从有丝分裂区迁移到未来神经节细胞层的神经母细胞。周等人(1996)提出POU6F2可能参与无长突细胞和神经节细胞分化的早期步骤。
▼ 分子遗传学
佩罗蒂等人(2004) 指出,POU6F2 基因位于染色体 7p14 上的一个区间内,该区间与肾母细胞瘤病例中杂合性缺失(LOH) 相关(参见 WT5;194070),这是一种以高度异质性遗传改变为特征的儿童肾脏恶性肿瘤。通过对 12 个在染色体 7p14 上显示 LOH 的 WT 中的 POU6F2 基因进行测序,他们鉴定出 2 个可能具有致病意义的种系突变(609062.0001-609062.0002)。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 WILMS 肿瘤 5
POU6F2、GLN184HIS
Perotti 等人在一位患有肾母细胞瘤且染色体 7p14 处出现 LOH 的患者中(参见 WT5, 601583)(2004) 在 POU6F2 基因的外显子 5 中发现了种系 552G-T 颠换,导致谷氨酰胺重复结构域中的 gln184-to-his(Q184H) 取代。患者的肿瘤 DNA 中显示出本质上野生型等位基因的缺失。母亲和父亲都不携带这种突变。标记研究表明,肿瘤 DNA 中的缺失是母系起源的,这表明所识别的碱基变化很可能作为父系染色体上的从头种系点突变而发生。佩罗蒂等人(2004) 表明 POU6F2 小鼠同源物在胎儿和成人肾脏中均表达,这与在肾母细胞瘤中突变的证明一起表明该基因是一种肿瘤抑制因子,并与肾母细胞瘤的遗传易感性有关。
.0002 WILMS 肿瘤 5
POU6F2、C-G、EXON 1C、5-PRIME UTR
Perotti 等人之前报道过一名患有肾母细胞瘤的患者,其染色体 7p14 处显示 LOH(参见 WT5, 601583)(2001),佩罗蒂等人(2004) 在 POU6F2 基因的选择性剪接外显子 1C 的非翻译部分中发现了种系 C 到 G 的颠换。该突变遗传自未受影响的母亲。