醛脱氢酶 18 家族,成员 A1

ALDH18A1 基因编码 δ-1-pyrroline-5-carboxylate synthetase(P5CS),它催化脯氨酸、鸟氨酸和精氨酸从头生物合成的前两个步骤。该酶具有双功能,分两步将谷氨酸转化为 P5C,依次由 L-谷氨酸 5-激酶(G5K) 和 L-谷氨酰-5-磷酸还原酶(G5PR) 结构域催化(Panza 等人总结,2016 年)。

▼ 克隆与表达

通过一种他们称为“数据库克隆”的方法,Aral 等人(1996)分离并测序了编码人类 P5CS 基因的 cDNA。

胡等人(1999)观察到哺乳动物 P5CS 经历可变剪接以产生 2 种亚型,不同之处仅在于在 γ-谷氨酰激酶活性位点的 N 末端插入 2 个氨基酸。短亚型在肠道中具有高活性,它参与精氨酸的生物合成并被鸟氨酸抑制。在多种组织中表达的长亚型是从谷氨酸合成脯氨酸所必需的,并且对鸟氨酸不敏感。

▼ 测绘

Jones(1975)提供了来自细胞杂交研究的证据,证明将谷氨酸转化为其 γ 半醛的酶的结构基因位于 10 号染色体上。谷氨酸-γ-半醛合成酶(GSAS) 和谷氨酸草酰乙酸转氨酶( 138180 ) 在由同一染色体上的基因决定的相同生化途径可能具有生物学意义(Jones,1975)。

通过荧光原位杂交,Liu 等人(1996)将 PYCS 基因对应到 10q24.3。

▼ 分子遗传学

Cutis Laxa,常染色体隐性遗传,IIIA 型

鲍姆加特纳等人(2000)在Rabier 等人描述的 2 个同胞中观察到 P5CS 错义突变的纯合性(1992)患有智力低下、关节过度活动、皮肤弹性过度、白内障和代谢异常,包括高氨血症、低脯氨酸血症、低瓜氨酸血症和低鸟氨酸血症(ARCL3A; 219150 )。arg84-to-gln 突变(R84Q; 138250.0001 ) 改变了 P5CS γ-谷氨酰激酶结构域中的一个保守残基,并显着降低了两种 P5CS 同种型在哺乳动物细胞中表达时的活性。此外,R84Q 似乎使长异构体不稳定。

Bicknell 等人在来自新西兰家庭的受影响个体中,患有智力迟钝、关节过度活动和皮肤松弛,但没有代谢异常(2008)鉴定了 ALDH18A1 基因(H784Y; 138250.0002 ) 中的纯合突变。体外功能表达研究表明,H784Y 突变蛋白保留了正常的 P5CS 活性并且不损害脯氨酸合成。研究结果表明,酶活性受损不能解释表型,正如Baumgartner 等人报道的患者所建议的那样(2000 年)。

斯基德莫尔等人(2011)报道了一个近亲结合出生的孩子,其特征与德巴西综合征(ARCL3A) 一致,在 ALDH18A1 基因( 138250.0003 ) 中存在纯合突变。

菲舍尔等人(2014)报告了另外 2 名德巴西综合征(ARCL3A) 患者,他们的 ALDH18A1 基因发生突变。一个是外显子 15( 138250.0004 )缺失的纯合子。由于 ALDH18A1( 138250.0005 )中单个核苷酸的缺失,另一名患者是移码纯合子。与对照成纤维细胞相比,两名患者的成纤维细胞的 mRNA 水平都严重降低。

在一名患有皮肤松弛、脂肪垫分布异常和视网膜病变的 2 岁男孩中,他的 ATP6V0A1( 611716 )、COG7( 606978 )、GORAB( 607983 ) 和 PYCR1 基因突变呈阴性,Wolthuis 等人(2014)进行了全外显子组测序并确​​定了 ALDH18A1 基因(Y780C; 138250.0016 ) 中错义突变的纯合性。

皮肤松弛,常染色体显性遗传 3

Fischer-Zirnsak 等人 在 8 名具有早衰症 de Barsy 样皮肤松弛表型(ADCL3; 616603 )的无关儿童中(2015)鉴定了 ALDH18A1 基因中 3 种不同错义突变的杂合性,均涉及高度保守的 arg138 残基(R138W、R138Q 和 R138L;138250.0013 - 138250.0015)。在所有 6 个可获得亲本 DNA 的家庭中,突变被证明是从头出现的。对患者成纤维细胞的研究表明,与野生型相比,R138W 突变蛋白具有改变的亚软骨分布和降低的酶活性。

