肿瘤蛋白 p73;TP73
p53-RELATED PROTEIN p73; p73
TRP73, 小鼠, HOMOLOG OF
p53 相关蛋白 p73;p73
TRP73, 小鼠, 同源物
HGNC 批准的基因符号:TP73
细胞遗传学定位:1p36.32 基因组坐标(GRCh38):1:3,652,516-3,736,201(来自 NCBI)
▼ 说明
TP73基因编码属于转录因子TP53(191170)家族的转录调控因子。已知 TP73 在多纤毛运动细胞的分化中发挥作用(Wallmeier 等人总结,2021)。
▼ 克隆与表达
p53基因(TP53; 191170)是人类癌症中最常见突变的肿瘤抑制基因。p53抑制细胞生长的能力至少部分归因于它能够结合特定的DNA序列并激活靶基因的转录,例如编码细胞周期抑制剂p21(Waf1/Cip1)(CDKN1A;116899)。Kaghad等(1997)通过利用绿猴p73筛选人结肠cDNA文库,克隆了p73,一个与p53相关的基因。他们获得了 2 个 p73 剪接变体,p73-α 和 p73-β,它们的不同之处分别在于是否存在外显子 13。推导的蛋白质分别包含 636 和 499 个氨基酸,并且前 494 个氨基酸是相同的。两者都包含与 p53 的反式激活、DNA 结合和寡聚化结构域同源的结构域。人神经母细胞瘤细胞系的 Northern 印迹分析检测到与多腺苷酸化变体相对应的 4.4-和 2.9-kb p73 转录物。PCR 分析检测到所有检查的人体组织中 p73-α 和 p73-β 的表达。免疫组织化学分析表明,内源性 p73-α 以小点状点的形式定位于细胞核。
De Laurenzi等人(1998)通过对人神经母细胞瘤细胞系总RNA进行RT-PCR,克隆了2个新的p73剪接变体:p73-γ和p73-δ。p73-γ 缺乏外显子 11,编码推导的 475 个氨基酸的蛋白质,p73-δ 缺乏外显子 11、12 和 13,编码推导的 403 个氨基酸的蛋白质。两种蛋白都含有N端反式激活结构域CBP/p300(EP300; 602700) p73-α 和 p73-β 中发现的共激活子结合域、DNA 结合域和寡聚化域。与其他 p73 同工型相比,p73-γ 具有独特的 C 端延伸,而 p73-δ 缺乏区分其他 p73 同工型的 C 端延伸。PCR 分析检测到不同谱系的原代细胞、已建立的细胞系以及正常人淋巴细胞和角质形成细胞中 p73-α、-β、-γ 和 -δ 的可变表达。
Nozell et al.(2003)指出,位于外显子 1 的 5-prime 区域的启动子的转录至少会产生 7 个 p73 变体,这些变体表现出 3-prime 外显子的选择性剪接,从而产生具有独特 C 末端的蛋白质。除了p73-α、-β、-γ和-δ之外,这些变体还包括p73-ε、-zeta和-eta,它们分别编码555、540和571个氨基酸的蛋白质。这些变体被称为反式激活(TA)变体,因为它们都共享一个N端反式激活结构域。p73 在内含子 3 内的内部启动子处启动的变体(称为 δ-N 变体)编码 7 种蛋白质,其中 13 个独特的 N 端残基取代了 N 端 TA 结构域。外显子 2 和/或外显子 3 处的选择性剪接产生第三组 p73 变体,即 δ-TA 变体,其编码具有独特 N 末端残基代替 TA 结构域的蛋白质。尽管 N 端和 C 端存在差异,但所有 p73 同工型均包含 2 个 N 端和 1 个 C 端 PxxP 基序、一个 DNA 结合结构域和一个四聚化结构域。所有α亚型还含有可能参与蛋白质-蛋白质相互作用的C端无菌α基序(SAM)。
▼ 基因功能
