犬尿氨酸酶; KYNU
L-犬尿氨酸水解酶
HGNC 批准的基因符号:KYNU
细胞遗传学位置:2q22.2 基因组坐标(GRCh38):2:142,877,664-143,055,833(来自 NCBI)
▼ 说明
犬尿氨酸酶(EC 3.7.1.33) 是一种 3-羟基犬尿氨酸酶型酶,参与从色氨酸生物合成 NAD 辅因子的犬尿氨酸途径。它催化L-3-羟基犬尿氨酸和L-犬尿氨酸分别转化为3-羟基邻氨基苯甲酸和邻氨基苯甲酸。该反应依赖于 5-吡哆醛,并且对哺乳动物中维生素 B6 营养缺乏敏感。对小鼠、大鼠和猪的研究表明,犬尿氨酸酶是一种 95-kD kD 同二聚体,主要位于细胞质中(Toma 等人,1997)。
犬尿氨酸酶还参与 NAD(H) 从头合成途径,使用膳食中的烟酸(Shi 等人总结,2017)。
▼ 克隆与表达
阿尔贝拉蒂-贾尼等人(1996)纯化了大鼠肝脏犬尿氨酸酶并从胰蛋白酶肽中获得了氨基酸序列。他们利用简并RT-PCR克隆的部分大鼠肾脏cDNA来筛选人肝癌细胞cDNA文库,孤立出编码推导的465个氨基酸蛋白的KYNU cDNA。Toma 等人使用相同的方法(1997) 还分离出了人犬尿氨酸酶 cDNA 克隆。人类 KYNU 与假定的酵母犬尿氨酸酶和大鼠犬尿氨酸酶分别具有 48% 和 85% 的氨基酸同一性。两个研究小组均鉴定出一个保守的赖氨酸残基(lys276),该残基被认为是吡哆醛-P 结合位点共有序列内辅因子结合的关键残基。通过 Northern blot 分析,Alberati-Giani 等人(1996) 在肝脏、胎盘和肺中检测到 2-kb 转录物的强表达,在心脏、脑、骨骼肌、肾脏和胰腺中表达较弱。他们还在胎盘和肝脏中检测到 2.6 kb 转录物的强表达,而在心脏、骨骼肌和胰腺中表达较弱。Alberati-Giani 等人使用在细胞系中表达的重组犬尿氨酸酶 cDNA(1996) 和托马等人(1997)观察了犬尿氨酸酶和羟基犬尿氨酸酶的活性。
▼ 生化特征
在大脑和全身炎症条件下观察到犬尿氨酸酶活性水平升高(Heyes 等,1993)。犬尿氨酸酶缺乏与色氨酸代谢异常有关。参见羟基犬尿氨酸尿症(236800)。
▼ 测绘
Gross(2014) 根据 KYNU 序列(GenBank BC000879) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 KYNU 基因对应到染色体 2q22.2。
▼ 分子遗传学
羟基犬尿尿症
克里斯滕森等人(2007) 报道了 2 个兄弟在 KYNU 基因中存在纯合错义突变(T198A; 605197.0001)。两个男孩的尿液中黄嘌呤酸、犬尿氨酸和 3-羟基犬尿氨酸排泄量较高,但其他方面均良好。
脊椎、心脏、肾脏和肢体缺陷综合症 2
Shi 等人在 2 名患有椎体、心脏、肾脏和肢体缺陷综合征 2(VCRL2; 617661) 的无关儿童中进行了研究(2017) 鉴定了 KYNU 基因中的纯合或复合杂合截短突变(605197.0003-605197.0005)。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。体外功能表达研究表明,突变基本上消除了 KYNU 酶活性。对 1 名患者(患者 D)的血浆分析显示,上游代谢物 3HK 水平升高,下游代谢物 NAD 和 NAH(H) 水平降低。对小鼠的研究表明,小鼠的烟酸水平与人类不同,人类的先天畸形是由于 NAD 水平不足而不是 3HK 水平升高造成的。施等人(2017) 指出,NAD 是一种具有广泛细胞效应的辅助因子,包括 ATP 产生、大分子生物合成、氧化还原反应、能量代谢、DNA 修复和转录因子调节,所有这些在胚胎发生中都发挥着重要作用。施等人(2017) 推测补充烟酸可能对此类患者有益。