痉挛性截瘫,常染色体显性遗传 9A

Coutelier 等人在 3 个具有常染色体显性痉挛性截瘫 9A(SPG9A; 601162 )的无关家族的受影响成员中(2015)鉴定了 ALDH18A1 基因中的杂合错义突变( 138250.0007 - 138250.0009 )。两名偶发性发病的患者在 ALDH18A1 中也携带杂合错义变异。这些突变是通过全外显子组或面板测序发现的,并与家族中的疾病分离。与对照组相比,来自具有 V120A 突变( 138250.0008 ) 的 1 个家族的 2 名患者的成纤维细胞显示脯氨酸生物合成的残余通量减少(42%),这与酶缺乏一致。未进行其他变体的功能研究。

潘萨等人(2016 年)在另外 2 个常染色体显性 SPG9A 家族( 138250.0006和138250.0007 )中发现了 ALDH18A1 基因的杂合错义突变。这些突变是通过候选基因测序发现的,并与家族中的疾病分离。体外功能表达分析表明,突变蛋白正常定位于线粒体,但 P5CS 和 G5K 酶活性较低;G5PR酶活性接近正常。色谱研究表明,突变扰乱了 P5CS 六聚体的结构,推测导致显性负效应。

痉挛性截瘫,常染色体隐性遗传 9B

在 2 个常染色体隐性遗传痉挛性截瘫 9B(SPG9B; 601162 ) 无关家族的受影响成员中, Coutelier 等人(2015)鉴定了 ALDH18A1 基因中的纯合或复合杂合错义突变( 138250.0010 - 138250.0012 )。通过全外显子组或面板测序发现突变。未进行变体的功能研究。

▼ 等位基因变体( 16 个示例):

.0001 CUTIS LAXA,常染色体隐性遗传,IIIA 型
ALDH18A1、ARG84GLN
鲍姆加特纳等人(2000 年)确定Rabier 等人报告的 2 个同胞(1992)患有智力低下、关节过度活动、皮肤松弛、白内障和代谢异常( 219150 ) 是 PYCS 基因的 251G-A 转换纯合子,导致 arg84-to-gln(R84Q) 替代。该突变损害了 PYCS 长亚型和短亚型的功能。

.0002 CUTIS LAXA,常染色体隐性遗传,IIIA 型
ALDH18A1、HIS784TYR
Bicknell 等人在 4 名受影响的同胞中,由近亲新西兰毛利人父母所生,患有智力低下、关节过度活动、皮肤松弛,但没有代谢异常( 219150 )(2008 年)在 ALDH18A1 基因的外显子 18 中鉴定出纯合 2350C-T 转换,导致 C 末端基序中的保守残基中的 his784 到酪氨酸(H784Y) 取代。体外功能表达研究表明,H784Y 突变蛋白保留了正常的 P5CS 活性并且不损害脯氨酸合成。研究结果表明,酶活性受损不能解释表型。

.0003 CUTIS LAXA,常染色体隐性遗传,IIIA 型
ALDH18A1,IVS14DS,GA,+1
Skidmore 等人在一名临床特征符合 de Barsy 综合征(ARCL3A; 219150) 的严重受累儿童中,该儿童由巴基斯坦血统的近亲父母所生(2011)报道了 ALDH18A1 基因外显子 14-内含子 14 边界(核苷酸 1923+1)处 G 到 A 转变的纯合性。该突变导致 2 个异常转录物被预测为编码缺乏酶催化位点的蛋白质。细胞表型的特征是 I 型(见120150)和 III 型胶原蛋白(见120180 )的产生减少),弹性蛋白超微结构改变,培养的真皮成纤维细胞的细胞增殖减少。孩子的皮肤松弛、起皱、薄,皮下血管扩张曲折、角膜混浊和张力减退。孩子还患有严重的全球发育迟缓和喂养困难,并在婴儿期因不明原因死亡。

.0004 CUTIS LAXA,常染色体隐性遗传,IIIA 型
ALDH18A1、1,522-BP DEL 和 1-BP INS
Fischer 等人在一名患有严重 de Barsy 综合征(ARCL3A; 219150 )的女性患者中,这是一对近亲突尼斯夫妇的第一个孩子(2014)鉴定了 ALDH18A1 基因中 1,522-bp 微缺失的纯合性,包括外显子 15 和侧翼内含子序列(chr10:97,373,623-97,372,101; GRCh37),以及鸟苷的插入。删除导致在 24 个额外密码子(Val601GlyfsTer24) 后具有预测的提前终止密码子的移码。