Kaghad等人(1997)利用酵母2-杂交分析发现p73-β表现出很强的同型相互作用,而p73-α仅表现出弱的同型相互作用。p53 与 p73-β 相互作用强烈,但与 p73-α 相互作用不强,p73-α 和 p73-β 彼此相互作用较弱。表达p73-α的神经母细胞瘤细胞p21(Waf1)(CDKN1A)水平升高;116899),并在集落形成测定中减少集落数量,效果与 p53 表达相似。p73-α DNA 结合域内的 arg292 突变为 his,消除了这些效应。与p53不同,p73的表达不被放线菌素D或紫外线照射激活。
Jost等人(1997)表明,当猿猴来源的p73过量产生时,可以激活p53反应基因的转录,并通过诱导细胞凋亡以类似p53的方式抑制细胞生长。
De Laurenzi 等人(1998)使用酵母 2-hybrid 测定法发现 p73-α、-β、-γ 和 -δ 之间以及与 p53 形成同二聚体和异二聚体相互作用的能力不同。p73亚型在激活p21(Waf1)启动子转录和抑制集落形成的能力方面也有所不同。
Kong等人(1999)证明,在接受癌症化疗药物顺铂治疗的细胞中,p73蛋白的量通常会增加。然而,在无法进行错配修复且核酶c-Abl酪氨酸激酶(189980)未被顺铂激活的细胞中,没有观察到p73的这种诱导。顺铂和与 c-Abl 酪氨酸激酶共表达可延长 p73 的半衰期。c-Abl 激酶也增强了 p73 的细胞凋亡诱导功能。缺失错配修复或c-Abl 的胚胎成纤维细胞不会上调p73,并且对顺铂的杀伤具有更强的抵抗力。Kong等人(1999)得出结论,c-Abl和p73是错配修复依赖性细胞凋亡途径的组成部分,该途径有助于顺铂诱导的细胞毒性。
Agami et al.(1999)证明p73-α的凋亡活性需要有功能性、具有激酶活性的c-Abl的存在。此外,p73 和 c-Abl 的关联是由 p73 中的 PxxP 基序和 c-Abl 的 SH3 结构域介导的。Agami et al.(1999)发现p73是c-Abl激酶的底物,并且c-Abl磷酸化p73的能力通过γ-辐射显着增加。此外,p73 在体内响应电离辐射而被磷酸化。这些发现定义了涉及 p73 和 c-Abl 的促凋亡信号通路。
Yuan等人(1999)证明c-Abl在细胞中与p73结合,通过其SH3结构域与p73的C端同源寡聚化结构域相互作用。在体外和暴露于电离辐射的细胞中,c-Abl 磷酸化 p73 第 99 位的酪氨酸残基。Yuan等人(1999)得出结论,c-Abl刺激p73介导的反式激活和细胞凋亡。c-Abl 响应 DNA 损伤而对 p73 的这种调节也通过 c-Abl-p73 相互作用破坏后电离辐射诱导的细胞凋亡失败而得到证实。
p73 蛋白可以激活 p53 响应启动子并诱导 p53 缺陷细胞凋亡。Marin et al.(2000)报道,一些肿瘤来源的p53突变体可以与p73结合并使其失活。此类突变体的结合受到TP53密码子72编码精氨酸还是脯氨酸的影响(191170.0005)。当密码子72编码精氨酸时,突变体p53结合p73、中和p73诱导的细胞凋亡以及与EJ-Ras(参见190020)协同转化细胞的能力增强。Marin 等人(2000)得出结论,p53 家族成员的失活可能有助于 p53 突变体子集的生物学特性。
强烈刺激循环外周T细胞的T细胞受体,通过TCR激活诱导细胞死亡(TCR-AICD)导致其凋亡。Lissy等人(2000)利用TUNEL(TdT induced dUTP nick endlabeling)分析表明,经过TCR-AICD的T细胞诱导p53相关基因TP73。引入显性失活E2F1或TP73,但不引入E2F2(600426)、E2F4(600659)或p53,可以保护细胞免受TCR-AICD的影响。不表达 E2F1 或 TP73 的原代 T 细胞也不进行 TCR-AICD。Lissy et al.(2000)得出结论,TCR-AICD 发生于 G1 期晚期细胞周期检查点,孤立于 p53,依赖于 E2F1 和 TP73。
