血细胞比容/血红蛋白数量性状基因座 3; HCHGQ3

染色体 22 上的血细胞比容/血红蛋白数量性状位点

细胞遗传学定位:22q12-q13 基因组坐标(GRCh38):22:25,500,001-50,818,468

关于血细胞比容/血红蛋白数量性状位点遗传异质性的讨论,参见HCHGQ1(609319)。

▼ 测绘

Chambers 等人(2009)对 16,001 名欧洲和印度亚洲血统个体的血红蛋白水平进行了全基因组关联研究。关联性最密切的SNP rs855791导致染色体22q12-q13上TMPRSS6基因(609862)的丝氨酸蛋白酶结构域发生非同义缬氨酸736变为丙氨酸(V736A),血液血红蛋白浓度为0.13(95% CI, 0.09-0.17)等位基因A的每个拷贝降低g/dl(p = 1.6 x 10(-13))。

Benyamin et al.(2009)在一项对来自 2,277 个澳大利亚双胞胎家庭的 2,516 名青少年和 2,302 名成年个体进行的全基因组关联研究中,发现了 TMPRSS6 中的 SNP 与血清铁的关联(rs855791,组合 P = 1.5 x 10(-20)),转铁蛋白饱和度(组合 P = 2.2 x 10(-23))和红细胞平均细胞体积(MCV,组合 P = 1.1 x 10(-10))。他们还发现了与血液中血红蛋白水平相关的暗示性证据(综合p = 5.3 x 10(-7))。Benyamin 等人(2009)得出的结论是,他们的发现证明了 TMPRSS6 参与铁稳态的控制和正常红细胞生成。作者将rs855791代表的氨基酸取代称为A736V。

Van der Harst et al.(2012)对多达135,367个个体的血红蛋白浓度及相关参数进行了全基因组关联研究,鉴定出75个与一种或多种红细胞表型相关的孤立基因位点,p值小于10(-8) ),它们共同解释了每个性状 4% 到 9% 的表型变异。van der Harst et al.(2012)利用表达数量性状位点和生物信息学策略,鉴定了121个富含与红细胞生物学相关功能的候选基因。候选基因优先在红细胞前体细胞中表达,其中43个基因在小家鼠或果蝇中具有造血表型。通过开放染色质和编码变异分析,van der Harst 等人(2012)在 41 个位点鉴定出潜在的因果遗传变异。测量的参数包括血红蛋白、平均细胞血红蛋白、平均细胞血红蛋白浓度、平均细胞体积、压积细胞体积和红细胞计数。Van der Harst et al.(2012)发现SNP(rs855791)与平均细胞血红蛋白的关联(p = 1.0 x 10(-69))。他们还发现了 22q13 rs140522 上的一个 SNP 与平均细胞体积的关联(p = 4.5 x 10(-23))。

Galesloot et al.(2013)在一项对 1,832 名平均年龄为 62 岁的荷兰人进行 TMPRSS6 基因内 SNP 基因分型的人群研究中发现,G-to-A SNP(rs855791)具有最显着性。与铁和转铁蛋白饱和度的相关性(分别为p = 3.4 x 10(-12)和8.5 x 10(-14))。这种关联与血清铁调素(HAMP;606464)。然而,SNP 与铁调素与铁蛋白的比率以及铁调素与转铁蛋白的饱和度显着相关。该研究结果并不支持这样的假设:TMPRSS6 基因的变异通过影响铁调素表达来响应全身铁浓度,从而影响铁参数。

Tags: none