含有四三肽重复、锚蛋白重复和卷曲螺旋的蛋白质 2;TANC2

KIAA1636

HGNC 批准的基因符号:TANC2

细胞遗传学定位:17q23.2-q23.3 基因组坐标(GRCh38):17:62,966,235-63,427,703(来自 NCBI)

▼ 说明

TANC2基因编码突触支架蛋白,该蛋白在突触后密度与其他蛋白相互作用,调节树突棘和兴奋性突触形成(Guo等人总结,2019)。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人(2000)通过对大小分级的胎儿脑 cDNA 文库中的克隆进行测序,获得了部分 TANC2 克隆,他们将其命名为 KIAA1636。转录本的 3 素末端包含多个重复元素。RT-PCR ELISA 检测到在整个成人大脑中表达最高,其次是睾丸和卵巢。所有其他组织,包括胎儿大脑,表现出低得多的表达。在特定的成人大脑区域中,杏仁核中检测到最高表达。

通过数据库分析,Han等人(2010)鉴定出全长人类TANC2,其编码1,990个氨基酸的蛋白质。TANC2 和 TANC1(611397)具有 49.6% 的氨基酸一致性,并且具有基本相同的结构域结构,包括锚蛋白(见 612641)重复序列、四肽重复序列、卷曲螺旋结构域和 C 端 PDZ 结合基序。原位杂交显示Tanc2 mRNA在大鼠脑中广泛表达,而Tanc1 mRNA更集中在特定区域,包括海马、丘脑和小脑。大鼠组织的蛋白质印迹分析显示 Tanc1 和 Tanc2 蛋白仅在大脑中表达。在大鼠大脑发育过程中,Tanc2 蛋白在胚胎第 18 天高度表达,并在出生后第三周开始逐渐降低至成年水平。相比之下,Tanc1 蛋白表达在胚胎发育期间较低,并在出生后前 2 周内增加。

Guo等人(2019)指出,TANC2在发育中的人类大脑皮层的多种细胞类型中广泛表达,在兴奋性神经元和放射状胶质细胞中富集,特别是截短和外放射状胶质细胞。

▼ 测绘

Hartz(2013)根据TANC2序列(GenBank AB046856)与基因组序列(GRCh37)的比对,将TANC2基因定位到染色体17q23.3。

▼ 基因功能

Han等人(2010)利用多种方法证明人类TANC1和TANC2与PSD95(DLG4;DLG4;DLG4)相互作用。602887)通过其 C 端 PDZ 结合基序在体外和体内进行。TANC1 和 TANC2 以同样需要 C 端 PDZ 结合基序的方式定位于转染的大鼠海马神经元的树突棘。在培养的大鼠神经元中人TANC1和TANC2的过度表达增加了树突棘和兴奋性突触的密度。

Stucchi et al.(2018)利用质谱方法鉴定出了TANC2、liprin-α-2(PPFIA2;603143)和钙结合蛋白钙调蛋白(参见 CALM1, 114180)作为 KIF1A(601255)的直接结合伴侣,KIF1A(601255)是突触小泡(SVs)和致密核心囊泡(DCVs)的主要运动蛋白。对大鼠海马神经元的分析表明,钙通过钙调蛋白增强 Kif1a 与 DCV 的结合,并增加囊泡运动。Tanc2 和 liprin-α-2 在树突棘中富集,但不是 Kif1a 货物复合物的一部分。相反,它们充当突触后密度支架,在树突棘进入时阻止和捕获 Kif1a 结合的 DCV。敲低实验表明,Tanc2、Kif1a 或 liprin-α-2 的消耗会影响大鼠树突棘的密度和形态。此外,人类 TANC2 中与神经精神疾病相关的无义突变(参见分子遗传学)消除了 TANC2 与 KIF1A 的相互作用,并影响了 KIF1A 转运的 DCV 的募集。

▼ 分子遗传学

20 名无亲属关系的先证者患有智力发育障碍,伴有自闭症特征和语言迟缓,伴或不伴癫痫发作(IDDALDS;618906),Guo et al.(2019)鉴定了 TANC2 基因中的杂合无义、移码或剪接位点突变或基因内缺失(参见例如 615047.0001-615047.0006)。通过全外显子组测序、靶向测序和基于阵列的 CGH 发现的突变,并通过桑格测序证实;ExAC 数据库中没有任何内容。这些患者是通过国际合作者网络和 GeneMatcher 数据库确定的。11例患者有新发点突变,5例先证者遗传点突变(4例来自轻症父母);1 名患者无法确定遗传模式。两名受影响的同胞患有从其嵌合父亲遗传的基因内缺失,两名不相关的患者患有从头基因内缺失。没有进行变异的功能研究和患者细胞的研究,但作者假设存在功能丧失效应。Guo等人(2019)还鉴定了5个具有重叠表型的无关个体,他们被发现携带TANC2基因的从头杂合错义变异。在 3 名初步诊断为自闭症谱系障碍的患者中发现了 3 个变异(R755H、R961Q 和 H1689R)。另一种变异(R760C)是在一名智力受损和言语迟缓的患者中发现的(de Ligt et al., 2012),最后一种变异(A794V)是在一名精神分裂症患者中发现的(Fromer et al., 2014)。R755H、R760C 和 A794V 变体出现在 ATP 酶调节域中,R961Q 出现在 1 个 ANK 域中。H1689R、R760C 和 A794V 在 ExAC 非精神病样本中未发现,而 R755H 和 R961Q 在 ExAC 中均报告了 4 次。没有对这些错义变体进行功能研究。所有突变都发生在整个基因中,并且没有明显的基因型/表型相关性,尽管所有破坏性突变都发生在 PDZ 相互作用基序之前。