Sherr(1998)在一篇综述中指出E2F1通过诱导ARF(CDKN2A;CDKN2A;600160),它中和MDM2(164785)并稳定p53。Irwin et al.(2000)发现E2F1的瞬时表达会引起p73 mRNA的积累,激活p73启动子,并增加TP73蛋白水平,但不影响TP63(603273)。TUNEL分析表明,在缺乏p53或p73的表达E2F1的细胞中细胞凋亡减少,而在缺乏这两种蛋白的细胞中几乎检测不到细胞凋亡,这表明E2F1可以通过p73以不依赖于p53的方式诱导细胞凋亡。
Costanzo et al.(2002)表明DNA损伤可诱导乙酰转移酶p300(602700)对p73进行乙酰化。抑制 p300 的酶活性会阻碍 p53 -/- 背景下的细胞凋亡。此外,不可乙酰化的p73在激活促凋亡p53AIP1基因(605426)的转录方面存在缺陷,但保留了调节其他靶标(例如p21)的完整能力。最后,p300 介导的 p73 乙酰化需要原癌基因 ABL。这些结果表明DNA损伤诱导的乙酰化通过增强p73选择性激活促凋亡靶基因转录的能力来增强p73的凋亡功能。
Flores et al.(2002)探讨了p63和p73在DNA损伤诱导的细胞凋亡中的作用。缺乏这些p53家族成员中的一种或多种的胚胎成纤维细胞通过腺病毒E1A癌基因的表达而敏感地经历细胞凋亡。虽然使用 E1A 系统有利于生化分析的进行,但作者还使用体内系统检查了 p63 和 p73 的功能,其中细胞凋亡已被证明依赖于 p53。Flores 等人(2002)使用这两个系统证明,p63 和 p73 的联合丢失导致含有功能性 p53 的细胞无法响应 DNA 损伤而发生凋亡。
Fontemaggi 等人(2002)使用 DNA 微阵列发现,在人非小肺癌细胞系中,类固醇介导的 p73-α 诱导导致 85 个基因上调,这些基因涉及细胞功能的各个方面,包括细胞周期调节、细胞凋亡、DNA 修复。在这些基因中,25个被p73-α特异性上调,27个被p73-α和p53同等上调,其余基因优先被p73-α上调,但表现出一些p53反应性。染色质免疫沉淀分析显示p73-α特异性结合CAN19(S100A2;)的调控区。176993)、14-3-3-δ(YWHAD)、p21(Waf1)、α-1-抗胰蛋白酶(PI;107400)、PTGF-β(GDF15;605312)、PIG3(TP5313;605171)、JAG2(602570)。
Benard 等人(2003)提出,TP53、TP73 和 TP63 的 2 个同源物在人类癌症中一定不具有典型的肿瘤抑制基因作用,因为这 2 个基因中的任何一个都缺乏已证实的突变。尽管如此,TP73 和 TP63 似乎与恶性肿瘤的获得和维持密切相关。
Nozell 等人(2003)生成了表达 p73-β(反式激活和生长抑制中最有效的 p73 同工型)突变形式的稳定人非小肺癌细胞系,以表征其功能域。DNA 结合域、N 端激活域和四聚化域是 p73 活性所必需的。然而,与p53不同,p73介导的细胞凋亡不需要与激活结构域相邻的区域或整个C末端区域。N 端和 C 端 PxxP 基序的删除使 p73-β 在反式激活中失活。
Miyazaki et al.(2003)发现,当在COS-7细胞中共表达时,NEDL2(HECW2;617245)相互共沉淀 p73 的 α 和 β 亚型,其中包含 PY 基序。NEDL2 不共沉淀缺乏 PY 基序的 p53。突变分析证实 p73 的 PY 基序和 NEDL2 的 WW 结构域是相互作用所必需的。NEDL2 泛素化 p73 的两种亚型,稳定它们以防止降解,并增强报告基因的 p73 依赖性转录激活。