Schule 等人在一名 5 岁患有 VCRL2 的女孩中进行了临床诊断,该女孩被临床诊断为 Catel-Manzke 综合征(见 616145)(2021) 鉴定了 KYNU 基因外显子 5 缺失的纯合性。外显子 5 包含 62 bp(c.374_436del, NM_00119924.1),预计删除会导致移码和过早终止(p.125_145delLeu146TyrfsTer)。通过 CGH 阵列和长程 PCR 确认了包含 835 bp(605197.0006) 的缺失断点(chr2:142,954,376 和 chr2:142,955,239,GRCh38)。SNP阵列显示,该纯合突变源于母本染色体2的单亲二倍体。
▼ 动物模型
施等人(2017) 发现 Kynu-null 小鼠能够存活且正常。血浆分析显示 3HK 水平升高,但 NAD 水平正常。作者指出,与人类相比,小鼠的烟酸水平有所增加,小鼠胚胎可能会从母亲那里获得烟酸,从而对基于遗传的 NAD 缺乏症产生缓冲作用。这些发现表明,人类的先天畸形是由 NAD 水平不足造成的。事实上,对采用无烟酸饮食的母亲所生的突变小鼠进行的进一步研究表明,由于缺乏 Kynu 而导致的 NAD 缺乏会导致多种缺陷,包括椎体节段缺陷、心脏缺陷、小肾、腭裂、足足、并指畸形和畸形。尾部发育不全。在妊娠期间给 Kynu-null 老鼠胚胎补充烟酸可以恢复 NAD 水平并防止胚胎发生的破坏。
▼ 等位基因变异体(6 个精选示例):
.0001 羟基尿尿症(1 个家族)
KYNU,THR198ALA
Christensen 等人发现,一名近亲父母所生的索马里男孩在尿液代谢筛查中发现黄嘌呤酸、犬尿素和 3-羟基犬尿素排泄量较高,这是羟基犬尿素尿的特征(236800)(2007) 鉴定了 KYNU 基因中 c.593A-T 颠换的纯合性,导致 thr198-to-ala(T198A) 取代。患者在 9 日龄时出现黄疸和呕吐。他在几天之内就康复了,并且在 6 岁时进行随访时情况良好,具有正常的里程碑并且无需服用药物。在患者兄弟的纯合性中也发现了这种突变,他的色氨酸代谢物的排泄也很高。父母和 1 名同胞均为该突变杂合子;其余 2 名同胞不携带该突变。
.0002 意义不明的变体
KYNU,ARG188GLN
该变异被归类为意义不明的变异,因为其对原发性高血压的贡献(见145500)尚未得到证实。
张等人(2011) 研究了 KYNU 的一种罕见变体,该变体导致 arg188 替换为 gln(R188Q),与犬尿氨酸酶活性和原发性高血压有关。在中国汉族人群中发现了原发性高血压的连锁峰(Zhu et al., 2001)。张等人(2011) 发现 1,124 名中国高血压患者中有 33 名是 R188Q 杂合子,而 1,084 名血压正常对照者中只有 14 名是该突变杂合子(188Q 等位基因频率,0.015 vs 0.006;p = 0.0075)。对来自 213 个家庭的另外 924 名个体进行了基因型不一致的同胞对研究,表明 188Q 携带者具有较高的收缩压(168.29 +/- 24.67 vs 139.00 +/- 12.82 mm Hg,p 小于 0.001)和舒张压压力(105.50 +/- 14.08 vs 90.75 +/- 11.07 mm Hg,p = 0.001)比 R188 纯合子同胞高。研究发现,R188Q 变异在其他 2 个种族群体中较为罕见(880 名患有高血压的法国白人中有 3 名杂合子,90 名患有高血压的非洲黑人中有 0 名是杂合子)。张等人(2011) 发现血浆中的犬尿氨酸酶活性与高血压家族受试者的血压相关(p 小于 0.05)。