Stucchi et al.(2018)发现R760C和R1066X突变消除了TANC2与KIF1A的相互作用,并且R760C影响了KIF1A转运的DCV的募集。

▼ 动物模型

Guy et al.(2019)发现果蝇中 Tanc2 同源物“rols”的敲低会导致胚胎致死。在正常果蝇中,rols 基因在整个神经系统、早期发育过程中的肌肉细胞以及神经肌肉接头(NMJ)的包裹神经胶质细胞核中表达。rol 的敲低会破坏突触的形成,并干扰 NMJ 上正确的谷氨酸受体聚集。与野生型相比,果蝇胶质细胞中的 rol 的靶向敲低导致异常的求偶行为,翅膀伸展行为的总持续时间增加,而运动、梳理和交配与野生型相似。值得注意的是,神经元细胞中 rol 的敲低并没有改变翅膀的伸展行为。研究结果表明,突触后区域和神经胶质细胞中的角色具有调节行为的作用。

Han et al.(2010)发现敲除小鼠中的Tanc2会导致胚胎死亡。

▼ 等位基因变异体(6个精选例子):

.0001 智力发育障碍,伴有自闭症特征和语言发育迟缓,但不伴有癫痫发作

TANC2、GLN1483TER

一名 7 岁男孩(NN1 家庭)患有智力发育障碍,伴有自闭症特征和语言发育迟缓,但不伴有癫痫发作(IDDALDS;618906),Guo et al.(2019)在TANC2基因中发现了一个从头杂合的c.4447C-T转换(c.4447C-T, NM_025185.3),导致gln1483-to-ter(Q1483X)取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,但 ExAC 数据库中不存在该突变。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究,但作者推测该突变会导致功能丧失。

.0002 智力发育障碍,伴有自闭症特征和语言发育迟缓,但不伴有癫痫发作

TANC2、IVSDS、GA、+1

一名 12 岁男孩(SS2 家庭)患有智力发育障碍,伴有自闭症特征和语言发育迟缓,但不伴有癫痫发作(IDDALDS;618906),Guo et al.(2019)在TANC2基因中发现了一个杂合的G-to-A转换(c.547+1G-A, NM_025185.3),预计会导致TANC2剪接位点改变和破坏蛋白质。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,但 ExAC 数据库中不存在该突变。该突变遗传自患者的父亲,他的父亲患有躁郁症、多动症和创伤后应激障碍(PTSD)等复杂的神经精神疾病。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究,但作者推测该突变会导致功能丧失。

.0003 智力发育障碍,伴有自闭症特征和语言发育迟缓,但不伴有癫痫发作

TANC2、IVSDS、GA、+1

2 名无亲属关系的患者(HU1 和 CC1 家族)患有智力发育障碍,伴有自闭症特征和语言发育迟缓,但不伴有癫痫发作(IDDALDS;618906),Guo et al.(2019)在TANC2基因中发现了从头G到A的转变(c.1219+1G-A,NM_025185.3),预计会导致TANC2剪接位点改变和破坏蛋白质。该突变是通过外显子组测序或靶向测序发现并经桑格测序证实的,但ExAC数据库中不存在该突变。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究,但作者推测该突变会导致功能丧失。

.0004 智力发育障碍,伴有自闭症特征和语言发育迟缓,但不伴有癫痫发作

TANC2、ARG1066TER

一名 15 岁男孩(SS1 家庭)患有智力发育障碍,伴有自闭症特征和语言发育迟缓,但不伴有癫痫发作(IDDALDS;618906),Guo et al.(2019)在TANC2基因中鉴定出一个从头杂合的c.3196C-T转换(c.3196C-T, NM_025185.3),预计会导致arg1066-to-ter(R1066X)代换。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,但 ExAC 数据库中不存在该突变。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究,但作者推测该突变会导致功能丧失。

Stucchi et al.(2018)发现R1066X突变消除了TANC2与KIF1A(601255)的相互作用。

.0005 智力发育障碍,伴有自闭症特征和语言发育迟缓,但不伴有癫痫发作

TANC2,1-BP DEL,4449G

一名4岁女孩(LN家庭)患有智力发育障碍,伴有自闭症特征和语言发育迟缓,但不伴有癫痫发作(IDDALDS;618906),Guo et al.(2019)鉴定了一个从头杂合的 1-bp 缺失(c.4449delG, NM_025185.3),预计会导致移码和提前终止(Gln1483HisfsTer69)。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,但 ExAC 数据库中不存在该突变。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究,但作者推测该突变会导致功能丧失。

.0006 具有自闭症特征的智力发育障碍和伴有癫痫发作的语言发育迟缓

TANC2,1-BP DEL,4405C

一名 14 岁男孩(LG 家庭)患有智力发育障碍、自闭症特征和语言发育迟缓并伴有癫痫发作(IDDALDS;618906),Guo et al.(2019)在TANC2基因中发现了一个从头杂合的1-bp缺失(c.4405delC,NM_025185.3),预计会导致移码和提前终止(Arg1469GlyfsTer6)。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,但 ExAC 数据库中不存在该突变。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究,但作者推测该突变会导致功能丧失。

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