Dobbelstein et al.(2005)在一篇综述中指出,p73的TA亚型可以诱导细胞凋亡。p73的凋亡功能似乎需要PML(102578),它与核体中的p73相关。p73 诱导的细胞凋亡似乎还涉及 ABL 的磷酸化、p300 的乙酰化以及 PIN1(601052)的脯氨酰异构化。乙酰化可稳定 p73 免受泛素介导的降解,p73 也可通过核体内的苏酰化(参见 601912)来稳定。Dobbelstein et al.(2005)讨论了p73定位到特定亚细胞区室如何影响其凋亡活性。
Vikhanskaya et al.(2007)发现哺乳动物细胞中p73-β的过度表达会抑制细胞生长,但p73-β与JUN(165160)共表达所刺激的细胞生长高于单独JUN诱导的细胞生长。细胞周期蛋白D1(CCND1)的诱导;168461)是p73-β介导的细胞存活所必需的。染色质免疫沉淀和电泳迁移率变动分析表明,p73-β 增强了磷酸化 JUN 和 FRA1(FOSL1;136515)通过调节JUN磷酸化和FRA1表达来修饰AP1共有DNA序列。
Wang et al.(2007)发现,在应激条件下,小鼠和人细胞中p53与第一个p73启动子中富含GC的回文位点结合并诱导TAp73-α转录。氧化应激以p53依赖性方式增加TAp73-α的表达,而小鼠胚胎成纤维细胞中TAp73的敲低抑制了细胞对氧化损伤的凋亡反应。相反,在p53缺失的小鼠胚胎成纤维细胞中异位表达小鼠TAp73-α可恢复对氧化损伤的凋亡反应。Wang等(2007)得出结论:p73是应激反应基因,是p53途径的下游效应子。
p63(603273)和p73的δ-N亚型(缺乏酸性反式激活结构域)在癌症中经常过度表达,并且主要以显性失活方式针对p53(191170)、带有酸性反式激活结构域(TAp63)的p63和TAp73能够抑制其抑癌功能。Venkatanarayan 等人(2015)表明,p63 或 p73 的 δ-N 同工型缺失会通过上调 IAPP(147940)(编码胰岛淀粉样多肽(一种 37-氨基-胰岛淀粉样多肽)的基因)导致代谢重编程和 p53 缺陷型肿瘤的消退。胰腺β细胞与胰岛素共同分泌的酸性肽。Venkatanarayan et al.(2015)发现IAPP与肿瘤消退有因果关系,胰淀素通过降钙素受体(CALCR;114131)和RAMP3(605155)抑制糖酵解并诱导活性氧和细胞凋亡。普兰林肽是一种胰岛淀粉样多肽的合成类似物,用于治疗 1 型和 2 型糖尿病,可引起 p53 缺陷型胸腺淋巴瘤的肿瘤快速消退,代表了一种针对 p53 缺陷型癌症的新策略。
▼ 基因结构
Kaghad等(1997)确定TP73基因含有14个外显子,其中第一个是非编码外显子。Mai et al.(1998)指出TP73基因跨度约为65 kb。
Nozell et al.(2003)指出TP73基因包含2个启动子,一个位于外显子1的5-prime区域,另一个位于内含子3。Wang et al.(2007)在TP73基因的第一个启动子。
▼ 测绘
Kaghad等人(1997)利用FISH将p73基因定位到染色体1p36.3,该区域在神经母细胞瘤和其他肿瘤中经常被删除。
▼ 分子遗传学
原发性纤毛运动障碍47和无脑回
来自5个无血缘关系的近亲家庭的7名儿童患有原发性纤毛运动障碍-47和无脑回(CILD47; 619466),Wallmeier et al.(2021)鉴定出TP73基因纯合性功能丧失突变(601990.0001-601990.0005)。这些突变是通过外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。一些患者是通过 GeneMatcher 计划确定的。所有突变都会影响两种亚型,并预计会导致 TP73 完全缺乏。对患者来源的呼吸道上皮细胞的研究表明,与对照组相比,多纤毛细胞数量减少,纤毛长度缩短,气液界面的粘液纤毛清除率显着降低。超微结构分析显示,虽然基体存在一定的错位,但基体放大或定位并未出现严重缺陷;基因丝组成和组装也正常。对患者细胞的动态粒子追踪研究证实了睫状气道清除功能受损。总体结果与多纤毛细胞分化缺陷一致。患者细胞还表现出受TP73调控的转录因子相关基因FOXJ1(602291)和RFX2(142765)的核表达减少。FOXJ1突变导致CILD43(618699)。