.0005 CUTIS LAXA,常染色体隐性遗传,IIIA 型
ALDH18A1,1-BP DEL,2131C
菲舍尔等人(2014)报道了一名患有严重德巴西综合征(ARCL3A; 219150) 的男性患者,其出生于一对近亲土耳其夫妇,他们是 ALDH18A1 基因外显子 17 中的单碱基对缺失 c.2131delC 的纯合子。这种改变导致了移码和在 3 个额外密码子(Leu711CysfsTer3) 后预测的翻译终止。

.0006 痉挛性截瘫 9A,常染色体显性遗传
ALDH18A1、VAL243LEU
在一个患有常染色体显性痉挛性截瘫 9A(SPG9A; 601162 )的意大利大家庭的受影响成员中,最初由Seri 等人报道(1999),Panza 等人(2016)鉴定了 ALDH18A1 基因中的杂合 c.727G-C 颠换,导致 G5K 结构域中高度保守残基处的 val243 到 leu(V243L) 取代。该突变是通过候选基因测序和外显子组测序的组合发现的,与家族中的疾病分离,在 dbSNP(build 142)、1000 Genomes Project、Exome Variant Server 或 ExAC 数据库中或在446 控制染色体。与对照相比,患者细胞的突变蛋白水平降低(约 45%),但突变蛋白正常定位于线粒体。体外功能表达测定表明,突变蛋白具有低 P5CD 和 G5K 酶活性,但保留了接近正常的 G5PR 酶活性。

.0007 痉挛性截瘫 9A,常染色体显性遗传
ALDH18A1、ARG252GLN
Coutelier 等人在患有痉挛性截瘫 9A(SPG9A; 601162 )的法国家庭(FSP470) 的受影响成员和患有散发性疾病的患者(患者 25014) 中(2015)鉴定了 ALDH18A1 基因中的杂合 c.755G-A 转换(c.755G-A, NM_002860.3),导致 arg252-to-gln(R252Q) 取代。单倍型分析排除了创始人效应。未进行变体的功能研究。

在具有常染色体显性 SPG9A 的英国家庭的受影响成员中,最初由Slavotinek 等人报道(1996),Panza 等人(2016)鉴定了 ALDH18A1 基因中 c.755G-A 转换的杂合性,导致 G5K 结构域中高度保守残基的 R252Q 取代。通过候选基因测序发现的突变与家族中的疾病分离,并且未在 dbSNP(build 142)、1000 Genomes Project、Exome Variant Server 或 ExAC 数据库或 446 个对照染色体中发现。体外功能表达分析表明,突变蛋白正常定位于线粒体,但 P5CS 和 G5K 酶活性较低;G5PR酶活性接近正常。色谱研究表明,该突变扰乱了 P5CS 六聚体的结构,可能导致显性负效应。

.0008 痉挛性截瘫 9A,常染色体显性遗传
ALDH18A1、VAL120ALA
Coutelier 等人在患有常染色体显性痉挛性截瘫 9A(SPG9A; 601162 )的家族成员(FSP410) 中(2015)鉴定了 ALDH18A1 基因中的杂合 c.359T-C 转换(c.359T-C, NM_002860.3),导致 G5K 结构域中高度保守的残基发生 val120 到 ala(V120A) 取代(Panza 等人,2016 年)。通过全外显子组或面板测序发现的突变与家族中的疾病分离,并且在 dbSNP(build 138)、Exome Variant Server 或 ExAC 数据库中未发现。与对照组相比,患者成纤维细胞显示脯氨酸生物合成的残余通量减少(42%),这与酶缺乏一致。

.0009 痉挛性截瘫 9A,常染色体显性遗传
ALDH18A1、ARG665LEU
在患有常染色体显性痉挛性截瘫 9A(SPG9A; 601162 )的法国家庭(FSP429) 的受影响成员中,Coutelier 等人(2015)鉴定了 ALDH18A1 基因中的杂合 c.1994G-T 颠换(c.1994G-T,NM_002860.3),导致 G5PR 结构域中高度保守的残基处出现 arg665 到亮氨酸(R665L)取代(Panza 等人,2016 年)。通过全外显子组或面板测序发现的突变与家族中的疾病分离,并且在 dbSNP(build 138)、Exome Variant Server 或 ExAC 数据库中未发现。未进行变体的功能研究。

