组蛋白基因簇 1,H1 组蛋白家族,成员 E

HIST1H1E 基因编码组蛋白 H1.4。在人类中,H1.4 是 11 个 H1 接头组蛋白之一,可介导高级染色质结构的形成,并调节调节蛋白、染色质重塑因子和组蛋白修饰酶对其靶位点的可及性(Tatton-Brown总结等人,2017 年)。

有关组蛋白、组蛋白基因簇和 H1 组蛋白家族的背景信息,请参阅 HIST1H1A( 142709 )。

▼ 克隆与表达

阿尔比格等人(1991)鉴定了一个编码组蛋白 H1 类成员的基因,并将其命名为 H1.4。

▼ 基因功能

有关 H1 组蛋白的功能信息,请参阅 HIST1H1A( 142709 )。

▼ 测绘

通过原位杂交,Tanguay 等人(1987)将组蛋白 H1.4 基因定位到染色体 12q11-q21。另一方面,Albig 等人(1993)将包括 H1.4 在内的 6 个 H1 基因定位到染色体 6p22.1-p21.1。通过分析 YAC 重叠群,Albig 等人(1997)将 H1.4 基因对应到染色体 6p21.3,在 35 个组蛋白基因簇内。

通过基因组序列分析,Marzluff 等人(2002)确定染色体 6p22-p21 上的组蛋白基因簇,他们称为组蛋白基因簇-1(HIST1),包含 55 个组蛋白基因,包括 HIST1H1E。

▼ 分子遗传学

在 5 名不相关的 Rahman 综合征患者(RMNS;617537 )中,Tatton-Brown 等人(2017)在 HIST1H1E 基因中发现了 3 个不同的杂合截断突变( 142220.0001 - 142220.0003)。通过全外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变在4个家族中重新发生;无法获得来自第五个家庭的父母 DNA。在 ExAC 数据库或包含 11,677 个外显子组的内部数据库中未发现这些突变。所有的突变都导致了在 C 末端结构域截短的类似蛋白质的产生,该蛋白质参与染色质结合和蛋白质-蛋白质相互作用。与野生型蛋白质相比,预计截短的蛋白质具有减少的净电荷,这使得它们在中和带负电荷的接头 DNA 方面可能不太有效。此外,C 末端的截断可能会阻碍 DNA 结合和蛋白质-蛋白质相互作用。这些患者是从 710 名智力障碍且身高和/或头围等​​于或大于 +2 SD 或“未指明的过度生长”的个体中确定的,他们接受了基因研究。未进行变体的功能研究和患者细胞的研究。

▼ 等位基因变体( 3 精选示例):

.0001 拉曼综合征
HIST1H1E,1-BP DUP,430G
Tatton-Brown 等人在 2名年龄分别为 13 岁和 9 岁的 Rahman 综合征(RMNS; 617537)无关患者(COG0405 和 COG1832)中(2017 年)在 HIST1H1E 基因中发现了一个从头杂合 1-bp 重复(c.430dupG,NM_005321),导致移码、提前终止和在 C 端结构域中产生截短的蛋白质。通过全外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变并未在 ExAC 数据库或包含 11,677 个外显子组的内部数据库中发现。

.0002 拉曼综合症
HIST1H1E,1-BP DUP,441C
Tatton-Brown 等人在 2名年龄分别为 16 岁和 4 岁的 Rahman 综合征(RMNS; 617537)无关患者(COG0412 和 COG0552)中(2017 年)在 HIST1H1E 基因中发现了一个杂合的 1-bp 重复(c.441dupC,NM_005321),导致移码、提前终止和在 C 末端结构域中产生截短的蛋白质。该突变是通过 Sanger 测序确认的全外显子组测序发现的,但在 ExAC 数据库或包含 11,677 个外显子组的内部数据库中未发现。突变发生在 1 名患者中;无法获得另一名患者的父母 DNA。

.0003 拉曼综合征
HIST1H1E,23-BP DEL,NT436
Tatton-Brown 等人对一名患有 Rahman 综合征(RMNS; 617537 )的 1.9 岁女孩(患者 COG1739)进行了研究(2017 年)在 HIST1H1E 基因中发现了一个从头杂合的 23 bp 缺失(c.436_458del23,NM_005321),导致移码、提前终止和在 C 端结构域中产生截短的蛋白质。通过全外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变并未在 ExAC 数据库或包含 11,677 个外显子组的内部数据库中发现。