关联待确认
Kaghad et al.(1997)在p73位点半合子的神经母细胞瘤中发现剩余的p73等位基因没有突变。Jost et al.(1997)推测一种可能是p73不是神经母细胞瘤抑制基因;另一个原因是,由于基因剂量效应或剩余等位基因的转录沉默,p73 位点的半合性导致神经母细胞瘤的发病机制。1p36的印记可能与神经母细胞瘤的发病有关,Kaghad et al.(1997)表明p73是单等位基因表达的。
▼ 动物模型
Yang等人(2000)通过定向破坏产生了缺乏p73的小鼠。所有p73亚型功能缺陷的小鼠表现出严重的缺陷,包括海马发育不全、脑积水、慢性感染和炎症,以及信息素感觉通路异常。然而,与缺乏 p53 的小鼠相比,缺乏 p73 的小鼠并没有表现出自发性肿瘤发生的易感性增加。p73功能丧失导致皮质边缘区和海马分子层的Cajal-Retzius(CR)神经元消失,这种缺陷是p73小鼠海马发育不全的基础。值得注意的是,p73 -/- 小鼠中 CR 神经元的丢失并不伴随皮质层压缺陷,如“reeler”小鼠中所见(见 600514)。这些 CR 神经元的缺失与 p73 -/- 大脑中显着但高度位点特异性的发育不全之间的联系表明,广泛认为控制皮质神经发生的 CR 神经元可能在海马发育中发挥关键作用。缺乏 p73 的雄性小鼠既缺乏对性成熟雌性的兴趣,也缺乏对其他雄性的攻击性反应。p73 -/- 雄性和雌性小鼠均存在生殖缺陷。雄性或雌性 p73 -/- 小鼠的生殖器官均未观察到结构异常,但小鼠中 p73 RNA 水平最高的是胚胎和成年犁鼻器(涉及辅助嗅觉结构)的神经上皮。在信息素检测中。这些结果表明,感觉或激素途径的额外缺陷可能导致 p73 缺陷小鼠的生殖和行为表型。
p53 发挥重要的促凋亡作用,这一功能被认为与其家族成员 p73 和 p63 共有。Pozniak et al.(2000)表明p73主要以缺失氨基末端的截短异构体形式存在于发育中的神经元中,当交感神经元在神经生长因子(NGF;NGF)作用后凋亡时,p73的水平急剧下降。见162030)提现。截短的 p73 表达增加可将这些神经元从 NGF 撤退或 p53 过表达诱导的细胞凋亡中拯救出来。在 p73 -/- 小鼠中,p73 的所有亚型均被删除,发育中的交感神经元的凋亡大大增强。因此,Pozniak et al.(2000)得出结论,截短的p73是神经元中必需的抗凋亡蛋白,可以抵消p53的促凋亡功能。Morrison 和 Kinoshita(2000)从这项研究和其他研究中得出结论,缺乏反式激活结构域的 p53 家族成员是 p53 依赖性过程的显性失活抑制剂。
Talos et al.(2007)表明,原代小鼠胚胎成纤维细胞中p73的缺失会破坏正常的细胞周期调节,并由于补偿性p53激活而损害增殖和转化。p53的共缺失挽救了这些缺陷,但在p53缺陷背景下p73的缺失严重影响了细胞基因组的稳定性,导致多倍体和非整倍体加剧,超过了p53单独缺失的情况。Talos et al.(2007)得出结论,p73是一种基因组稳定因子,当p53失活时,它可以防止异常DNA复制、多倍体和非整倍体。
通过有针对性地删除 p73 外显子 2 和 3,Tomasini 等人(2008)创造了 TA p73 同工型特异性缺陷的小鼠,但 δ-N p73 同工型没有缺陷。TA p73 -/- 小鼠由于早期胚胎发育缺陷而无法生育,并且表现出海马发育不全、对致癌物的敏感性增加以及自发性肿瘤发生率增加。来自 TA p73 -/- 小鼠的细胞表现出与增强的非整倍性相关的基因组不稳定性。Tomasini et al.(2008)得出结论,TA p73亚型具有抑制肿瘤的作用。