188Q 携带者的动力学米氏常数低于 R188 纯合受试者(0.05 +/- 0.02 vs 0.10 +/- 0.02 mmol/L,p = 0.005)。R188Q 突变在体外也显示出比野生型 KYNU 酶更低的催化效率(最大反应速度/动力学米氏常数比,0.050 +/- 0.012 vs 0.11 +/- 0.016 mL/min 每毫克;p = 0.029)。张等人(2011) 得出结论,罕见的 KYNU 变体 R188Q 会影响犬尿氨酸酶活性,并且他们的结果与这种突变可能导致原发性高血压的假设一致。
.0003 椎骨、心脏、肾脏和肢体缺陷综合征 2
KYNU、IVS2AS、GT、-1(SCV000540921)
Shi 等人发现,黎巴嫩近亲父母(C 族)出生的一名女婴患有椎骨、心脏、肾脏和肢体缺陷综合征 2(VCRL2;617661)(2017) 在 KYNU 基因的内含子 2 中鉴定出纯合的 G 到 T 颠换(c.170-1G-T),导致剪接位点改变和提前终止(Val57GlufsTer21)。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。ExAC 数据库中未发现该变异,根据美国医学遗传学学院指南,该变异被归类为致病性。体外功能表达研究表明,该突变基本上消除了 KYNU 酶活性。
.0004 椎骨、心脏、肾脏和肢体缺陷综合征 2
KYNU,TYR156TER(SCV000540922)
Shi 等人在一名 3 岁女孩中,其父母均为北美血统(D 族),无血缘关系,患有脊椎、心脏、肾脏和肢体缺陷综合征 2(VCRL2;617661)(2017) 鉴定了 KYNU 基因中的复合杂合截短突变:外显子 6 中的 c.468T-A 颠换,导致 tyr156-to-ter(Y156X) 替换,以及 7-bp 缺失(c.1045_1051delTTTAAGC; 605197.0005)位于外显子 13 中,导致移码和提前终止(Phe349LysfsTer4)。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。这些变异体根据 ExAC 数据库进行了过滤,并根据美国医学遗传学学院指南被分类为致病性。体外功能表达研究表明,突变基本上消除了 KYNU 酶活性。
.0005 椎骨、心脏、肾脏和肢体缺陷综合征 2
KYNU、7-BP DEL、NT1045(SCV000540923)
讨论 KYNU 基因中的 7-bp 缺失(c.1045_1051del),该缺失导致移码和提前终止(Phe349LysfsTer4),该缺失在椎骨、心脏、肾脏和肢体缺陷综合征患者的复合杂合状态中被发现-2(VCRL2;617661),Shi 等人(2017),参见 605197.0004。
.0006 椎骨、心脏、肾脏和肢体缺陷综合症 2
KYNU,835-BP DEL
在一名患有椎骨、心脏、肾脏和肢体缺陷综合征 2(VCRL2; 617661) 的 5 岁女孩中,临床诊断为 Catel-Manzke 综合征(参见 616145),Schule 等人(2021) 鉴定了 KYNU 基因外显子 5(EX5DEL) 缺失的纯合性。外显子 5 包含 62 bp(c.374_436del, NM_00119924.1),预计删除会导致移码和过早终止(p.125_145delLeu146TyrfsTer)。通过 CGH 阵列和长程 PCR 确认了包含 835 bp 的缺失断点(chr2:142,954,376 和 chr2:142,955,239,GRCh38)。SNP阵列显示,该纯合突变源于母本染色体2单亲二倍体。患者尿液中黄嘌呤酸排泄增加。