IK 细胞因子，HLA II 下调剂; IK

细胞因子IK
IK因子
RED

HGNC 批准的基因符号：IK

细胞遗传学定位：5q31.3 基因组坐标（GRCh38）：5:140,647,829-140,662,480（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

主要组织相容性 II 类抗原参与抗原呈递过程并调节免疫反应（Radka et al., 1986）。某些癌症的 HLA II 类表达缺失是逃避免疫识别的机制的原因。干扰素-γ（147570）可以诱导抗原呈递，某些细胞类型（例如 K562 细胞）会分泌抑制该过程的因子。Krief等人（1994）纯化了一种具有这种抑制活性的19-kD细胞因子，命名为IK因子。产生 IK 因子的抗体并用于筛选 K562 细胞 mRNA 的表达 cDNA 文库。分离出可识别多种细胞类型中 2.1 kb mRNA 的 cDNA，瞬时转染 COS 细胞产生预期的 19 kD 蛋白质。

Assier 等人（1999）确定 IK 是一个更大基因的一部分，他们将其称为 RED，编码一个 557 个氨基酸的蛋白质，该蛋白质与小鼠序列 98% 相同，并且包含大量的 arg-glu-asp （红色）重复。值得注意的是，RED 重复中的密码子使用是不同的，表明该序列不是重复复制的结果。RE重复序列存在于atropin-1（607462）中，RD重复序列存在于RD（154040）中。Northern 和斑点印迹分析揭示了 2.0-kb RED 转录本在人类和小鼠组织中普遍表达。蛋白质印迹分析表明，RED 在细菌和哺乳动物细胞中均以 80 kD 蛋白的形式表达。序列分析预测和免疫荧光分析表明，RED定位于核点，与PML小体的表达模式相似（见SP100；604585）；然而，RED并不与PML（102578）或coilin（COIL; 600272）并且似乎与核质隔离。

▼ 基因功能

Cao等（1997）采用半定量RT-PCR检测从脐带血中纯化的CD34（142230）阳性干细胞中的IK mRNA。IK 表达随着生长因子诱导的细胞分化而增加，随着 IK 反义处理而减少，并且与 HLA-DR 和 CD34 的表达呈负相关。集落形成测定表明，IK 反义处理减少了与 CD34 阳性干细胞分化的集落的大小和数量，特别是多系早期红系和粒单核祖细胞。

通过使用 2 个流感病毒聚合酶子单元作为诱饵，对人脾和胎儿脑 cDNA 文库进行酵母 2 杂交筛选，Fournier 等人（2014）确定 RED 是主要的相互作用子。RED 与病毒以及受感染细胞中的 SMU1（617811）相互作用。RED 的 N 末端结构域与病毒聚合酶子单元和 SMU1 相互作用，而 SMU1 仅与 RED 直接相互作用。蛋白质印迹和免疫荧光显微镜证实了两种蛋白的核表达。RED 或 SMU1 的敲低表明蛋白质在细胞内相互稳定，并且缺乏 RED 或 SMU1 会损害病毒 NS2 mRNA 的表达，降低 NS2/NS1 蛋白比率，并减少传染性流感病毒颗粒的产生。Fournier et al.（2014）得出结论，RED和SMU1剪接因子共同充当流感病毒基因表达的关键调节因子。

▼ 测绘

Krief等（1994）通过原位杂交将IK基因定位到染色体2p15-p14。然而，Assier等人（1999）利用辐射杂交分析确定这种定位是错误的，并将RED基因对应到染色体5q22-q23。Gross（2011）根据IK序列（GenBank BC013005）与基因组序列（GRCh37）的比对，将IK基因定位到染色体5q31.3。