RAS 关联与系列-白细胞C 分裂底物同源域-含蛋白 1; RAPH1

LAMELLIPODIN; LPD
KIAA1681

HGNC 批准的基因符号:RAPH1

细胞遗传学定位:2q33.2 基因组坐标(GRCh38):2:203,433,682-203,535,301(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Nagase 等人(2000)通过对从大小分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,克隆了 RAPH1,并将其命名为 KIAA1681。推导的1,236个氨基酸的蛋白质与小鼠Grb10(601523)具有显着的相似性。RT-PCR ELISA 在所有成人和胎儿组织以及检查的特定脑区域(肺除外)中检测到 RAPH1 中度至高表达。最高表达是在大脑中。

通过筛选数据库中含有FPPPP基序的蛋白质,该基序结合Enabled(ENA;609061)/VASP(601703)同源1(EVH1)结构域,然后通过PCR,Krause等人(2004)克隆了全长RAPH1,他们将其命名为LPD。推导的 1,250 个氨基酸蛋白包含一个假定的 N 端卷曲螺旋基序、一个 Ras 关联结构域和一个 PH 结构域。C端一半富含脯氨酸,具有8个潜在的SH3结合位点、3个潜在的profilin(176610)结合位点和4个簇,总共包含6个FPPPP基序。数据库分析表明至少存在 1 个 LPD 剪接变体。对小鼠组织的 Northern 印迹分析检测到几种以组织特异性方式表达的转录物,其中在大脑、心脏、卵巢和发育中的胚胎中表达最高。Western blot分析确定Lpd的表观分子质量约为200 kD。

▼ 基因功能

Krause等人(2004)证实LPD在体外和体内结合VASP。这两种蛋白质共定位于几种人类和啮齿动物细胞的板状伪足和丝状伪足的尖端。LPD 被专门招募到致病性大肠杆菌与其肌动蛋白底座之间的界面以及牛痘病毒与其肌动蛋白尾部之间的界面。LPD 没有被招募到李斯特菌或志贺氏菌与其 F-肌动蛋白尾部之间的界面。LPD的PH结构域特异性结合磷脂酰肌醇3,4-二磷酸,将LPD的PH结构域靶向PDGF(见190040)处理的大鼠成纤维细胞中的褶边。LPD 过度表达增加了板状足突出速度,这是当 VASP 相关蛋白过度表达或人工靶向质膜时观察到的效应。相反,敲除 sLpd 表达会损害 s 黑色素瘤细胞中板状伪足的形成,降低残余板状伪足突出的速度,并降低 F-肌动蛋白含量。这些表型比单独的 VASP 丢失更为严重,导致 Krause 等人(2004)提出除了 VASP 之外,LPD 还调节肌动蛋白细胞骨架的其他效应器。

▼ 测绘

Nagase等(2000)通过辐射杂交分析将RAPH1基因定位到染色体2。

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