Wetzel et al.(2008)发现p73+/-小鼠更容易罹患年龄相关疾病或阿尔茨海默病(AD;AD;104300)相关的神经变性比对照组高。与对照组相比,年老但不年轻的 p73 +/- 小鼠表现出认知和运动功能下降、脑萎缩和神经元变性。老年小鼠大脑也显示出脂褐质和MAPT(157140)阳性丝的积累。进一步研究显示JNK活性增加(MAPK8;与野生型相比,杂合动物的皮质神经元中存在601158),这可能导致对氧化应激的敏感性增加。
▼ 等位基因变异体(5个精选例子):
.0001 纤毛运动障碍,原发性,47 ,无脑回
TP73,13.17-KB DEL
女孩(OP-1693),近亲所生,患有原发性纤毛运动障碍-47和无脑回(CILD47; 619466),Wallmeier et al.(2021)在TP73基因中发现了一个纯合的13.17-kb缺失(NM_005427.4)。该缺失是通过外显子组测序发现的,并通过 RT-PCR 分析和桑格测序证实,与家族中的疾病分开。预计该突变会影响 TP73 基因的两种亚型,这与 TP73 完全缺乏一致。
.0002 原发性纤毛运动障碍,47 ,无脑回
TP73、IVS10DS、GA、+1
2名受影响的男孩(KI-645和OP-3039)来自一个大的近亲亲属,患有原发性纤毛运动障碍-47和无脑回(CILD47;619466),Wallmeier et al.(2021)在TP73基因的内含子10中发现了纯合的G-to-A转换(c.1196+1G-A, NM_005427.4),导致剪接缺陷并保留了内含子10 、移码和提前终止。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。预计该突变会影响 TP73 基因的两种亚型,这与 TP73 完全缺乏一致。
.0003 纤毛运动障碍,原发性,47 ,无脑回
TP73、GLN332TER
2名来自近亲亲属的受影响女孩(18DG0963和19DG2776)患有原发性纤毛运动障碍-47和无脑回(CILD47;619466),Wallmeier et al.(2021)在TP73基因的外显子9中鉴定出纯合的c.994C-T转换(c.994C-T, NM_005427.4),导致gln332-to-ter(Q332X)取代。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。预计该突变会影响 TP73 基因的两种亚型,这与 TP73 完全缺乏一致。
.0004 原发性纤毛运动障碍,47 ,无脑回
TP73,1-BP DEL,1459T
男孩(19DC0120),近亲所生,患有原发性纤毛运动障碍-47和无脑回(CILD47; 619466),Wallmeier et al.(2021)在TP73基因的外显子12中发现了一个纯合的1-bp缺失(c.1459delT, NM_005427.4),导致移码和提前终止(Tyr487ThrfsTer11)。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。预计它会影响 TP73 基因的两种亚型,与 TP73 完全缺乏一致。
.0005 纤毛运动障碍,原发性,47 ,无脑回
TP73、GLU205TER
女孩(20DG1336),近亲所生,患有原发性纤毛运动障碍-47和无脑回(CILD47;619466),Wallmeier et al.(2021)在TP73基因的外显子5中鉴定出纯合的c.613G-T颠换(c.613G-T, NM_005427.4),导致glu205-to-ter(E205X)取代。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。预计它会影响 TP73 基因的两种亚型,与 TP73 完全缺乏一致。