.0010 痉挛性截瘫 9B,常染色体隐性遗传
ALDH18A1、ASP715HIS
Coutelier et al.在来自西班牙家庭(FSP856) 的 4 个常染色体隐性痉挛性截瘫 9B(SPG9B; 616586 ) 的同胞中(2015)鉴定了 ALDH18A1 基因中的纯合 c.2143G-C 颠换(c.2143G-C,NM_002860.3),导致在 G5PR 结构域中的一个保守残基处发生 asp715-to-his(D715H) 取代(Panza等人,2016 年)。通过全外显子组或面板测序发现的突变与家族中的疾病分离,并且在 dbSNP(build 138)或 Exome Variant Server 数据库中未发现;它在 ExAC 数据库中的出现频率非常低。未进行该变体的功能研究。

.0011 痉挛性截瘫 9B,常染色体隐性遗传
ALDH18A1、LEU637PRO
在来自葡萄牙家庭(SR45) 的 2 个常染色体隐性遗传性痉挛性截瘫 9B(SPG9B; 616586 ) 的兄弟中,Coutelier 等人(2015)鉴定了 ALDH18A1 基因中的复合杂合错义突变:c.1910T-C 转换(c.1910T-C, NM_002860.3),导致在G5PR 结构域和 c.383G-A 转换,导致 arg128-to-his(R128H; 138250.0012) 在 G5K 结构域中的保守残基处进行替换。在 dbSNP(build 138)或 Exome Variant Server 数据库中未发现通过全外显子组或面板测序发现的突变;在 ExAC 数据库中,L637P 也不存在,而有 1 个 R128H 变体的纯合子携带者。未进行变体的功能研究。

.0012 痉挛性截瘫 9B,常染色体隐性遗传
ALDH18A1、ARG128HIS
讨论 ALDH18A1 基因中的 c.383G-A 转换(c.383G-A,NM_002860.3),导致 arg128 到他(R128H)取代,在 2 个同胞的复合杂合状态下发现Coutelier 等人的常染色体隐性痉挛性截瘫 9B(SPG9B; 616586 )(2015),见138250.0011。

.0013 CUTIS LAXA,常染色体显性遗传 3
ALDH18A1、ARG138TRP
在 3 名具有早衰样 de Barsy 样皮肤松弛表型(ADCL3; 616603 ) 的无关儿童中,其中 1 名最初由Jukkola 等人报道(1998),Fischer-Zirnsak 等人(2015)鉴定了 ALDH18A1 基因中 c.412C-T 转换(c.412C-T,NM_002860.3)的杂合性,导致在 α-谷氨酰激酶结构域中高度保守的残基处发生 arg138-to-trp(R138W) 取代. 父母 DNA 分析表明,所有 3 名患者均发生了从头突变;对 2 名先证者附近 SNP 的仔细检查表明,突变发生在父系等位基因上。在 ExAC、Exome Variant Server 或 1000 Genomes Project 数据集中未发现该突变。患者成纤维细胞的功能分析表明,与野生型相比,R138W 突变体的亚软骨定位发生了改变,并且酶活性降低。

.0014 CUTIS LAXA,常染色体显性遗传 3
ALDH18A1、ARG138GLN
Fischer-Zirnsak 等人在 3 名具有早衰症 de Barsy 样皮肤松弛表型(ADCL3; 616603 )的无关儿童中(2015 年)确定了 ALDH18A1 基因中 c.413G-A 转换(c.413G-A,NM_002860.3)的杂合性,导致在 α-α-谷氨酰激酶结构域。对可用的 2 个家庭中的亲本 DNA 的分析表明,突变在两种情况下都是从头产生的。

.0015 CUTIS LAXA,常染色体显性遗传 3
ALDH18A1、ARG138LEU
Fischer-Zirnsak 等人在 2 名具有早衰症 de Barsy 样皮肤松弛表型(ADCL3; 616603 )的无关儿童中(2015 年)确定了 ALDH18A1 基因中 c.413G-T 颠换(c.413G-T,NM_002860.3)的杂合性,导致在 α-谷氨酰激酶结构域。对 1 个可用家族中的亲本 DNA 的分析表明,突变是从头产生的。

.0016 CUTIS LAXA,常染色体隐性遗传,IIIA 型
ALDH18A1、TYR780CYS
Wolthuis 等人在一名患有皮肤松弛症(ARCL3A; 219150 )的 2 岁男孩中,他也有异常的脂肪垫分布和视网膜病变(2014)确定了 ALDH18A1 基因外显子 18 中 c.2339T-C 转换的纯合性,导致 tyr780 到 cys(Y780C) 取代。无法获得他近亲父母的 DNA,但在 100 个种族匹配的对照、2,800 个内部外显子组或 Exome Variant Server 数据库中未发现该突变。